红海束毛藻Ⅱ组内含子的鉴定及其剪接机理的研究
| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-11页 |
| 第1章 绪论 | 第11-20页 |
| ·概述 | 第11页 |
| ·研究进展 | 第11-18页 |
| ·Ⅱ组内含子的分布 | 第11-12页 |
| ·Ⅱ组内含子的结构和种类 | 第12-15页 |
| ·Ⅱ组内含子的剪接 | 第15-16页 |
| ·Ⅱ组内含子的移动性 | 第16-17页 |
| ·Ⅱ组内含子的起源和进化 | 第17页 |
| ·Ⅱ组内含子的应用 | 第17-18页 |
| ·本论文选题依据和意义 | 第18-19页 |
| ·本论文研究内容 | 第19-20页 |
| 第2章 实验材料和方法 | 第20-29页 |
| ·实验材料 | 第20-24页 |
| ·菌株 | 第20页 |
| ·载体和重组质粒 | 第20-21页 |
| ·实验仪器 | 第21页 |
| ·实验试剂 | 第21-24页 |
| ·实验方法 | 第24-29页 |
| ·序列分析和二级结构预测 | 第24页 |
| ·细菌的培养 | 第24页 |
| ·细菌的保存 | 第24页 |
| ·引物磷酸化 | 第24页 |
| ·限制性内切酶酶切反应 | 第24-25页 |
| ·琼脂糖凝胶回收 | 第25页 |
| ·连接反应 | 第25页 |
| ·电转化感受态细胞的制备 | 第25页 |
| ·电转化 | 第25-26页 |
| ·阳性克隆的筛选 | 第26页 |
| ·细菌质粒的制备 | 第26页 |
| ·细菌总RNA的制备 | 第26页 |
| ·核酸定量 | 第26-27页 |
| ·逆转录反应(RT) | 第27页 |
| ·聚合酶链式反应(RCR) | 第27页 |
| ·琼脂糖凝胶电泳 | 第27-29页 |
| 第3章 实验步骤和结果 | 第29-63页 |
| ·实验流程 | 第29页 |
| ·Ⅱ组内含子的鉴定和序列分析 | 第29-38页 |
| ·Ⅱ组内含子的鉴定 | 第29-31页 |
| ·Ⅱ组内含子的成对序列比对 | 第31-32页 |
| ·Ⅱ组内含子的多重序列比对 | 第32-35页 |
| ·Ⅱ组内含子插入位点的多重序列比对 | 第35页 |
| ·Ⅱ组内含子二级结构的预测 | 第35-36页 |
| ·Ⅱ组内含子编码成熟酶的成对序列比对 | 第36-37页 |
| ·Ⅱ组内含子编码成熟酶的多重序列比对 | 第37-38页 |
| ·重组质粒的构建和鉴定 | 第38-49页 |
| ·含Ⅱ组内含子编码序列重组质粒的构建和鉴定 | 第38-43页 |
| ·含成熟酶编码序列重组质粒的构建和鉴定 | 第43-49页 |
| ·重组质粒的转化和筛选 | 第49-50页 |
| ·pAM系列重组质粒的转化和筛选 | 第49-50页 |
| ·pD系列重组质粒的转化和筛选 | 第50页 |
| ·实验体系的重建 | 第50-52页 |
| ·成熟酶对Ⅱ组内含子剪接的作用 | 第52-63页 |
| ·Ⅱ组内含子编码的成熟酶对自身剪接的作用 | 第52-54页 |
| ·TerⅡ6编码的成熟酶对Ⅱ组内含子的作用 | 第54-55页 |
| ·TerⅡ7编码的成熟酶对Ⅱ组内含子的作用 | 第55-56页 |
| ·TerⅡ8编码的成熟酶对Ⅱ组内含子的作用 | 第56-57页 |
| ·TerⅡ10编码的成熟酶对Ⅱ组内含子的作用 | 第57-59页 |
| ·TerⅡ16编码的成熟酶对Ⅱ组内含子的作用 | 第59-60页 |
| ·TerⅡ18编码的成熟酶对Ⅱ组内含子的作用 | 第60-61页 |
| ·TerⅡ24编码的成熟酶对Ⅱ组内含子的作用 | 第61-63页 |
| 第4章 实验分析和讨论 | 第63-68页 |
| ·红海束毛藻基因组中Ⅱ组内含子的分布特征 | 第63-65页 |
| ·红海束毛藻基因组中富含Ⅱ组内含子 | 第63页 |
| ·Ⅱ组内含子分布于保守基因中 | 第63-64页 |
| ·多个Ⅱ组内含子共存于一个保守基因中 | 第64页 |
| ·Ⅱ组内含子和蛋白质内含子共存于一个保守基因中 | 第64-65页 |
| ·红海束毛藻基因组中Ⅱ组内含子的逆转座 | 第65-66页 |
| ·Ⅱ组内含子的同源性 | 第65页 |
| ·Ⅱ组内含子插入位点的多样性 | 第65页 |
| ·Ⅱ组内含子编码成熟酶的同源性 | 第65页 |
| ·红海束毛藻基因组中Ⅱ组内含子的逆转座 | 第65-66页 |
| ·Ⅱ组内含子编码成熟酶的交叉反应 | 第66-68页 |
| 第5章 实验结论 | 第68-70页 |
| ·实验结论 | 第68-69页 |
| ·实验创新点 | 第69页 |
| ·实验展望 | 第69-70页 |
| 参考文献 | 第70-75页 |
| 附录 | 第75-77页 |
| 附录1 | 第75-76页 |
| 附录2 | 第76-77页 |
| 攻读硕士研究生学位期间的研究成果 | 第77-78页 |
| 致谢 | 第78页 |