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红海束毛藻Ⅱ组内含子的鉴定及其剪接机理的研究

摘要第1-7页
ABSTRACT第7-11页
第1章 绪论第11-20页
   ·概述第11页
   ·研究进展第11-18页
     ·Ⅱ组内含子的分布第11-12页
     ·Ⅱ组内含子的结构和种类第12-15页
     ·Ⅱ组内含子的剪接第15-16页
     ·Ⅱ组内含子的移动性第16-17页
     ·Ⅱ组内含子的起源和进化第17页
     ·Ⅱ组内含子的应用第17-18页
   ·本论文选题依据和意义第18-19页
   ·本论文研究内容第19-20页
第2章 实验材料和方法第20-29页
   ·实验材料第20-24页
     ·菌株第20页
     ·载体和重组质粒第20-21页
     ·实验仪器第21页
     ·实验试剂第21-24页
   ·实验方法第24-29页
     ·序列分析和二级结构预测第24页
     ·细菌的培养第24页
     ·细菌的保存第24页
     ·引物磷酸化第24页
     ·限制性内切酶酶切反应第24-25页
     ·琼脂糖凝胶回收第25页
     ·连接反应第25页
     ·电转化感受态细胞的制备第25页
     ·电转化第25-26页
     ·阳性克隆的筛选第26页
     ·细菌质粒的制备第26页
     ·细菌总RNA的制备第26页
     ·核酸定量第26-27页
     ·逆转录反应(RT)第27页
     ·聚合酶链式反应(RCR)第27页
     ·琼脂糖凝胶电泳第27-29页
第3章 实验步骤和结果第29-63页
   ·实验流程第29页
   ·Ⅱ组内含子的鉴定和序列分析第29-38页
     ·Ⅱ组内含子的鉴定第29-31页
     ·Ⅱ组内含子的成对序列比对第31-32页
     ·Ⅱ组内含子的多重序列比对第32-35页
     ·Ⅱ组内含子插入位点的多重序列比对第35页
     ·Ⅱ组内含子二级结构的预测第35-36页
     ·Ⅱ组内含子编码成熟酶的成对序列比对第36-37页
     ·Ⅱ组内含子编码成熟酶的多重序列比对第37-38页
   ·重组质粒的构建和鉴定第38-49页
     ·含Ⅱ组内含子编码序列重组质粒的构建和鉴定第38-43页
     ·含成熟酶编码序列重组质粒的构建和鉴定第43-49页
   ·重组质粒的转化和筛选第49-50页
     ·pAM系列重组质粒的转化和筛选第49-50页
     ·pD系列重组质粒的转化和筛选第50页
   ·实验体系的重建第50-52页
   ·成熟酶对Ⅱ组内含子剪接的作用第52-63页
     ·Ⅱ组内含子编码的成熟酶对自身剪接的作用第52-54页
     ·TerⅡ6编码的成熟酶对Ⅱ组内含子的作用第54-55页
     ·TerⅡ7编码的成熟酶对Ⅱ组内含子的作用第55-56页
     ·TerⅡ8编码的成熟酶对Ⅱ组内含子的作用第56-57页
     ·TerⅡ10编码的成熟酶对Ⅱ组内含子的作用第57-59页
     ·TerⅡ16编码的成熟酶对Ⅱ组内含子的作用第59-60页
     ·TerⅡ18编码的成熟酶对Ⅱ组内含子的作用第60-61页
     ·TerⅡ24编码的成熟酶对Ⅱ组内含子的作用第61-63页
第4章 实验分析和讨论第63-68页
   ·红海束毛藻基因组中Ⅱ组内含子的分布特征第63-65页
     ·红海束毛藻基因组中富含Ⅱ组内含子第63页
     ·Ⅱ组内含子分布于保守基因中第63-64页
     ·多个Ⅱ组内含子共存于一个保守基因中第64页
     ·Ⅱ组内含子和蛋白质内含子共存于一个保守基因中第64-65页
   ·红海束毛藻基因组中Ⅱ组内含子的逆转座第65-66页
     ·Ⅱ组内含子的同源性第65页
     ·Ⅱ组内含子插入位点的多样性第65页
     ·Ⅱ组内含子编码成熟酶的同源性第65页
     ·红海束毛藻基因组中Ⅱ组内含子的逆转座第65-66页
   ·Ⅱ组内含子编码成熟酶的交叉反应第66-68页
第5章 实验结论第68-70页
   ·实验结论第68-69页
   ·实验创新点第69页
   ·实验展望第69-70页
参考文献第70-75页
附录第75-77页
 附录1第75-76页
 附录2第76-77页
攻读硕士研究生学位期间的研究成果第77-78页
致谢第78页

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