蛋白质二级结构的预测以及二级结构与三级结构之间关联的探讨
| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-12页 |
| 第一章 绪论 | 第12-23页 |
| ·引言 | 第12-18页 |
| ·国内外研究现状 | 第18-20页 |
| ·蛋白质结构数据库 | 第20-22页 |
| ·论文的研究内容和安排 | 第22-23页 |
| 第二章 理论预测算法 | 第23-31页 |
| ·4肽结构字的定义 | 第23-24页 |
| ·多样性增量结合二次判别法 | 第24-29页 |
| ·多样性量和多样性增量 | 第24-26页 |
| ·二次判别法及其推广式 | 第26-28页 |
| ·预测的后修正算法 | 第28-29页 |
| ·算法的检验和评估 | 第29-31页 |
| ·检验方法 | 第29-30页 |
| ·预测性能评估指标 | 第30-31页 |
| 第三章 CB513数据库的二级结构预测 | 第31-41页 |
| ·引言 | 第31-32页 |
| ·数据库以及二级结构的定义 | 第32页 |
| ·CB513数据库 | 第32页 |
| ·二级结构定义 | 第32页 |
| ·CB513数据库的4肽结构字 | 第32-34页 |
| ·参数的选取以及算法的实现 | 第34-37页 |
| ·片段长度的选取 | 第34-36页 |
| ·TPIDQD算法的实现 | 第36-37页 |
| ·计算结果以及讨论 | 第37-40页 |
| ·总结 | 第40-41页 |
| 第四章 1645个蛋白数据库的二级结构预测 | 第41-53页 |
| ·数据库以及二级结构的定义 | 第41页 |
| ·1645个蛋白数据库的4肽结构字 | 第41-43页 |
| ·1645个蛋白的预测结果及讨论 | 第43-46页 |
| ·短片段中心残基的预测 | 第43-45页 |
| ·长片段中心残基的预测 | 第45-46页 |
| ·结构字的讨论 | 第46-51页 |
| ·两库中4肽结构字的对比 | 第46-47页 |
| ·合并两库中的4肽结构字 | 第47-48页 |
| ·用合并后的4肽结构字做预测 | 第48-51页 |
| ·总结 | 第51-53页 |
| 第五章 蛋白质二级结构与三级结构之间关联的探讨 | 第53-61页 |
| ·引言 | 第53页 |
| ·资料来源与背景 | 第53-54页 |
| ·两个蛋白之间距离的定义 | 第54-55页 |
| ·结果与讨论 | 第55-60页 |
| ·总结 | 第60-61页 |
| 第六章 总结与展望 | 第61-64页 |
| ·本文工作总结 | 第61-62页 |
| ·工作展望 | 第62-64页 |
| 参考文献 | 第64-72页 |
| 附录 | 第72-80页 |
| 致谢 | 第80-81页 |
| 攻读硕博连读学位期间发表和完成的论文目录 | 第81页 |
