蛋白质在聚乙烯界面吸附的分子动力学模拟
| 摘要 | 第1-4页 |
| ABSTRACT | 第4-8页 |
| 第一章 文献综述 | 第8-24页 |
| ·蛋白质的结构 | 第8-12页 |
| ·蛋白质结构的基本特征 | 第8-10页 |
| ·α-螺旋和β-折叠 | 第10-11页 |
| ·影响蛋白质结构的因素 | 第11-12页 |
| ·蛋白质的吸附 | 第12-18页 |
| ·蛋白质吸附现象及模型 | 第12-15页 |
| ·影响蛋白质吸附的因素 | 第15-17页 |
| ·蛋白质吸附的研究意义 | 第17-18页 |
| ·蛋白质吸附的分子动力学模拟 | 第18-23页 |
| ·分子动力学模拟软件 | 第19-20页 |
| ·分子动力学模拟在蛋白质吸附研究中的应用 | 第20-23页 |
| ·本论文的研究内容和意义 | 第23-24页 |
| 第二章 分子动力学相关理论与算法 | 第24-35页 |
| ·基本原理 | 第24页 |
| ·积分方法 | 第24-25页 |
| ·分子力场 | 第25-27页 |
| ·蛋白质的预处理 | 第27页 |
| ·模拟体系的初始化 | 第27-29页 |
| ·能量优化 | 第28页 |
| ·初始速度 | 第28-29页 |
| ·周期性边界条件 | 第29-30页 |
| ·系综与温度控制 | 第30-32页 |
| ·分子动力学模拟的系综 | 第30-31页 |
| ·温度控制 | 第31-32页 |
| ·非键相互作用能的处理 | 第32-35页 |
| ·截断值法 | 第32-33页 |
| ·周期性边界条件法 | 第33-34页 |
| ·其它算法 | 第34-35页 |
| 第三章 蛋白质在聚乙烯表面上的分子动力学模拟 | 第35-44页 |
| ·模拟体系的建立 | 第35-41页 |
| ·蛋白质 | 第35-37页 |
| ·聚乙烯界面 | 第37-38页 |
| ·水分子模型 | 第38-39页 |
| ·模拟体系 | 第39-41页 |
| ·动力学参数的选择 | 第41-42页 |
| ·模拟结果的分析 | 第42-44页 |
| ·RMSD分析 | 第42页 |
| ·二面角分析 | 第42-43页 |
| ·作用能分析 | 第43-44页 |
| 第四章 结果与讨论 | 第44-65页 |
| ·聚十赖氨酸在聚乙烯界面上的吸附 | 第44-57页 |
| ·侧链电荷的影响 | 第46-48页 |
| ·界面条件的影响 | 第48-50页 |
| ·不同水分子模型的影响 | 第50-54页 |
| ·不同力场条件下的吸附 | 第54-56页 |
| ·多肽和吸附界面间距离的影响 | 第56-57页 |
| ·牛胰蛋白酶抑制剂在聚乙烯界面上的吸附 | 第57-61页 |
| ·人体溶菌酶在聚乙烯界面上的吸附 | 第61-65页 |
| 第五章 结论 | 第65-66页 |
| 参考文献 | 第66-72页 |
| 发表论文和参加科研情况说明 | 第72-73页 |
| 致谢 | 第73页 |
