| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-11页 |
| 1 引言 | 第11-14页 |
| ·黑色素生成与毛色 | 第11页 |
| ·酪氨酸相关蛋白1 的研究现状 | 第11-12页 |
| ·TYRP1 简介 | 第11-12页 |
| ·TYRP1 生物学功能 | 第12页 |
| ·TYRP1 基因序列 | 第12页 |
| ·TYRP1 与毛色 | 第12页 |
| ·本研究的目的、意义及主要内容 | 第12-14页 |
| ·研究的目的和意义 | 第12-13页 |
| ·研究的主要内容 | 第13-14页 |
| 2 材料与方法 | 第14-23页 |
| ·试验器材 | 第14-17页 |
| ·生物信息分析用到不同物种序列 | 第14-15页 |
| ·试验山羊样品来源及采样方法 | 第15页 |
| ·主要仪器设备 | 第15-16页 |
| ·溶液试剂配制 | 第16-17页 |
| ·主要分子生物学软件 | 第17页 |
| ·主要试验方法和步骤 | 第17-23页 |
| ·不同物种间的TYRP1 基因序列分析 | 第17页 |
| ·山羊DNA 的提取 | 第17-19页 |
| ·DNA 提取流程 | 第17-18页 |
| ·DNA 浓度和纯度的测定 | 第18-19页 |
| ·琼脂糖凝胶电泳检测 | 第19页 |
| ·提取DNA 过程中的注意事项 | 第19页 |
| ·TYRP1 基因PCR 引物的设计与合成 | 第19-21页 |
| ·引物的设计 | 第19-20页 |
| ·最佳PCR 条件的建立 | 第20-21页 |
| ·TYRP1 基因PCR 产物的测序与分析 | 第21页 |
| ·山羊 TYRP1 基因序列结构分析 | 第21-22页 |
| ·TYRP1 基因SNP 位点基因型鉴定 | 第22页 |
| ·山羊 TYRP1 基因 SNP 位点的群体分析 | 第22-23页 |
| 3 结果与分析 | 第23-39页 |
| ·生物信息学分析 | 第23-28页 |
| ·不同物种 TYRP1 基因CDS 序列变异特征 | 第23页 |
| ·不同物种TYRP1 基因CDS 序列的多态位点变异 | 第23-24页 |
| ·TYRP1 基因的调控元件 | 第24-25页 |
| ·TYRP1 氨基酸序列的保守与变异 | 第25-26页 |
| ·TYRP1 氨基酸序列的理化性质 | 第26页 |
| ·TYRP1 氨基酸序列二级结构 | 第26-27页 |
| ·TYRP1 氨基酸序列的基序 | 第27页 |
| ·TYRP1 氨基酸序列的疏水性和结构域预测 | 第27-28页 |
| ·羊样品基因组DNA 的提取结果 | 第28-29页 |
| ·山羊TYRP1 基因序列的获得与分析 | 第29-34页 |
| ·山羊TYRP1 基因从5’端启动子区到外显子8 的PCR 扩增结果 | 第29-31页 |
| ·山羊TYRP1 基因序列 | 第31-34页 |
| ·测序结果比对确认、拼接和序列提交 | 第31页 |
| ·山羊TYRP1 基因结构 | 第31-33页 |
| ·山羊 TYRP1 基因调控序列分析 | 第33页 |
| ·山羊TYRP1 蛋白序列结构 | 第33-34页 |
| ·山羊TYRP1 基因内含子1 中的变异位点g.1264A>C | 第34-36页 |
| ·g.1264A>C 的扩增和酶切结果 | 第34页 |
| ·g.1263A>C 在不同群体间的分布 | 第34-35页 |
| ·g.1263A>C 的遗传多样性及在群体间的遗传分化 | 第35-36页 |
| ·山羊TYRP1 基因外显子2 中的多态位点g.1428C>T | 第36-37页 |
| ·g.1428C>T 的扩增和酶切结果 | 第36页 |
| ·g.1429C>T 在不同群体间的分布 | 第36-37页 |
| ·g.1428C>T 的遗传多样性及在群体间的遗传分化 | 第37页 |
| ·g.1263A>C 和g.1428C>T 在不同群体中的单倍型分布 | 第37-39页 |
| 4 讨论 | 第39-43页 |
| ·不同物种TYRP1 基因生物信息学分析 | 第39-40页 |
| ·TYRP1 基因 CDS 序列的长度变异 | 第39页 |
| ·TYRP1 核苷酸及氨基酸序列变异 | 第39-40页 |
| ·TYRP1 基因顺式调控元件分析 | 第40页 |
| ·TYRP1 蛋白质结构、功能分析 | 第40页 |
| ·DNA 的提取 | 第40页 |
| ·PCR 的扩增 | 第40-41页 |
| ·山羊TYRP1 基因变异位点 | 第41页 |
| ·g.1263A>C 和g.1428C>T 在不同山羊群体中的遗传多样性及遗传分化 | 第41-43页 |
| 5 结论 | 第43-44页 |
| 参考文献 | 第44-48页 |
| 在读期间发表的论文 | 第48-50页 |
| 作者简历 | 第50-52页 |
| 致谢 | 第52-53页 |
