| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 英文缩略表 | 第10-11页 |
| 1 前言 | 第11-23页 |
| ·棉花概述 | 第11-12页 |
| ·棉纤维的发育过程 | 第12-13页 |
| ·棉纤维发育的分子生物学研究进展 | 第13-17页 |
| ·棉纤维分化起始的调控 | 第13-14页 |
| ·棉纤维伸长期基因的表达调控 | 第14-16页 |
| ·棉纤维次生壁加厚期基因的表达调控 | 第16-17页 |
| ·棉纤维脱水成熟期的研究 | 第17页 |
| ·基因工程改良棉纤维品质研究进展 | 第17-20页 |
| ·增加纤维长度和强度的纤维改良工程 | 第18-19页 |
| ·增强纤维保暖性 | 第19-20页 |
| ·彩色棉的基因工程 | 第20页 |
| ·差异表达基因的研究进展 | 第20-21页 |
| ·差异表达基因概述 | 第20页 |
| ·筛选差异表达基因的方法 | 第20-21页 |
| ·Solexa表达谱特点 | 第21页 |
| ·本研究的目的及意义 | 第21-23页 |
| 2 材料与方法 | 第23-31页 |
| ·试验材料 | 第23-24页 |
| ·试验群体的构建 | 第23-24页 |
| ·材料种植及棉纤维的取材 | 第24页 |
| ·棉纤维总RNA的提取 | 第24-26页 |
| ·实验器具的处理 | 第24页 |
| ·RNA提取液的配制 | 第24-25页 |
| ·RNA提取步骤 | 第25-26页 |
| ·反转录和荧光定量PCR试验 | 第26-27页 |
| ·cDNA第一条链的合成 | 第26页 |
| ·荧光定量PCR | 第26-27页 |
| ·Tag的制备及测序 | 第27-28页 |
| ·测序数据分析 | 第28-31页 |
| ·数据的处理及标准化 | 第28-29页 |
| ·Tag的基因注释和差异基因的筛选 | 第29页 |
| ·Tag的基因注释 | 第29页 |
| ·差异表达基因的筛选 | 第29页 |
| ·Gene Ontology功能显著性富集分析 | 第29-30页 |
| ·差异基因表达模式聚类分析和Pathway显著性富集分析 | 第30-31页 |
| 3 结果与分析 | 第31-57页 |
| ·RNA提取质量检测 | 第31-32页 |
| ·测序质量评估 | 第32-57页 |
| ·Tag整体质量评估 | 第32页 |
| ·CleanTag拷贝数分布统计 | 第32-36页 |
| ·Tag的基因注释 | 第36-38页 |
| ·差异表达基因的筛选 | 第38-41页 |
| ·表达模式聚类分析 | 第41页 |
| ·Gene Ontology功能显著性富集分析 | 第41-44页 |
| ·Pathway显著性富集分析 | 第44-52页 |
| ·荧光定量PCR验证纤维发育伸长期和次生壁加厚期差异表达的基因 | 第52-57页 |
| 4 讨论 | 第57-63页 |
| ·棉花不同组织RNA提取的探讨 | 第57-58页 |
| ·用EST和Unigene做比对库的比较 | 第58-59页 |
| ·棉纤维伸长期和次生壁加厚期基因表达的情况 | 第59页 |
| ·纤维发育伸长期和次生壁加厚期基因表达的差异 | 第59-60页 |
| ·高纤维强度和低纤维强度材料纤维发育次生壁加厚期差异基因及代谢过程 | 第60-61页 |
| ·棉纤维超微结构及棉铃发育时间长短对棉纤维强度的影响 | 第61-62页 |
| ·荧光定量与Solexa测序结果的比较 | 第62页 |
| ·本研究的不足以及进一步研究的思路 | 第62-63页 |
| 5 全文结论 | 第63-64页 |
| 参考文献 | 第64-71页 |
| 致谢 | 第71页 |
