| 摘要 | 第8-9页 |
| 英文摘要 | 第9-10页 |
| 1 前言 | 第11-18页 |
| 1.1 立题背景 | 第11页 |
| 1.2 肠道菌群的概述 | 第11-12页 |
| 1.3 饮食与肠道菌群 | 第12-15页 |
| 1.3.1 饮食概述 | 第12-13页 |
| 1.3.2 饮食类型与肠道菌群关系的研究进展 | 第13-14页 |
| 1.3.3 高通量在饮食与肠道菌群关系研究中的应用 | 第14-15页 |
| 1.4 短链脂肪酸概述 | 第15-16页 |
| 1.4.1 短链脂肪酸的生成及途径 | 第15页 |
| 1.4.2 饮食对短链脂肪酸生成的影响 | 第15-16页 |
| 1.4.3 短链脂肪酸对机体的作用 | 第16页 |
| 1.5 本课题的目的和意义 | 第16-17页 |
| 1.6 本试验拟采用的技术路线图 | 第17-18页 |
| 2 材料与方法 | 第18-22页 |
| 2.1 试验材料 | 第18-19页 |
| 2.1.1 研究对象 | 第18页 |
| 2.1.2 试验试剂 | 第18-19页 |
| 2.1.3 仪器与设备 | 第19页 |
| 2.2 试验方法 | 第19-21页 |
| 2.2.1 粪便总DNA的提取 | 第19-20页 |
| 2.2.2 PCR扩增 | 第20页 |
| 2.2.3 文库构建和上机测序 | 第20页 |
| 2.2.4 生物学信息分析 | 第20页 |
| 2.2.5 粪便中乳酸及短链脂肪酸的高效液相色谱法测定 | 第20-21页 |
| 2.3 数据统计 | 第21-22页 |
| 3 结果与分析 | 第22-41页 |
| 3.1 16 SrRNA可变区域V3-V4扩增结果 | 第22-23页 |
| 3.2 丰富度和多样性分析 | 第23-28页 |
| 3.2.1 OTU分析及物种注释结果 | 第23-24页 |
| 3.2.2 样品复杂程度分析 | 第24-28页 |
| 3.3 生物信息分类学分析 | 第28-32页 |
| 3.3.1 基于OTU的Venn图 | 第28-29页 |
| 3.3.2 不同饮食方式肠道菌群在门水平的分析 | 第29-30页 |
| 3.3.3 不同饮食方式肠道菌群在科水平的分析 | 第30-31页 |
| 3.3.4 不同饮食模式肠道菌群在属水平的分析 | 第31-32页 |
| 3.4 不同饮食方式肠道菌群的差异性分析 | 第32-35页 |
| 3.4.1 通过ANOVA检验方法进行组间差异物种分析 | 第32-33页 |
| 3.4.2 通过LEfSe检验方法进行组间差异物种分析 | 第33-35页 |
| 3.5 不同饮食方式肠道菌群结构及相似度比较分析 | 第35-37页 |
| 3.5.1 不同饮食方式肠道菌群PCA分析 | 第35-36页 |
| 3.5.2 不同饮食方式肠道菌群UPGMA聚类树分析 | 第36-37页 |
| 3.6 不同饮食方式粪便中乳酸及短链脂肪酸的分析 | 第37-41页 |
| 3.6.1 乳酸及短链脂肪酸标准曲线回归方程的建立 | 第37页 |
| 3.6.2 不同饮食方式粪便中乳酸和短链脂肪酸含量分析 | 第37-38页 |
| 3.6.3 Spearman环境关联因子分析 | 第38-41页 |
| 4 讨论 | 第41-46页 |
| 4.1 不同饮食方式肠道菌群结构的差异性分析 | 第41-43页 |
| 4.1.1 不同饮食方式肠道菌群多样性及丰富度差异性分析 | 第41页 |
| 4.1.2 不同饮食方式肠道菌群差异性物种分析 | 第41-43页 |
| 4.1.3 不同饮食方式的肠道菌群结构相似性分析 | 第43页 |
| 4.2 不同饮食方式与乳酸及短链脂肪酸的分析 | 第43-46页 |
| 5 结论 | 第46-47页 |
| 致谢 | 第47-48页 |
| 参考文献 | 第48-58页 |
| 附录 | 第58-59页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第59页 |
