| 内容摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 缩略词表 | 第11-17页 |
| 第一章 文献综述 | 第17-39页 |
| 1.1 Fe-S簇的结构和功能 | 第17-20页 |
| 1.1.1 Fe-S簇的结构 | 第17-18页 |
| 1.1.2 Fe-S簇的功能 | 第18-20页 |
| 1.2 原核生物Fe-S簇的生物合成 | 第20-26页 |
| 1.2.1 ISC系统 | 第21-23页 |
| 1.2.2 SUF系统 | 第23-24页 |
| 1.2.3 E.coli中最新发现的CSD途径 | 第24-25页 |
| 1.2.4 Fe-S簇输出阶段 | 第25-26页 |
| 1.3 真核生物Fe-S簇的生物合成 | 第26-32页 |
| 1.3.1 线粒体ISC系统 | 第27-29页 |
| 1.3.2 质体SUF途径 | 第29-31页 |
| 1.3.3 细胞质CIA途径 | 第31-32页 |
| 1.4 Fe-S簇生物合成的调控 | 第32-36页 |
| 1.4.1 IscR与Fe-S簇生物合成 | 第32-33页 |
| 1.4.2 SufR与Fe-S簇生物合成 | 第33-34页 |
| 1.4.3 氧化胁迫与Fe-S簇生物合成 | 第34-35页 |
| 1.4.4 铁限制与Fe-S簇生物合成 | 第35-36页 |
| 1.5 蓝藻铁硫簇研究进展 | 第36-37页 |
| 1.6 立题依据和研究方法、内容及意义 | 第37-39页 |
| 第二章 集胞藻PCC 6803 suf操纵子的转录调控研究 | 第39-58页 |
| 2.1 前言 | 第39-40页 |
| 2.2 材料与方法 | 第40-47页 |
| 2.2.1 藻株、培养条件和基本测定方法 | 第40页 |
| 2.2.2 集胞藻PCC 6803 gDNA提取 | 第40-41页 |
| 2.2.3 RNA的提取和RT-PCR | 第41-42页 |
| 2.2.4 sufR敲除质粒的构建 | 第42-43页 |
| 2.2.5 sufR超表达质粒的构建 | 第43-44页 |
| 2.2.6 蓝藻的转化 | 第44-45页 |
| 2.2.7 Western blot | 第45-47页 |
| 2.3 结果 | 第47-56页 |
| 2.3.1 集胞藻PCC 6803基因组中的suf操纵子的转录模式 | 第47-49页 |
| 2.3.2 SufR、IscR、Fur和OxyR序列比对 | 第49-50页 |
| 2.3.3 sufR敲除表型 | 第50-51页 |
| 2.3.4 sufR超表达表型 | 第51-52页 |
| 2.3.5 WT、ΔsufR和sufR-OE中sufBCD的表达量 | 第52-53页 |
| 2.3.6 WT中suf操纵子在氧化胁迫和缺铁处理下的转录变化 | 第53-54页 |
| 2.3.7 sufBCD在缺铁处理下的表达变化 | 第54页 |
| 2.3.8 SUF系统在不同类型的光合生物中的分布 | 第54-56页 |
| 2.3.9 SufR在光合生物中的分布 | 第56页 |
| 2.4 讨论 | 第56-58页 |
| 第三章 SUF系统在集胞藻PCC 6803自养和异养生长中的作用 | 第58-76页 |
| 3.1 前言 | 第58-59页 |
| 3.2 材料方法 | 第59-64页 |
| 3.2.1 藻株、培养条件和基本测定方法 | 第59页 |
| 3.2.2 PpetE-sufB质粒构建 | 第59页 |
| 3.2.3 PpetE-sufB( SUF Knockdown)藻株构建 | 第59-60页 |
| 3.2.4 叶绿素荧光测定 | 第60页 |
| 3.2.5 光合放氧和暗呼吸的测定 | 第60页 |
| 3.2.6 RNA提取和RT-PCR | 第60页 |
| 3.2.7 Western blot | 第60-64页 |
| 3.3 结果 | 第64-74页 |
| 3.3.1 suf基因敲除致死 | 第64页 |
| 3.3.2 构建PpetE-sufB藻株 | 第64-65页 |
| 3.3.3 Cu~(2+)浓度筛选 | 第65-66页 |
| 3.3.4 12 nM Cu~(2+)培养藻株中SufBCD的含量 | 第66-67页 |
| 3.3.5 SUF敲降对集胞藻PCC 6803自养和异养生长的影响 | 第67-69页 |
| 3.3.6 SUF敲降对DI、PetC和PsaC蛋白含量的影响 | 第69-70页 |
| 3.3.7 P700~(+)还原动力学 | 第70-71页 |
| 3.3.8 suf操纵子在自养和异养条件下的转录分析 | 第71-72页 |
| 3.3.9 其他相关基因在自养和异养条件下的转录分析 | 第72-74页 |
| 3.4 讨论 | 第74-76页 |
| 第四章 SUF系统对集胞藻PCC 6803铁吸收的影响 | 第76-96页 |
| 4.1 前言 | 第76-77页 |
| 4.2 材料方法 | 第77-82页 |
| 4.2.1 藻株、培养条件和基本测定方法 | 第77页 |
| 4.2.2 SUF-OE质粒构建 | 第77页 |
| 4.2.3 SUF-OE藻株构建 | 第77-78页 |
| 4.2.4 数字基因表达谱测序 | 第78-80页 |
| 4.2.5 RNA提取和RT-PCR | 第80页 |
| 4.2.6 Western blot | 第80-82页 |
| 4.3 结果 | 第82-93页 |
| 4.3.1 WT和PpetE-sufB缺铜处理 | 第82页 |
| 4.3.2 转录组测序结果 | 第82-89页 |
| 4.3.3 WT和SUF-OE中SufBCD的含量 | 第89-90页 |
| 4.3.4 WT和SUF-OE的表型 | 第90-91页 |
| 4.3.5 WT、SUF-KD和SUF-OE中铁相关基因的转录 | 第91-92页 |
| 4.3.6 WT、SUF-KD和SUF-OE胞内铁含量 | 第92页 |
| 4.3.7 suf操纵子在WT和exbB-exbD双突变中的转录表达 | 第92-93页 |
| 4.4 讨论 | 第93-96页 |
| 第五章 集胞藻PCC 6803 SUF系统组装机制探究 | 第96-112页 |
| 5.1 前言 | 第96-97页 |
| 5.2 材料与方法 | 第97-103页 |
| 5.2.1 酵母双杂质粒的构建 | 第97-98页 |
| 5.2.2 酵母双杂交 | 第98页 |
| 5.2.3 表达SufD蛋白质粒构建 | 第98-99页 |
| 5.2.4 蛋白原核表达和蛋白纯化 | 第99-100页 |
| 5.2.5 体外pull-down | 第100-103页 |
| 5.3 结果 | 第103-110页 |
| 5.3.1 SUF系统的工作机制 | 第103页 |
| 5.3.2 脱辅基蛋白与支架蛋白互作分析 | 第103-106页 |
| 5.3.3 Fe-S簇生物合成中铁供体的寻找 | 第106-110页 |
| 5.4 讨论 | 第110-112页 |
| 本研究论文的创新点 | 第112-113页 |
| 参考文献 | 第113-128页 |
| 在读期间发表的论文 | 第128-129页 |
| 致谢 | 第129-131页 |
