摘要 | 第3-4页 |
Abstract | 第4-5页 |
常用缩略词 | 第6-9页 |
1 前言 | 第9-18页 |
1.1 沙门菌耐药机制 | 第9-10页 |
1.2 代谢组学研究进展 | 第10-14页 |
1.2.1 代谢组学分类 | 第11-12页 |
1.2.2 代谢组学常用研究方法 | 第12-14页 |
1.3 耐药细菌代谢组学研究进展 | 第14-15页 |
1.4 生物信息学在代谢组学中的应用 | 第15-18页 |
2 材料和方法 | 第18-24页 |
2.1 材料 | 第18-20页 |
2.1.1 菌株 | 第18-19页 |
2.1.2 培养基及主要试剂 | 第19页 |
2.1.3 常用试剂的配制 | 第19-20页 |
2.1.4 主要仪器设备 | 第20页 |
2.2 沙门菌代谢组学的研究 | 第20-24页 |
2.2.1 菌株的复苏 | 第20页 |
2.2.2 菌株生长曲线绘制 | 第20-21页 |
2.2.3 气相色谱质谱联用(GC-MS)样品处理方法 | 第21-22页 |
2.2.4 气相色谱质谱联用(GC-MS)数据提取方法 | 第22-23页 |
2.2.5 气相色谱质谱联用(GC-MS)数据统计分析方法 | 第23-24页 |
3 结果与分析 | 第24-64页 |
3.1 生长曲线绘制 | 第24-27页 |
3.2 代谢物概况及整体PCA模型建立 | 第27-32页 |
3.3 菌株A与菌株J在 4h时间点代谢差异分析 | 第32-40页 |
3.3.1 PCA及OPLS-DA模型的建立 | 第32-34页 |
3.3.2 差异代谢物变化情况 | 第34-37页 |
3.3.3 差异代谢物通路富集分析 | 第37-40页 |
3.4 菌株A与菌株J在 20h时间点代谢差异分析 | 第40-48页 |
3.4.1 PCA及OPLS-DA模型的建立 | 第40-42页 |
3.4.2 差异代谢物变化情况 | 第42-45页 |
3.4.3 差异代谢物通路富集分析 | 第45-48页 |
3.5 菌株J与菌株R在 4h时间点代谢差异分析 | 第48-56页 |
3.5.1 PCA及OPLS-DA模型的建立 | 第48-50页 |
3.5.2 差异代谢物变化情况 | 第50-53页 |
3.5.3 差异代谢物通路富集分析 | 第53-56页 |
3.6 菌株J与菌株R在 20h时间点代谢差异分析 | 第56-64页 |
3.6.1 PCA及OPLS-DA模型的建立 | 第56-58页 |
3.6.2 差异代谢物变化情况 | 第58-61页 |
3.6.3 差异代谢物通路富集分析 | 第61-64页 |
4 讨论 | 第64-67页 |
全文结论 | 第67-68页 |
致谢 | 第68-69页 |
参考文献 | 第69-70页 |