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携带耐药质粒沙门菌的代谢组学的初步研究

摘要第3-4页
Abstract第4-5页
常用缩略词第6-9页
1 前言第9-18页
    1.1 沙门菌耐药机制第9-10页
    1.2 代谢组学研究进展第10-14页
        1.2.1 代谢组学分类第11-12页
        1.2.2 代谢组学常用研究方法第12-14页
    1.3 耐药细菌代谢组学研究进展第14-15页
    1.4 生物信息学在代谢组学中的应用第15-18页
2 材料和方法第18-24页
    2.1 材料第18-20页
        2.1.1 菌株第18-19页
        2.1.2 培养基及主要试剂第19页
        2.1.3 常用试剂的配制第19-20页
        2.1.4 主要仪器设备第20页
    2.2 沙门菌代谢组学的研究第20-24页
        2.2.1 菌株的复苏第20页
        2.2.2 菌株生长曲线绘制第20-21页
        2.2.3 气相色谱质谱联用(GC-MS)样品处理方法第21-22页
        2.2.4 气相色谱质谱联用(GC-MS)数据提取方法第22-23页
        2.2.5 气相色谱质谱联用(GC-MS)数据统计分析方法第23-24页
3 结果与分析第24-64页
    3.1 生长曲线绘制第24-27页
    3.2 代谢物概况及整体PCA模型建立第27-32页
    3.3 菌株A与菌株J在 4h时间点代谢差异分析第32-40页
        3.3.1 PCA及OPLS-DA模型的建立第32-34页
        3.3.2 差异代谢物变化情况第34-37页
        3.3.3 差异代谢物通路富集分析第37-40页
    3.4 菌株A与菌株J在 20h时间点代谢差异分析第40-48页
        3.4.1 PCA及OPLS-DA模型的建立第40-42页
        3.4.2 差异代谢物变化情况第42-45页
        3.4.3 差异代谢物通路富集分析第45-48页
    3.5 菌株J与菌株R在 4h时间点代谢差异分析第48-56页
        3.5.1 PCA及OPLS-DA模型的建立第48-50页
        3.5.2 差异代谢物变化情况第50-53页
        3.5.3 差异代谢物通路富集分析第53-56页
    3.6 菌株J与菌株R在 20h时间点代谢差异分析第56-64页
        3.6.1 PCA及OPLS-DA模型的建立第56-58页
        3.6.2 差异代谢物变化情况第58-61页
        3.6.3 差异代谢物通路富集分析第61-64页
4 讨论第64-67页
全文结论第67-68页
致谢第68-69页
参考文献第69-70页

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