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粳稻云引免疫应答相关基因OsGT64A的克隆及功能初步分析

摘要第2-4页
Abstract第4-5页
中文文摘第6-12页
绪论第12-23页
    0.1 研究背景第12-13页
    0.2 文献综述第13-21页
        0.2.1 糖基转移酶第14-21页
            0.2.1.1 糖基转移酶的分类、结构第15-17页
            0.2.1.2 GT64糖基转移酶家族第17-18页
            0.2.1.3 糖基转移酶在植物抗病过程中的作用第18-21页
        0.2.2 展望第21页
    0.3 本研究的目的与意义第21-23页
第一章 OsGT64A基因区、启动子区及转录本的克隆与序列比对分析第23-42页
    第一节 前言第23页
    第二节 实验材料与试剂第23页
        1.2.1 植物材料第23页
        1.2.2 主要试剂第23页
    第三节 实验方法第23-31页
        1.3.1 材料准备与引物设计第24页
            1.3.1.1 粳稻云引、丽江新团黑谷苗株的培养第24页
            1.3.1.2 水稻OsGT64A基因区与启动子区序列的搜索第24页
            1.3.1.3 设计引物第24页
        1.3.2 OsGT64A的基因序列与启动子序列的获得第24-28页
            1.3.2.1 粳稻云引、丽江新团黑谷叶片总DNA的提取第24-25页
            1.3.2.2 基因与启动子的扩增及胶回收第25-27页
            1.3.2.3 目的片段与克隆载体的连接第27页
            1.3.2.4 E.coli DH5 a感受态细胞的制备及转化第27-28页
            1.3.2.5 测序及拼接序列的获得第28页
        1.3.3 OsGT64A转录本的获得第28-31页
            1.3.3.1 云引及丽江新团黑谷叶片总RNA的提取第28-29页
            1.3.3.2 RNA反转录-cDNA库的获得第29-30页
            1.3.3.3 可变剪接体的扩增与胶回收第30-31页
            1.3.3.4 连接克隆载体与测序第31页
    第四节 结果与分析第31-41页
        1.4.1 云引与丽江新团黑谷中OsGT64A基因CDS及蛋白质序列的比对第31-34页
        1.4.2 OsGT64A蛋白的功能、空间结构预测及进化树分析第34-36页
        1.4.3 云引与丽江新团黑谷中OsGT64A基因启动子区的序列比对第36-38页
        1.4.4 OsGT64A启动子功能元件预测及突变分析第38页
        1.4.5 OsGT64A转录本的分析第38-41页
    第五节 讨论第41-42页
第二章 OsGT64A基因在逆境胁迫下的表达模式分析第42-50页
    第一节 前言第42页
    第二节 实验材料第42页
        2.2.1 材料第42页
        2.2.2 主要试剂第42页
    第三节 实验方法第42-45页
        2.3.1 粳稻云引、丽江新团黑谷稻瘟病菌接种第42-43页
            2.3.1.1 水稻幼苗的培养与材料准备第42-43页
            2.3.1.2 培养稻瘟病菌及制备孢子悬浮液第43页
            2.3.1.3 人工接种稻瘟病菌与取样第43页
        2.3.2 粳稻云引的水杨酸喷雾处理第43-44页
            2.3.2.1 三叶期水稻幼苗的喷雾处理第43-44页
        2.3.3 OsGT64A基因受稻瘟病侵染、水杨酸处理时的表达变化情况第44-45页
            2.3.3.1 荧光定量PCR引物的设计第44页
            2.3.3.2 叶片总RNA的提取与cDNA的获得第44页
            2.3.3.3 实时荧光定量PCR反应第44-45页
    第四节 结果与分析第45-48页
        2.4.1 稻瘟病菌的培养第45-46页
        2.4.2 稻瘟病菌“四川-43”的接种第46页
        2.4.3 OsGT64A基因在稻瘟病胁迫下的表达变化分析第46-48页
        2.4.4 OsGT64A基因在水杨酸处理下的表达变化分析第48页
    第五节 讨论第48-50页
第三章 OsGT64A基因相关表达载体构建及遗传转化第50-88页
    第一节 前言第50-51页
    第二节 实验材料第51-52页
        3.2.1 菌株及质粒第51页
        3.2.2 植物材料第51-52页
        3.2.3 主要试剂第52页
    第三节 实验方法第52-68页
        3.3.1 OsGT64A基因植物亚细胞定位载体的构建第52-56页
            3.3.1.1 云引OsGT64A编码区酶切位点分析及载体酶切位点的确定第52页
            3.3.1.2 带酶切位点CDS片段的扩增第52-53页
            3.3.1.3 带酶切位点CDS片段与载体的双酶切第53-54页
            3.3.1.4 目的片段与载体片段的连接第54页
            3.3.1.5 重组质粒的转化与鉴定第54页
            3.3.1.6 重组质粒的提取第54-55页
            3.3.1.7 重组质粒转化农杆菌第55-56页
        3.3.2 植物亚细胞定位载体瞬时转染烟草第56-57页
        3.3.3 OsGT64A基因过量表达载体的构建第57-59页
            3.3.3.1 扩增带有同源末端片段的CDS区第57-58页
            3.3.3.2 质粒载体的双酶切与同源重组反应第58-59页
        3.3.4 OsGT64A基因CRISPR-Cas9敲除表达载体的构建第59-62页
            3.3.4.1 gRNA靶点的筛选第59-60页
            3.3.4.2 包含靶点序列的连接片段扩增第60页
            3.3.4.3 “GoldenGate”克隆法构建酶切-连接反应体系第60-61页
            3.3.4.4 转化大肠杆菌及克隆验证第61-62页
        3.3.5 OsGT64A RNAi干扰载体的构建第62-64页
            3.3.5.1 干扰片段的筛选第62页
            3.3.5.2 目的片段同源序列的引入第62-63页
            3.3.5.3 ptck303载体的双酶切第63-64页
            3.3.5.4 -步法进行多片段同源重组连接第64页
        3.3.6 OsGT64A Gus染色表达载体的构建第64-65页
            3.3.6.1 启动子序列同源末端的引入第64页
            3.3.6.2 1305载体的双酶切及同源重组反应第64-65页
        3.3.7 农杆菌介导以的遗传转化第65-68页
            3.3.7.1 水稻愈伤组织的诱导与继代培养第65页
            3.3.7.2 农杆菌转化及植物组织培养第65-67页
            3.3.7.3 转基因苗的检测第67-68页
            3.3.7.4 CRISPR-Cas9基因敲除突变的检测第68页
    第四节 结果与分析第68-87页
        3.4.1 植物亚细胞定位载体pCAMBIA1302-OsGT64A的构建第68-71页
        3.4.2 OsGT64A亚细胞定位瞬时转化烟草第71页
        3.4.3 OsGT64A过量表达载体构建第71-74页
        3.4.4 植物基因敲除载体pHUE411-OsGT64A的构建第74-77页
        3.4.5 植物RNA干扰载体ptck303-OsGT64A的构建第77-80页
        3.4.6 植物gus表达载体1305-OsGT64A-promoter的构建第80-82页
        3.4.7 农杆菌介导粳稻云引的遗传转化第82-87页
            3.4.7.1 转基因苗的检测第83-85页
            3.4.7.2 CRISPR-Cas9基因敲除突变的分析第85-87页
    第五节 讨论第87-88页
第四章 结论第88-90页
参考文献第90-96页
攻读学位期间承担的科研任务与主要成果第96-98页
致谢第98-99页
个人简历第99-101页

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