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甘蔗黄叶病毒遗传多样性及不同基因型病毒编码的RNA沉默抑制子功能分析

摘要第9-11页
Abstract第11-12页
第一章 文献综述第13-21页
    1.1 病毒编码的RNA沉默抑制子研究进展第13-18页
        1.1.1 RNA沉默第13-14页
        1.1.2 RNA沉默抑制子及其作用机制第14-15页
        1.1.3 RNA沉默抑制子的鉴定方法第15-16页
        1.1.4 马铃薯卷叶病毒属编码的RNA沉默抑制子作用机理第16-18页
    1.2 甘蔗黄叶病毒研究进展第18-19页
        1.2.1 甘蔗黄叶病毒生物学特性第18页
        1.2.2 甘蔗黄叶病毒基因组结构和功能第18-19页
        1.2.3 甘蔗黄叶病毒遗传多样性第19页
    1.3 本研究的目的和意义第19-21页
第二章 SCYLV遗传进化及遗传多样性研究第21-37页
    2.1 材料与方法第21-24页
        2.1.1 实验材料和试剂第21-22页
        2.1.2 实验方法第22-24页
    2.2 结果与分析第24-35页
        2.2.1 RT-PCR检测第24-25页
        2.2.2 基于SCYLVP0序列的系统进化分析第25-26页
        2.2.3 基于SCYLV基因组序列的系统进化分析第26-27页
        2.2.4 SCYLV基因组及其编码的基因序列一致性分析第27-31页
        2.2.5 甘蔗黄叶病毒基因组的重组分析第31-34页
        2.2.6 我国主要蔗区SCYLV基因型分布第34-35页
    2.3 小结与讨论第35-37页
第三章 SCYLV编码的P0蛋白功能结构域及亚细胞定位研究第37-50页
    3.1 材料与方法第37-42页
        3.1.1 植物材料第37页
        3.1.2 质粒和菌株第37-38页
        3.1.3 P0基因克隆第38页
        3.1.4 P0蛋白特性分析第38-39页
        3.1.5 P0选择压力分析第39页
        3.1.6 P0及其突变体植物表达载体构建第39-41页
        3.1.7 外植体准备与基因枪轰击第41-42页
        3.1.8 EYFP瞬时表达分析第42页
        3.1.9 GFP-P0荧光瞬时表达观察第42页
    3.2 结果第42-47页
        3.2.1 P0蛋白理化性质第42-43页
        3.2.2 P0蛋白结构特征第43页
        3.2.3 P0选择压力分析第43-44页
        3.2.4 P0及其缺失突变体沉默抑制子功能鉴定第44-46页
        3.2.5 P0在洋葱表皮细胞中的定位第46-47页
    3.3 讨论第47-50页
第四章 不同SCYLV基因型P0蛋白活性差异分析第50-62页
    4.1 材料与方法第50-54页
        4.1.1 植物材料和培养条件第50页
        4.1.2 质粒和菌株第50-51页
        4.1.3 含不同SCYLV基因型P0的pUbi-NOS表达载体构建第51页
        4.1.4 含不同SCYLV基因型P0的pGD表达载体构建第51-52页
        4.1.5 甘蔗嫩叶组织制备和基因枪轰击第52页
        4.1.6 EYFP基因瞬时表达定量分析第52页
        4.1.7 农杆菌感受态的制备第52页
        4.1.8 冻融法转化农杆菌第52页
        4.1.9 农杆菌注射本生烟第52-53页
        4.1.10 GFP荧光观察和拍照第53页
        4.1.11 实时荧光定量RT-PCR分析第53-54页
    4.2 结果与分析第54-60页
        4.2.1 不同SCYLV基因型P0植物表达载体第54页
        4.2.2 不同SCYLV基因型P0在甘蔗抑制RNA沉默的表达活性差异第54-57页
        4.2.3 不同SCYLV基因型P0在本生烟上抑制RNA沉默的活性差异第57-58页
        4.2.4 从mRNA水平上分析GFP和P0转基因瞬时表达差异第58-60页
    4.3 小结与讨论第60-62页
第五章 SCYLV编码的P0与AGOs互作第62-70页
    5.1 材料与方法第63-66页
        5.1.1 植物材料第63页
        5.1.2 质粒和菌株第63页
        5.1.3 载体构建第63-64页
        5.1.4 酵母双杂交第64-65页
        5.1.5 农杆菌共浸润接种第65-66页
        5.1.6 激光共聚焦显微镜观察及拍照第66页
    5.2 结果与分析第66-68页
        5.2.1 酵母双杂交分析P0蛋白与拟南芥AGOs蛋白互作第66-67页
        5.2.2 BIFC分析P0蛋白与拟南芥AGOs蛋白互作第67-68页
    5.3 小结与讨论第68-70页
第六章 结论与展望第70-72页
    6.1 结论第70-71页
    6.2 展望第71-72页
参考文献第72-77页
附录第77-85页
致谢第85-86页

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