Project Instruction | 第7-8页 |
Abstract | 第8-11页 |
摘要 | 第12-22页 |
1. General Introduction | 第22-55页 |
1.1. | 第22-25页 |
1.1.1. Tropical Hainan | 第22-24页 |
1.1.2. Animal farming | 第24页 |
1.1.3. Vectors and vector borne diseases | 第24-25页 |
1.2. Haemoplasmosis | 第25-30页 |
1.2.1. Background: Hemotrophic mycoplasma/Eperythrozoon | 第25-28页 |
1.2.2. Taxonomy | 第28-29页 |
1.2.3. Isolation and Culture | 第29-30页 |
1.2.4. Some known vectors and Haemoplasma agents for some vertebrate host | 第30页 |
1.3. Feline Haemoplasmosis | 第30-35页 |
1.3.1. Epidemiology | 第31页 |
1.3.2. Pathogenesis | 第31页 |
1.3.3. Clinical Manifestations | 第31-32页 |
1.3.4. Diagnosis | 第32-33页 |
1.3.5. Transmission/Possible Vectors | 第33页 |
1.3.6. Treatment | 第33-35页 |
1.4. Porcine Eperythrozoonosis | 第35-40页 |
1.4.1. Pathogenesis | 第35-37页 |
1.4.2. Clinical signs | 第37-38页 |
1.4.3. Diagnosis | 第38页 |
1.4.4. Transmission | 第38-39页 |
1.4.5. Possible Vectors | 第39-40页 |
1.4.6. Control&Treatment | 第40页 |
1.5. Haemoplasmosis in Dogs/Canine haemoplasmas | 第40-48页 |
1.5.1. Background | 第40-41页 |
1.5.2. Taxonomy | 第41-42页 |
1.5.3. Isolation and Culture | 第42-43页 |
1.5.4. Pathogenesis | 第43页 |
1.5.5. Clinical Signs | 第43-44页 |
1.5.6. Diagnosis | 第44-45页 |
1.5.7. Transmission | 第45-46页 |
1.5.8. Possible vectors | 第46-48页 |
1.5.9. Control&Treatment | 第48页 |
1.6. Haemoplasmosis in Sheep and Goat | 第48-49页 |
1.7. Haemoplasmosis in Cattle | 第49页 |
1.8. Haemoplasmosis in Llamas and Alpacas | 第49-50页 |
1.9. Haemoplasmosis in mice | 第50页 |
1.10. Haemoplasmosis in flying fox | 第50-51页 |
1.11 Zoonotic Infection1 | 第51-52页 |
1.11.1. Background | 第51-52页 |
1.11.2. Public Health Significance | 第52页 |
1.12. The brown dog tick, Rhipicephalus sanguineus infected with Coxiella-like endosymbionts andits possible transmission in Dogs. | 第52-55页 |
1.12.1. Background | 第52-53页 |
1.12.2. Identification of Ticks | 第53-54页 |
1.12.3. Symptoms of Q fever in Dogs | 第54页 |
1.12.4. Modes of Transmission | 第54页 |
1.12.5. Medications | 第54-55页 |
2. Materials and Methods | 第55-71页 |
2.1. Materials | 第55-61页 |
2.1.1. Sterilization of Glassware | 第55页 |
2.1.2. Ethics statement | 第55页 |
2.1.3. Primers | 第55-57页 |
2.1.4. Blood samples | 第57页 |
2.1.5. Mosquito rearing in laboratory | 第57-58页 |
2.1.6. Buffers | 第58-59页 |
2.1.7. Molecular weight markers | 第59页 |
2.1.8. Immuno-chromatographic assay Kits | 第59-60页 |
2.1.9. Isolation of Mycoplasma DNA templates | 第60页 |
2.1.10. Isolation of DNA from Mosquitoes and Ticks | 第60页 |
2.1.11. In vitro-mosquitoes feeding on infected blood for Mycoplasmaparvum | 第60-61页 |
2.2. Methods | 第61-71页 |
2.2.1. Data collection&description of sampling/case study | 第61页 |
2.2.2. Isolation of mycoplasma DNA templates from blood samples ofpigs and dogs | 第61-62页 |
2.2.3. Tick collection and identification | 第62页 |
2.2.4. Ticks processing for DNA extraction | 第62页 |
2.2.5. Mosquito rearing in laboratory | 第62-63页 |
2.2.6. In vitro blood feeding experiment: mosquitoes feeding onInfected blood for M. parvum | 第63-64页 |
2.2.7. Ezup column animal genomic DNA extraction kit (mosquitoes, flies andticks) | 第64-65页 |
2.2.8. End point PCR for M. suis and M. parvum detection from Pigblood samples | 第65页 |
2.2.9. To confirm pathogen (Mycoplasma) transmission through flies collected at pigFarm | 第65-66页 |
2.2.10. End point PCR for M. haemocanis detection from dog bloodsamples | 第66页 |
2.2.11. End point PCR for Coxiella-endosymbionts detection from dog blood and Tickssamples | 第66-67页 |
2.2.12. Agarose gel electrophoresis | 第67页 |
2.2.13. SanPrep PCR purification kit (Sangon Biotech) | 第67-68页 |
2.2.14. SanPre DNA- gel extraction kit (Sangon Biotech) | 第68页 |
2.2.15. Sanger sequencing | 第68-69页 |
2.2.16. Real-time PCR | 第69页 |
2.2.17. Immuno-chromatographic assay | 第69-70页 |
2.2.18. Phylogenetic analysis | 第70-71页 |
3. Results and Analysis | 第71-105页 |
3.1. Pig blood Samples: diagnostic tests | 第71-84页 |
3.1.1. Comparison of the different tests used for diagnosis of pig bloodsamples | 第71-72页 |
3.1.2. Immunochromatographic assay | 第72-73页 |
3.1.3. Real-time PCR | 第73-74页 |
3.1.4. End point PCR&agarose Gel electrophoresis | 第74-77页 |
3.1.5. Statistical Analysis | 第77-78页 |
3.1.6. Phylogenetic analysis for M. suis and M. parvum | 第78-83页 |
3.1.7. In vitro Blood feeding experiment: To confirm pathogen (Mycoplasma)transmission through mosquitoes | 第83页 |
3.1.8. To confirm pathogen (Mycoplasma) transmission through flies collected atFarm | 第83-84页 |
3.2. Dog Blood Samples:End point PCR and Gel electrophoresis for DogBlood Samples | 第84-105页 |
3.2.1. Identification of M. haemocanis | 第84-86页 |
3.2.2. Phylogenetic analysis for M. haemocanis | 第86-90页 |
3.2.3. Sampling, Collection and Results | 第90-91页 |
3.2.4. End point PCR and Gel electrophoresis for Dog Blood Samples: showed Coxiella-like endosymbiont | 第91-95页 |
3.2.5. The brown dog tick, R sanguineus infected with Coxiella-like endosymbionts andits possible transmission in Dogs | 第95-96页 |
3.2.6. Statistical Analysis | 第96-97页 |
3.2.7. End point PCR and Gel electrophoresis for Ticks R sanguineus | 第97-102页 |
3.2.8. Phylogenetic sequence analysis between positive samples for Coxiellaendosymbionts and reference NCBI database sequences | 第102-105页 |
4. Discussion | 第105-113页 |
4.1. M.parvum from pig blood in Hainan | 第105-106页 |
4.1.1. Major findings | 第105页 |
4.1.2. Importance of the findings | 第105-106页 |
4.1.3. Study's limitations | 第106页 |
4.1.4. Suggestions for further research | 第106页 |
4.2. M.haemocanis from dog blood in Hainan | 第106-113页 |
4.2.1. Major findings | 第107页 |
4.2.2. Study's limitations | 第107-108页 |
4.2.3. Importance of the findings | 第108-109页 |
4.2.4. Study's limitations | 第109-110页 |
4.2.5. Importance of the research | 第110-111页 |
4.2.6. Suggestions for further research | 第111-113页 |
5. Conclusion | 第113-116页 |
5.1. Porcine eperythrozoonosis | 第113-114页 |
5.2. Canine Haemoplasmosis | 第114-115页 |
5.3. Rhipicephalus ticks infected with Coxiella endosymbionts in Hainan Island | 第115-116页 |
References | 第116-122页 |
Appendices | 第122-129页 |
Appendix A: list of abbreviations | 第122-124页 |
Appendix B: list of figures | 第124-128页 |
Appendix C: list of tables | 第128-129页 |
Acknowledgements | 第129-131页 |
Published article | 第131页 |