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红菜薹分蘖性状的遗传分析与QTL定位

摘要第6-8页
Abstract第8-10页
缩略词表第11-12页
1 前言第12-27页
    1.1 课题来由及研究目的第12页
    1.2 植物茎分枝的研究进展第12-15页
        1.2.1 植物茎分枝的定义及分类第12-14页
        1.2.2 植物茎分枝的生物学意义第14页
        1.2.3 植物茎分枝的发生机制第14-15页
    1.3 影响植物分枝/分蘖的因素第15-18页
        1.3.1 环境因素对分枝/分蘖的影响第15-16页
        1.3.2 植物激素对分枝/分蘖的影响第16-18页
    1.4 植物控制分枝/分蘖性状基因的研究进展第18-22页
        1.4.1 调控腋生分生组织发生的相关基因第18-20页
        1.4.2 调控腋生分生组织发育的相关基因第20-22页
    1.5 植物数量性状的研究进展第22-26页
        1.5.1 植物数量性状基因效应的遗传研究方法第22页
        1.5.2 植物QTL定位的原理及方法第22-23页
        1.5.3 QTL-seq的原理及应用第23-26页
    1.6 芸薹属作物分枝性状的研究第26-27页
2 材料和方法第27-34页
    2.1 材料第27页
    2.2 实验方法第27-34页
        2.2.1 六世代材料分蘖主+多基因遗传分析第27页
        2.2.2 分离群体组群分析法(BSA)简化基因组测序及QTL-seq分析第27-28页
        2.2.3 遗传作图分析第28-29页
        2.2.4 候选区域分枝相关基因的表达量分析第29-31页
        2.2.5 候选基因CDS序列分析第31-33页
        2.2.6 单基因分离群体的构建第33-34页
3 结果与分析第34-50页
    3.1 分蘖性状主基因+多基因遗传模型分析第34-38页
        3.1.1 遗传模型的选择和适应性检测第35-37页
        3.1.2 遗传参数估计第37-38页
    3.2 QTL-seq对于控制分蘖相关位点的初定位第38-40页
        3.2.1 DNA的提取及质量检测第38-39页
        3.2.2 简化基因组测序及数据分析第39-40页
    3.3 遗传连锁分析法对于QTL-seq结果的验证第40-42页
        3.3.1 多态性标记的筛选第40-41页
        3.3.2 连锁图谱的构建及QTL扫描第41-42页
    3.4 候选基因的预测第42-47页
        3.4.1 RNA的提取第42-43页
        3.4.2 候选区域内分蘖相关基因表达量的分析第43页
        3.4.3 A07染色体上与分蘖相关基因表达量的分析第43-45页
        3.4.4 候选基因的CDS序列分析第45-47页
    3.5 单基因分离群体的筛选第47-50页
        3.5.1 单基因分离候选群体的筛选第47-48页
        3.5.2 候选群体分蘖性状的调查第48-50页
4 讨论第50-54页
    4.1 多世代联合分析法在分枝性状研究中的应用第50-51页
    4.2 结合QTL-seq与遗传连锁分析法对数量性状主效基因的定位第51-52页
    4.3 候选基因的筛选第52-53页
    4.4 单基因分离世代的构建第53页
    4.5 本研究后续工作第53-54页
参考文献第54-64页
附录1 CTAB法提取植物组织DNA第64页
附录2 琼脂糖凝胶电泳方法第64-65页
附录3 聚丙烯酰胺凝胶电泳方法第65-66页
附录4 PCR反应体系及程序第66-67页
附录5 引物序列第67页
附录6 Bra004212、Bra004117在两亲本间的序列对比第67-71页
致谢第71页

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