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苦瓜全雌性连锁标记筛选及转录组分析

摘要第6-8页
Abstract第8-9页
缩略词表第10-11页
1.前言第11-24页
    1.1 课题的提出第11-12页
    1.2 植物性别分化研究进展第12-20页
        1.2.1 植物的性别类型第12-13页
        1.2.2 植物性别决定机制的研究进展第13-17页
            1.2.2.1 植物性别决定相关基因的研究第13-14页
            1.2.2.2 植物性染色体的研究第14-15页
            1.2.2.3 激素对植物性别分化的调控第15-17页
            1.2.2.4 外界环境因子对植物性别分化的影响第17页
        1.2.3 葫芦科植物性别决定研究进展第17-20页
    1.3 基因定位常用分子标记及其应用第20-22页
        1.3.1 常用的几种分子标记技术第20-22页
        1.3.2 SNP、Indel标记在植物基因定位中的应用第22页
    1.4 本研究的目的与内容第22-24页
        1.4.1 目的及意义第22-23页
        1.4.2 研究内容第23-24页
2.材料与方法第24-32页
    2.1 试验材料第24页
    2.2 试验方法第24-32页
        2.2.1 苦瓜性型观察及全雌性遗传规律研究第24页
        2.2.2 苦瓜全雌性状DNA-BSA分析第24-27页
            2.2.2.1 单株DNA提取第24-25页
            2.2.2.2 基于全雌性的DNA极端混池构建第25-26页
            2.2.2.3 基因组DNA混池测序及SNP位点分析第26页
            2.2.2.4 SNP位点验证及连锁标记筛选第26-27页
        2.2.3 苦瓜转录组分析及全雌性状机理解析第27-32页
            2.2.3.1 基于全雌性的RNA极端混池构建第27页
            2.2.3.2 总RNA的提取第27-29页
            2.2.3.3 RNA混池转录组测序第29页
            2.2.3.4 序列比对分析第29页
            2.2.3.5 转录本组装及功能注释第29-30页
            2.2.3.6 表达量分析第30页
            2.2.3.7 表达量差异分析第30-31页
            2.2.3.8 qRT-PCR分析第31-32页
3.结果与分析第32-46页
    3.1 苦瓜性型观察及全雌性遗传规律研究第32页
    3.2 苦瓜全雌性状DNA-BSA分析第32-38页
        3.2.1 DNA测序质量检测第32-33页
        3.2.2 混池DNA测序数据与参考基因组比对结果第33-34页
        3.2.3 混池DNA测序数据SNP分析第34-35页
        3.2.4 SNP位点验证及连锁标记筛选第35-38页
    3.3 转录组差异表达分析及全雌性状机理解析第38-46页
        3.3.1 序列比对分析第38-40页
        3.3.2 转录本功能注释及分类第40-41页
        3.3.3 表达量分析第41-42页
        3.3.4 表达量差异分析及qRT-PCR验证第42-44页
        3.3.5 差异基因功能注释第44-46页
4.讨论第46-50页
    4.1 苦瓜性别分化遗传规律的研究第46页
    4.2 苦瓜全雌性相关分子标记的研究第46-48页
    4.3 转录组差异表达分析及全雌性状机理解析第48-49页
    4.4 本研究的后续工作第49-50页
参考文献第50-60页
附表第60-65页
致谢第65页

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