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毛竹SOD基因家族生物信息学与功能分析

摘要第4-6页
Abstract第6-7页
前言第12-14页
第一章 文献综述第14-20页
    1.1 植物逆境生理研究进展第15-16页
        1.1.1 干旱胁迫对植物的影响第15页
        1.1.2 盐胁迫对植物的影响第15-16页
        1.1.3 高温胁迫对植物的影响第16页
    1.2 植物SOD基因的研究进展第16-18页
        1.2.1 植物SOD基因抗逆性研究进展第16-17页
        1.2.2 SOD基因家族同源性特征研究进展第17页
        1.2.3 植物SOD基因的分子克隆研究进展。第17页
        1.2.4 SOD基因表达调控研究进展第17-18页
        1.2.5 SOD酶活性的研究进展第18页
    1.3 竹类抗逆研究进展第18-20页
第二章 毛竹SOD基因家族生物信息学分析第20-33页
    2.1 实验材料第20页
    2.2 实验方法第20-21页
        2.2.1 毛竹数据库建立第20页
        2.2.2 毛竹SOD核酸与蛋白序列获取第20页
        2.2.3 毛竹SOD蛋白家族理化性质分析第20-21页
        2.2.4 毛竹SOD基因家族基因结构分析第21页
        2.2.5 毛竹与模式植物SOD家族蛋白聚类分析第21页
    2.3 结果与分析第21-31页
        2.3.1 毛竹SOD家族蛋白理化性质分析第21-22页
        2.3.3 毛竹SOD蛋白家族的跨膜结构信号肽分析第22-24页
        2.3.4 亚细胞定位的预测分析第24-25页
        2.3.5 毛竹SOD蛋白家族磷酸化位点预测分析第25-26页
        2.3.6 毛竹SOD家族基因在基因组序列中及结构分析第26-27页
        2.3.7 毛竹与模式植物SOD基因家族聚类结构分析第27-31页
    2.4 结论与讨论第31-33页
        2.4.1 毛竹SOD家族蛋白磷酸化调控机制第31页
        2.4.2 毛竹SOD家族蛋白亚细胞定位预测分析第31-33页
第三章 毛竹SOD基因家族进化分析第33-42页
    3.1 实验材料第33页
    3.2 实验方法第33-34页
        3.2.1 Ka/Ks(dN/dS)值计算与复制事件/分化事件计算第33页
        3.2.2 毛竹SOD基因家族进化过程中选择压力与复制事件分析第33页
        3.2.3 毛竹SOD基因家族与绿竹进化过程中选择压力与复制事件分析第33-34页
        3.2.4 毛竹SOD基因家族与绿竹进化过程中选择压力与复制事件第34页
    3.3 结果与分析第34-39页
        3.3.1 毛竹SOD基因家族进化过程中选择压力与复制事件分析第34-36页
        3.3.2 毛竹SOD基因家族与绿竹进化过程中选择压力与复制事件分析第36-37页
        3.3.3 毛竹SOD基因家族与水稻进化过程中选择压力与分化事件分析第37-39页
    3.4 结果与讨论第39-42页
        3.4.1 毛竹SOD基因家族进化过程中选择压力分析第39-40页
        3.4.2 毛竹SOD基因家族进化过程中复制事件分析第40-42页
第四章 毛竹SOD基因启动子相关分析第42-51页
    4.0 实验材料第42页
    4.1 实验方法第42页
    4.2 结果与分析第42-50页
        4.2.1 毛竹SOD基因家族启动子区与转录起始位点预测分析第42-44页
        4.2.2 PeSOD基因家族启动子中顺式元件预测分析第44-50页
            4.2.2.1 毛竹SOD基因家族成员启动子核心元件预测与分析第44页
            4.2.2.2 毛竹SOD基因家族成员启动子光反应元件的预测分析第44页
            4.2.2.3 毛竹SOD基因家族成员启动子激素应答元件的预测分析第44-45页
            4.2.2.4 毛竹SOD基因家族成员启动子胁迫响应元件的预测分析第45-50页
    4.3 结果与讨论第50-51页
第五章 PeCZSOD1基因启动子克隆与功能分析第51-65页
    5.1 实验材料第51页
    5.2 实验方法第51-62页
        5.2.1 毛竹总DNA提取第51页
        5.2.2 PeCZSOD1基因启动子克隆与分析第51-53页
        5.2.3 启动子片段载体构建与大肠杆菌转化第53-56页
            5.2.3.1 启动子目的条带扩增第53页
            5.2.3.2 目的条带割胶回收第53-54页
            5.2.3.3 pBI101载体的双酶切第54页
            5.2.3.4 大肠杆菌感受态制备第54-55页
            5.2.3.5 PeCZSOD1启动子表达载体的构建第55页
            5.2.3.6 连接产物的大肠杆菌转化第55-56页
            5.2.3.7 单菌落检测第56页
        5.2.4 转化农杆菌第56-57页
            5.2.4.1 质粒提取第56页
            5.2.4.2 农杆菌(Gv3101、C58C1)感受态制备第56-57页
            5.2.4.3 农杆菌电击转化第57页
        5.2.5 突变体拟南芥种植第57页
        5.2.6 农杆菌侵染拟南芥幼苗第57-59页
        5.2.7 拟南芥GUS组织化学染色第59-60页
        5.2.8 荧光法测定GUS酶活性第60页
        5.2.9 GUS蛋白的提取第60-61页
        5.2.10 拟南芥瞬时表达GUS蛋白含量测定第61-62页
            5.2.10.1 制作标准曲线第61页
            5.2.10.2 GUS定量检测第61-62页
            5.2.10.3 拟南芥瞬时表达GUS酶活计算第62页
    5.3 结果与分析第62-64页
        5.3.1 启动子瞬时表达活性第62-63页
        5.3.2 启动子瞬时表达GUS酶活性第63-64页
    5.4 结论与讨论第64-65页
第六章 毛竹SOD家族基因表达模式及SOD酶活性第65-78页
    6.1 实验材料第65页
    6.2 实验方法第65-67页
        6.2.1 毛竹SOD家族基因表达模式第65-66页
            6.2.1.1 荧光定量PCR引物设计第65页
            6.2.1.2 毛竹实生苗种植第65页
            6.2.1.3 毛竹实生苗不同组织部位取样第65页
            6.2.1.4 毛竹实生苗胁迫处理第65页
            6.2.1.5 毛竹样本RNA提取第65-66页
            6.2.1.6 RNA反转录第66页
        6.2.2 毛竹SOD酶活性测定第66-67页
            6.2.2.1 样本处理与采集第66-67页
            6.2.2.2 SOD粗酶液提取第67页
            6.2.2.3 SOD酶活测定第67页
            6.2.2.4 总SOD活力计算第67页
    6.3 结果与分析第67-75页
        6.3.1 定量引物设计第67-68页
        6.3.2 PeSOD基因家族各成员在毛竹不同组织部位的表达分析第68-69页
        6.3.3 PeSOD基因家族各成员在非生物胁迫中的表达分析第69-72页
            6.3.3.1 PeSOD基因家族在盐胁迫环境下的表达模式第69-70页
            6.3.3.2 PeSOD基因家族在高温胁迫环境下的表达模式第70-71页
            6.3.3.3 PeSOD基因家族在干旱胁迫环境下的表达模式第71-72页
        6.3.4 PeSOD基因家族各成员在激素处理条件下的表达分析第72-74页
            6.3.4.1 PeSOD基因家族在ABA激素处理下的表达模式第72-73页
            6.3.4.2 PeSOD基因家族在GA激素处理下的表达模式第73-74页
            6.3.4.3 PeSOD基因家族在MeJA激素处理下的表达模式第74页
        6.3.5 非生物胁迫与激素处理条件下毛竹SOD酶活性分析第74-75页
    6.4 结论与讨论第75-78页
第七章 毛竹SOD基因功能研究第78-84页
    7.1 实验材料第78页
    7.2 实验方法第78-81页
        7.2.1 引物设计与毛竹SOD基因克隆第78-81页
            7.2.1.1 引物设计第78页
            7.2.1.2 目的条带扩增第78-79页
            7.2.1.3 35S::PeCZSOD1双元表达载体构建第79-80页
            7.2.1.4 农杆菌转化第80页
            7.2.1.5 野生型拟南芥种植第80页
            7.2.1.6 农杆菌侵染拟南芥第80-81页
            7.2.1.7 转基因拟南芥种子筛选第81页
    7.3 结果与分析第81-83页
        7.3.1 T1代转基因拟南芥琼脂糖凝胶电泳检测第81页
        7.3.2 转基因拟南芥抗逆性第81-83页
    7.4 结论与讨论第83-84页
第八章 结论与展望第84-86页
    8.1 研究结论第84-85页
    8.2 研究展望第85-86页
参考文献第86-91页
附录第91-92页
致谢第92页

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