| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 主要符号说明 | 第9-13页 |
| 1. 文献综述 | 第13-28页 |
| 1.1 抗病育种与抗病毒先天免疫概述 | 第13-17页 |
| 1.1.1 抗病育种 | 第13-15页 |
| 1.1.2 抗病毒先天免疫概述 | 第15-17页 |
| 1.2 STING基因的简介 | 第17-27页 |
| 1.2.1 TMEM173基因多态性研究进展 | 第17-18页 |
| 1.2.2 STING基因通路的研究 | 第18-21页 |
| 1.2.3 微生物触发的STING的信号通路 | 第21-23页 |
| 1.2.4 STING与自发性炎症疾病 | 第23-26页 |
| 1.2.5 STING与线粒体DNA | 第26-27页 |
| 1.2.6 小结 | 第27页 |
| 1.3 研究目的与意义 | 第27-28页 |
| 2. 材料与方法 | 第28-45页 |
| 2.1 试验动物与病毒来源 | 第28页 |
| 2.2 试剂与耗材料 | 第28-31页 |
| 2.2.1 主要试剂盒与试剂 | 第28-29页 |
| 2.2.2 主要仪器设备 | 第29-30页 |
| 2.2.3 所需试剂的配置 | 第30-31页 |
| 2.3 试验技术路线 | 第31页 |
| 2.4 试验方法 | 第31-41页 |
| 2.4.1 引物的设计和合成 | 第31-32页 |
| 2.4.2 总RNA提取 | 第32-33页 |
| 2.4.3 cDNA模板的制备 | 第33-35页 |
| 2.4.4 鸡STING基因CDS区克隆与测序 | 第35-38页 |
| 2.4.5 快速扩增cDNA 5末端(5-Rapid Amplification of cDNA End,5-RACE) | 第38-40页 |
| 2.4.6 用Clontech的SMART RACE cDNA Amplification Kit试剂盒获取3'端序列 | 第40-41页 |
| 2.5 机体试验 | 第41-42页 |
| 2.5.1 STING基因组织表达谱的构建 | 第41页 |
| 2.5.2 STING基因NDV机体攻毒诱导表达试验 | 第41-42页 |
| 2.6 细胞试验 | 第42-43页 |
| 2.6.1 鸡胚成纤维细胞(CEFs)的制备 | 第42页 |
| 2.6.2 新城疫病毒(NDV)的感染 | 第42页 |
| 2.6.3 外源物质Poly(I:C)和poly(dA:dT)的转染 | 第42-43页 |
| 2.6.4 细胞总RNA的提取(Trizol法) | 第43页 |
| 2.6.5 荧光定量 | 第43页 |
| 2.7 核苷酸多态性(SNP) | 第43-44页 |
| 2.8 数据的统计与分析 | 第44-45页 |
| 3. 结果与分析 | 第45-68页 |
| 3.1 chSTING的生物信息学分析 | 第45-51页 |
| 3.1.1 chSTING的核酸序列分析 | 第45-47页 |
| 3.1.2 STING的基本理化性质和蛋白质结构分析 | 第47-49页 |
| 3.1.3 chSTING的多序列比对以及进化树的构建 | 第49-51页 |
| 3.2 SNP鉴定以及序列分析 | 第51-57页 |
| 3.2.1 罗曼粉蛋鸡群体中STING基因的SNPs以及连锁不平衡分析 | 第51-52页 |
| 3.2.2 草科鸡群体中STING基因的SNPs以及连锁不平衡分析 | 第52-53页 |
| 3.2.3 旧院黑鸡群体中STING基因的SNPs以及连锁不平衡分析 | 第53-55页 |
| 3.2.4 大恒肉鸡群体中STING基因的SNPs以及连锁不平衡分析 | 第55-57页 |
| 3.3 鸡STING基因在不同组织中的mRNA表达 | 第57-58页 |
| 3.4 不同毒力的NDV毒株感染免疫组织后STING及其下游基因不同时间点的表达情况 | 第58-61页 |
| 3.5 细胞试验 | 第61-68页 |
| 3.5.1 CEFs感染NDV后STING及其下游基因不同时间点的表达情况 | 第61-62页 |
| 3.5.2 不同浓度的poly(I:C)转染CEF后STING及其下游基因的表达情况 | 第62-63页 |
| 3.5.3 poly(I:C)转染CEF后STING及其下游基因不同时间点的表达情况 | 第63-64页 |
| 3.5.4 不同浓度的Ploy(dA: dT)转染CEF后STING及其下游基因的表达情况 | 第64-66页 |
| 3.5.5 Ploy(dA: dT)转染CEF后STING及其下游基因不同时间点的表达情况 | 第66-67页 |
| 3.5.6 NDV不同滴度M毒株转染CEF后STING及其下游基因的表达情况 | 第67-68页 |
| 4. 讨论 | 第68-71页 |
| 4.1 鸡STING基因的克隆及其生物信息学分析 | 第68页 |
| 4.2 单核苷酸多态性(SNP)分析 | 第68-69页 |
| 4.3 鸡STING基因的组织表达谱分析 | 第69页 |
| 4.4 不同毒力的NDV毒株感染免疫组织后STING及其下游基因不同时间点的表达情况 | 第69-70页 |
| 4.5 Poly(I:C)和Poly(dA:dT)转染对STING及其下游基因相对表达量的影响 | 第70-71页 |
| 4.6 NDV转染CEF后STING及其下游基因相对表达量的影响 | 第71页 |
| 5. 结论 | 第71-73页 |
| 参考文献 | 第73-83页 |
| 致谢 | 第83-84页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文目录 | 第84页 |
