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斑马鱼中一个母源转录因子调控轴旁中胚层图式形成

致谢第5-6页
摘要第6-8页
Abstract第8-9页
第一章 引言第13-40页
    1.1 背腹轴形成的分子机制第13-15页
        1.1.1 组织者的形成第13-15页
        1.1.2 腹部极性的形成也由母源因子主动调控第15页
    1.2 胚层分化与中胚层诱导的分子机制第15-18页
        1.2.1 胚层分化第15-16页
        1.2.2 中胚层诱导第16-18页
    1.3 中胚层的背腹区域图式形成第18-20页
    1.4 Wnt8a协同Bmp2b信号途径维持斑马鱼胚胎腹部的特性第20-22页
        1.4.1 Bmp2b在维持斑马鱼腹部特性中的作用第20-21页
        1.4.2 Wnt8通过激活vox/vent/ved以维持斑马鱼腹部的特性第21-22页
    1.5 轴和轴旁中胚层图式形成的调控机制尚不清楚第22-24页
    1.6 斑马鱼轴和轴旁中胚层特化基因的控制机制第24-29页
        1.6.1 Spadetail(Spt)在轴和轴旁中胚层分化中的作用第24-26页
        1.6.2 spt通过直接激活papc来影响细胞运动第26-27页
        1.6.3 flh能够抑制spt在轴中胚层的异位表达第27-28页
        1.6.4 ntl能够维持原肠期flh的表达第28页
        1.6.5 flh,spt之间的关系第28-29页
    1.7 vsx1的结构特性及其在胚胎发育过程中的作用第29-38页
        1.7.1 同源异型框基因的分类以及功能第29-35页
        1.7.2 Vsx1的结构特性第35-36页
        1.7.3 CVC结构域第36页
        1.7.4 斑马鱼vsx1的表达模式第36-37页
        1.7.5 vsx1的功能第37-38页
    1.8 本研究的目的和意义第38-40页
第二章 母源Vsx1影响胚胎早期形体模式形成第40-57页
    2.1 前言第40页
    2.2 材料和方法第40-52页
        2.2.1 溶液和试剂的配制第40-42页
        2.2.2 斑马鱼胚胎获取第42页
        2.2.3 斑马鱼胚胎脱膜处理第42页
        2.2.4 斑马鱼胚胎不同发育时期材料的获取第42-43页
        2.2.5 PCS107+vsx1载体的构建第43-47页
        2.2.6 Vsx1抗体的制备和检测第47-50页
        2.2.7 vsx1的在早期胚胎中的定位分析第50-52页
    2.3 实验结果第52-55页
        2.3.1 Vsx1抗体特异性第52-53页
        2.3.2 vsx1早期表达的定位第53-55页
    2.4 实验小结与讨论第55-57页
第三章 母源Vsx1是轴旁中胚层特化所必需的转录调控因子第57-74页
    3.1 前言第57-58页
    3.2 材料和方法第58-65页
        3.2.1 溶液和试剂的配制第58页
        3.2.2 vsx1 sbMO的设计第58页
        3.2.3 重组质粒的构建第58-60页
        3.2.4 体外转录capped mRNA第60-62页
        3.2.5 反义RNA探针的制备第62-63页
        3.2.6 显微注射第63页
        3.2.7 整胚原位杂交第63-65页
    3.3 实验结果第65-72页
        3.3.1 母源vsx1 mRNA影响早期胚胎发育第65-68页
        3.3.2 母源Vsx1参与轴和轴旁中胚层细胞命运的决定第68-69页
        3.3.3 母源Vsx1启动轴旁中胚层特化第69-70页
        3.3.4 母源vsx1在调控flh,spt表达模式中的作用第70-71页
        3.3.5 Vsx1不影响Wnt8和Bmp2b信号通路第71-72页
    3.4 实验小结与讨论第72-74页
第四章 Vsx1是转录抑制因子第74-81页
    4.1 前言第74-75页
    4.2 材料和方法第75-78页
        4.2.1 溶液和试剂的配制第75页
        4.2.2 重组En-vsx1和VP16-vsx1第75-76页
        4.2.3 体外转录第76页
        4.2.4 显微注射第76页
        4.2.5 原位杂交第76页
        4.2.6 qRT-PCR分析第76-78页
    4.3 实验结果第78-80页
        4.3.1 En-Vsx1和VP16-Vsx1的构建第78页
        4.3.2 En-Vsx1和VP16-Vsx1对发育和内源flh表达的影响第78-79页
        4.3.3 En-Vsx1和VP16-Vsx1对靶基因转录影响的定量分析第79-80页
    4.4 实验小结与讨论第80-81页
第五章 Vsx1在DNA上结合位点的序列特性和识别功能域第81-112页
    5.1 前言第81-82页
    5.2 材料和方法第82-98页
        5.2.1 溶液和试剂的配制第82-83页
        5.2.2 斑马鱼基因组DNA的提取第83-84页
        5.2.3 构建GFP报告基因第84-85页
        5.2.4 显微注射第85-86页
        5.2.5 qRT-PCR定量分析Vsx1对gfp表达丰度的影响第86页
        5.2.6 构建表达载体第86-87页
        5.2.7 融合蛋白的表达以及纯化第87-91页
        5.2.8 凝胶阻滞实验的原理和方法第91-94页
        5.2.9 染色质免疫共沉淀第94-98页
        5.2.10 突变HD以及CVC结构域第98页
    5.3 实验结果第98-110页
        5.3.1 Vsx1特异性结合位点的序列特性第98-100页
        5.3.2 其他序列元件参与了Vsx1与靶基因特异性结合位点的识别第100-102页
        5.3.3 Vsx1能够结合到ntl启动子上具有相似序列特性的位点第102-104页
        5.3.4 vsx1 CVC区域的克隆以及序列优化第104-105页
        5.3.5 体外表达GST+CVC结构域第105-106页
        5.3.6 GST+CVC融合蛋白的纯化以及浓度测定第106页
        5.3.7 GST+CVC融合蛋白的鉴定第106-107页
        5.3.8 Vsx1的HD和CVC结构域突变都不能再抑制靶基因的表达第107-108页
        5.3.9 Vsx1的HD和CVC结构域突变都导致其不能与靶基因结合第108-109页
        5.3.10 Vsx1的CVC结构域不能在体外与结合位点直接结合第109-110页
    5.4 实验小结与讨论第110-112页
第六章 主要结果,结论和进一步的研究设想第112-114页
    6.1 主要研究结果和结论第112-113页
    6.2 进一步研究设想第113-114页
参考文献第114-121页

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