| 摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-11页 |
| 缩略词表 | 第12-13页 |
| 第一章 前言 | 第13-30页 |
| 1 桃流胶病研究进展 | 第13-21页 |
| 1.1 桃树流胶病的发生 | 第13页 |
| 1.2 桃树流胶病的病原研究 | 第13-14页 |
| 1.3 桃树流胶病的发病症状 | 第14页 |
| 1.4 桃树流胶病的组织病理学研究 | 第14-15页 |
| 1.5 胶体成分分析 | 第15-16页 |
| 1.6 桃树流胶病的发病机理研究 | 第16-19页 |
| 1.6.1 植物响应病原菌侵染的防御反应机制 | 第16页 |
| 1.6.2 植物次生代谢物与抵御病原菌的防御反应 | 第16-17页 |
| 1.6.3 桃病原性流胶病实验研究系统 | 第17-18页 |
| 1.6.4 桃流胶病发病过程中的基础生理生化研究 | 第18页 |
| 1.6.5 桃流胶病的流胶机理分析 | 第18-19页 |
| 1.7 桃树流胶病的防治研究 | 第19-21页 |
| 1.7.1 杀真菌剂的筛选和使用 | 第19页 |
| 1.7.2 抗流胶病品种的筛选 | 第19-20页 |
| 1.7.3 生物防治策略 | 第20-21页 |
| 2 茉莉酸、乙烯与植物病害 | 第21-27页 |
| 2.1 茉莉酸、乙烯的生物合成 | 第21-24页 |
| 2.2 茉莉酸、乙烯与流胶病 | 第24-26页 |
| 2.3 茉莉酸、乙烯在植物与病原菌互作中的作用 | 第26-27页 |
| 3 组学技术在植物病害研究上的应用 | 第27-29页 |
| 4 研究的目的和主要内容 | 第29-30页 |
| 第二章 桃枝条响应Lasiodiplodia theobromae侵染的转录组学研究 | 第30-67页 |
| 1 材料与方法 | 第30-35页 |
| 1.1 试验材料 | 第30页 |
| 1.2 离体接种实验 | 第30-31页 |
| 1.3 样品准备和总RNA提取 | 第31页 |
| 1.4 cDNA文库构建和RNA-Seq | 第31页 |
| 1.5 Reads比对到桃基因组和差异表达基因鉴定 | 第31-32页 |
| 1.6 差异基因的功能分析 | 第32页 |
| 1.7 实时荧光定量PCR (qRT-PCR)分析RNA-Seq数据 | 第32-33页 |
| 1.8 乙烯释放量测定 | 第33-34页 |
| 1.9 茉莉酸甲酯处理桃一年生离体枝条 | 第34页 |
| 1.9.1 材料处理 | 第34页 |
| 1.9.2 可溶性糖含量测定 | 第34页 |
| 1.9.3 荧光定量PCR分析 | 第34页 |
| 1.9.4 乙烯释放量测定 | 第34页 |
| 1.10 数据分析 | 第34-35页 |
| 2 结果与分析 | 第35-60页 |
| 2.1 ?春雪‘一年生离体枝条接种L. theobromae后的症状表现 | 第35-36页 |
| 2.2 RNA-Seq数据分析 | 第36-54页 |
| 2.2.1 RNA-Seq高通量测序数据质量评估 | 第36-37页 |
| 2.2.2 RNA-Seq检出的基因数 | 第37页 |
| 2.2.3 差异表达基因鉴定分析 | 第37-40页 |
| 2.2.4 差异表达基因的功能聚类分析 | 第40-52页 |
| 2.2.5 qRT-PCR结果与RNA-Seq结果比较 | 第52-54页 |
| 2.3 接种L. theobromae对桃枝条乙烯释放量的影响 | 第54-55页 |
| 2.4 茉莉酸甲酯处理桃一年生离体枝条 | 第55-60页 |
| 2.4.1 枝条处理后的症状以及与接种L. theobromae的对比 | 第55-57页 |
| 2.4.2 茉莉酸甲酯对桃枝条可溶性糖含量的影响 | 第57-58页 |
| 2.4.3 茉莉酸甲酯对枝条乙烯释放的影响 | 第58-59页 |
| 2.4.4 与茉莉酸合成以及信号转导相关基因的表达分析 | 第59-60页 |
| 3 讨论 | 第60-64页 |
| 3.1 苯丙素合成代谢、糖基转移酶以及光合作用与防御反应 | 第60-61页 |
| 3.2 桃枝条接种L. theobromae后的多糖合成代谢 | 第61-63页 |
| 3.3 乙烯与茉莉酸在桃流胶病发病过程中的作用 | 第63-64页 |
| 4 小结 | 第64-66页 |
| 5 展望 | 第66-67页 |
| 第三章 桃流胶病菌的侵染特性分析 | 第67-87页 |
| 1 材料与方法 | 第67-73页 |
| 1.1 可见流胶的皮孔组织的病原菌分离鉴定 | 第67-71页 |
| 1.1.1 试验材料 | 第67页 |
| 1.1.2 病原菌分离纯化 | 第67-68页 |
| 1.1.3 病原菌的形态学鉴定 | 第68页 |
| 1.1.4 病原菌的分子生物学鉴定 | 第68-69页 |
| 1.1.5 病原菌的致病性测定 | 第69-71页 |
| 1.2 流胶病菌在桃枝条组织内的侵染分析 | 第71-73页 |
| 1.2.1 试验材料 | 第71页 |
| 1.2.2 离体接种 | 第71页 |
| 1.2.3 病原菌再分离 | 第71-72页 |
| 1.3.2 病原菌在桃树活体枝干组织内形成的分生孢子器观察 | 第72页 |
| 1.3.3 病原菌在桃离体枝条组织内形成的分生孢子器观察 | 第72页 |
| 1.3.4 石蜡切片操作步骤 | 第72-73页 |
| 2 结果与分析 | 第73-84页 |
| 2.1 皮孔流胶观察及病原菌的分离鉴定 | 第73-79页 |
| 2.1.1 皮孔流胶观察 | 第73-75页 |
| 2.1.2 皮孔流胶组织的病原菌分离结果 | 第75页 |
| 2.1.3 WH-15710 菌株的致病性测定 | 第75-77页 |
| 2.1.4 WH-15710 菌株的形态学鉴定 | 第77-78页 |
| 2.1.5 DNA序列分析和分子系统学研究 | 第78-79页 |
| 2.2 流胶病菌在桃枝条组织内的侵染情况 | 第79-84页 |
| 2.2.1 接种后不同时间去掉菌丝块对枝条病斑长度和流胶发生率的影响 | 第79-80页 |
| 2.2.2 接种后不同时间去掉菌丝块对病原菌再分离的影响 | 第80-81页 |
| 2.2.3 桃流胶病菌在活体枝条组织内形成的分生孢子器 | 第81-83页 |
| 2.2.4 桃流胶病菌在离体枝条组织内形成的分生孢子器 | 第83-84页 |
| 3 讨论 | 第84-85页 |
| 3.1 桃流胶病菌的侵染特性 | 第84-85页 |
| 3.2 Neofusicoccum parvum导致的植物病害 | 第85页 |
| 4 小结 | 第85-86页 |
| 5 展望 | 第86-87页 |
| 参考文献 | 第87-108页 |
| 附录Ⅰ q RT-PCR引物列表 | 第108-110页 |
| 附录Ⅱ 差异表达基因的RPKM值 | 第110-115页 |
| 附录Ⅲ 附图及说明 | 第115-119页 |
| 附录Ⅳ 课题资助情况 | 第119页 |
| 附录Ⅴ 博士期间发表论文 | 第119-120页 |
| 致谢 | 第120-121页 |
