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桃响应LASIODIPLODIA THEOBROMAE侵染的基因表达变化及桃流胶病菌的侵染特性研究

摘要第8-10页
Abstract第10-11页
缩略词表第12-13页
第一章 前言第13-30页
    1 桃流胶病研究进展第13-21页
        1.1 桃树流胶病的发生第13页
        1.2 桃树流胶病的病原研究第13-14页
        1.3 桃树流胶病的发病症状第14页
        1.4 桃树流胶病的组织病理学研究第14-15页
        1.5 胶体成分分析第15-16页
        1.6 桃树流胶病的发病机理研究第16-19页
            1.6.1 植物响应病原菌侵染的防御反应机制第16页
            1.6.2 植物次生代谢物与抵御病原菌的防御反应第16-17页
            1.6.3 桃病原性流胶病实验研究系统第17-18页
            1.6.4 桃流胶病发病过程中的基础生理生化研究第18页
            1.6.5 桃流胶病的流胶机理分析第18-19页
        1.7 桃树流胶病的防治研究第19-21页
            1.7.1 杀真菌剂的筛选和使用第19页
            1.7.2 抗流胶病品种的筛选第19-20页
            1.7.3 生物防治策略第20-21页
    2 茉莉酸、乙烯与植物病害第21-27页
        2.1 茉莉酸、乙烯的生物合成第21-24页
        2.2 茉莉酸、乙烯与流胶病第24-26页
        2.3 茉莉酸、乙烯在植物与病原菌互作中的作用第26-27页
    3 组学技术在植物病害研究上的应用第27-29页
    4 研究的目的和主要内容第29-30页
第二章 桃枝条响应Lasiodiplodia theobromae侵染的转录组学研究第30-67页
    1 材料与方法第30-35页
        1.1 试验材料第30页
        1.2 离体接种实验第30-31页
        1.3 样品准备和总RNA提取第31页
        1.4 cDNA文库构建和RNA-Seq第31页
        1.5 Reads比对到桃基因组和差异表达基因鉴定第31-32页
        1.6 差异基因的功能分析第32页
        1.7 实时荧光定量PCR (qRT-PCR)分析RNA-Seq数据第32-33页
        1.8 乙烯释放量测定第33-34页
        1.9 茉莉酸甲酯处理桃一年生离体枝条第34页
            1.9.1 材料处理第34页
            1.9.2 可溶性糖含量测定第34页
            1.9.3 荧光定量PCR分析第34页
            1.9.4 乙烯释放量测定第34页
        1.10 数据分析第34-35页
    2 结果与分析第35-60页
        2.1 ?春雪‘一年生离体枝条接种L. theobromae后的症状表现第35-36页
        2.2 RNA-Seq数据分析第36-54页
            2.2.1 RNA-Seq高通量测序数据质量评估第36-37页
            2.2.2 RNA-Seq检出的基因数第37页
            2.2.3 差异表达基因鉴定分析第37-40页
            2.2.4 差异表达基因的功能聚类分析第40-52页
            2.2.5 qRT-PCR结果与RNA-Seq结果比较第52-54页
        2.3 接种L. theobromae对桃枝条乙烯释放量的影响第54-55页
        2.4 茉莉酸甲酯处理桃一年生离体枝条第55-60页
            2.4.1 枝条处理后的症状以及与接种L. theobromae的对比第55-57页
            2.4.2 茉莉酸甲酯对桃枝条可溶性糖含量的影响第57-58页
            2.4.3 茉莉酸甲酯对枝条乙烯释放的影响第58-59页
            2.4.4 与茉莉酸合成以及信号转导相关基因的表达分析第59-60页
    3 讨论第60-64页
        3.1 苯丙素合成代谢、糖基转移酶以及光合作用与防御反应第60-61页
        3.2 桃枝条接种L. theobromae后的多糖合成代谢第61-63页
        3.3 乙烯与茉莉酸在桃流胶病发病过程中的作用第63-64页
    4 小结第64-66页
    5 展望第66-67页
第三章 桃流胶病菌的侵染特性分析第67-87页
    1 材料与方法第67-73页
        1.1 可见流胶的皮孔组织的病原菌分离鉴定第67-71页
            1.1.1 试验材料第67页
            1.1.2 病原菌分离纯化第67-68页
            1.1.3 病原菌的形态学鉴定第68页
            1.1.4 病原菌的分子生物学鉴定第68-69页
            1.1.5 病原菌的致病性测定第69-71页
        1.2 流胶病菌在桃枝条组织内的侵染分析第71-73页
            1.2.1 试验材料第71页
            1.2.2 离体接种第71页
            1.2.3 病原菌再分离第71-72页
            1.3.2 病原菌在桃树活体枝干组织内形成的分生孢子器观察第72页
            1.3.3 病原菌在桃离体枝条组织内形成的分生孢子器观察第72页
            1.3.4 石蜡切片操作步骤第72-73页
    2 结果与分析第73-84页
        2.1 皮孔流胶观察及病原菌的分离鉴定第73-79页
            2.1.1 皮孔流胶观察第73-75页
            2.1.2 皮孔流胶组织的病原菌分离结果第75页
            2.1.3 WH-15710 菌株的致病性测定第75-77页
            2.1.4 WH-15710 菌株的形态学鉴定第77-78页
            2.1.5 DNA序列分析和分子系统学研究第78-79页
        2.2 流胶病菌在桃枝条组织内的侵染情况第79-84页
            2.2.1 接种后不同时间去掉菌丝块对枝条病斑长度和流胶发生率的影响第79-80页
            2.2.2 接种后不同时间去掉菌丝块对病原菌再分离的影响第80-81页
            2.2.3 桃流胶病菌在活体枝条组织内形成的分生孢子器第81-83页
            2.2.4 桃流胶病菌在离体枝条组织内形成的分生孢子器第83-84页
    3 讨论第84-85页
        3.1 桃流胶病菌的侵染特性第84-85页
        3.2 Neofusicoccum parvum导致的植物病害第85页
    4 小结第85-86页
    5 展望第86-87页
参考文献第87-108页
附录Ⅰ q RT-PCR引物列表第108-110页
附录Ⅱ 差异表达基因的RPKM值第110-115页
附录Ⅲ 附图及说明第115-119页
附录Ⅳ 课题资助情况第119页
附录Ⅴ 博士期间发表论文第119-120页
致谢第120-121页

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