摘要 | 第3-4页 |
Abstract | 第4-5页 |
主要英文缩略词对照表 | 第9-10页 |
第1章 引言 | 第10-44页 |
1.1 核糖体的结构与功能 | 第10-17页 |
1.1.1 核糖体的结构 | 第12-14页 |
1.1.2 原核细菌核糖体的翻译 | 第14-17页 |
1.2 核糖体翻译暂停 | 第17-35页 |
1.2.1 蛋白质质量控制 | 第17-18页 |
1.2.2 肽链输出通道与新生肽链 | 第18-20页 |
1.2.3 肽键生成速率调控翻译 | 第20-21页 |
1.2.4 新生肽链调控翻译 | 第21-27页 |
1.2.5 SecM暂停核糖体翻译研究进展 | 第27-35页 |
1.3 冷冻电子显微学 | 第35-43页 |
1.3.1 透射电子显微镜概述 | 第35-36页 |
1.3.2 透射电子显微镜样品制备 | 第36-38页 |
1.3.3 单颗粒三维重构 | 第38-41页 |
1.3.4 冷冻电子显微镜技术的发展 | 第41-43页 |
1.4 本课题的研究意义 | 第43-44页 |
第2章 SecM-Stalled核糖体-肽链复合物纯化与性质 | 第44-59页 |
2.1 实验材料 | 第44-46页 |
2.1.1 实验仪器 | 第44-45页 |
2.1.2 实验试剂 | 第45-46页 |
2.2 实验方法 | 第46-50页 |
2.2.1 质粒构建 | 第46-47页 |
2.2.2 SecM暂停核糖体翻译时间优化 | 第47-48页 |
2.2.3 SecM-Stalled核糖体-肽链复合物的表达与纯化 | 第48-49页 |
2.2.4 SecM-Stalled核糖体-肽链复合物的解聚 | 第49页 |
2.2.5 LC-MS/MS质谱分析 | 第49-50页 |
2.3 实验结果 | 第50-56页 |
2.3.1 SecM暂停核糖体翻译时间确定 | 第50-52页 |
2.3.2 SecM-Stalled核糖体-肽链复合物的纯化 | 第52-54页 |
2.3.3 SecM-Stalled核糖体-肽链复合物中新生肽链纯化 | 第54-56页 |
2.3.4 SecM-Stalled核糖体-肽链复合物中新生肽链组成分析 | 第56页 |
2.3.5 LC-MS/MS新生肽链质谱分析 | 第56页 |
2.4 分析讨论 | 第56-59页 |
第3章 SecM-Stalled核糖体-肽链复合物冷冻电镜结构 | 第59-86页 |
3.1 实验材料 | 第59页 |
3.1.1 实验仪器 | 第59页 |
3.1.2 实验试剂 | 第59页 |
3.2 实验方法 | 第59-75页 |
3.2.1 SecM-Stalled核糖体-肽链复合物的冷冻电镜样品制备 | 第59-63页 |
3.2.2 冷冻电镜样品质量检查和照片收集 | 第63-68页 |
3.2.3 冷冻电镜数据处理 | 第68-73页 |
3.2.4 SecM-Stalled核糖体-肽链复合物原子模型搭建 | 第73-75页 |
3.3 实验结果 | 第75-85页 |
3.3.1 SecM-Stalled核糖体-肽链复合物的电子密度图质量分析 | 第75-77页 |
3.3.2 SecM-Stalled核糖体-肽链复合物的冷冻电镜结构 | 第77-79页 |
3.3.3 SecM-Stalled核糖体-肽链复合物中新生肽链原子模型 | 第79-84页 |
3.3.4 SecM-Gly-RNC与SecM-Pro-RNC复合物结构分析 | 第84-85页 |
3.4 分析讨论 | 第85-86页 |
第4章 SecM暂停核糖体翻译的作用机制 | 第86-102页 |
4.1 实验方法 | 第86-88页 |
4.2 实验结果 | 第88-101页 |
4.2.1 SecM诱导核糖体构象变化 | 第88-92页 |
4.2.2 SecM-Gly-RNC中新生肽链与肽链输出通道相互作用 | 第92-94页 |
4.2.3 SecM-Gly-RNC中PTC中心失活 | 第94-96页 |
4.2.4 SecM-Pro-RNC中新生肽链与肽链输出通道相互作用 | 第96-99页 |
4.2.5 SecM-Pro-RNC中A/P*-tRNA与P-loop相互作用不稳定 | 第99-101页 |
4.3 分析讨论 | 第101-102页 |
第5章 总结与展望 | 第102-107页 |
5.1 总结 | 第102-105页 |
5.1.1 SecM-Gly-RNC中SecM诱导翻译暂停的机制 | 第102-104页 |
5.1.2 SecM-Pro-RNC中SecM诱导翻译暂停的机制 | 第104-105页 |
5.2 展望 | 第105-107页 |
参考文献 | 第107-117页 |
致谢 | 第117-119页 |
个人简历、在学期间发表的学术论文与研究成果 | 第119页 |