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SecM暂停核糖体多步翻译延伸机制研究

摘要第3-4页
Abstract第4-5页
主要英文缩略词对照表第9-10页
第1章 引言第10-44页
    1.1 核糖体的结构与功能第10-17页
        1.1.1 核糖体的结构第12-14页
        1.1.2 原核细菌核糖体的翻译第14-17页
    1.2 核糖体翻译暂停第17-35页
        1.2.1 蛋白质质量控制第17-18页
        1.2.2 肽链输出通道与新生肽链第18-20页
        1.2.3 肽键生成速率调控翻译第20-21页
        1.2.4 新生肽链调控翻译第21-27页
        1.2.5 SecM暂停核糖体翻译研究进展第27-35页
    1.3 冷冻电子显微学第35-43页
        1.3.1 透射电子显微镜概述第35-36页
        1.3.2 透射电子显微镜样品制备第36-38页
        1.3.3 单颗粒三维重构第38-41页
        1.3.4 冷冻电子显微镜技术的发展第41-43页
    1.4 本课题的研究意义第43-44页
第2章 SecM-Stalled核糖体-肽链复合物纯化与性质第44-59页
    2.1 实验材料第44-46页
        2.1.1 实验仪器第44-45页
        2.1.2 实验试剂第45-46页
    2.2 实验方法第46-50页
        2.2.1 质粒构建第46-47页
        2.2.2 SecM暂停核糖体翻译时间优化第47-48页
        2.2.3 SecM-Stalled核糖体-肽链复合物的表达与纯化第48-49页
        2.2.4 SecM-Stalled核糖体-肽链复合物的解聚第49页
        2.2.5 LC-MS/MS质谱分析第49-50页
    2.3 实验结果第50-56页
        2.3.1 SecM暂停核糖体翻译时间确定第50-52页
        2.3.2 SecM-Stalled核糖体-肽链复合物的纯化第52-54页
        2.3.3 SecM-Stalled核糖体-肽链复合物中新生肽链纯化第54-56页
        2.3.4 SecM-Stalled核糖体-肽链复合物中新生肽链组成分析第56页
        2.3.5 LC-MS/MS新生肽链质谱分析第56页
    2.4 分析讨论第56-59页
第3章 SecM-Stalled核糖体-肽链复合物冷冻电镜结构第59-86页
    3.1 实验材料第59页
        3.1.1 实验仪器第59页
        3.1.2 实验试剂第59页
    3.2 实验方法第59-75页
        3.2.1 SecM-Stalled核糖体-肽链复合物的冷冻电镜样品制备第59-63页
        3.2.2 冷冻电镜样品质量检查和照片收集第63-68页
        3.2.3 冷冻电镜数据处理第68-73页
        3.2.4 SecM-Stalled核糖体-肽链复合物原子模型搭建第73-75页
    3.3 实验结果第75-85页
        3.3.1 SecM-Stalled核糖体-肽链复合物的电子密度图质量分析第75-77页
        3.3.2 SecM-Stalled核糖体-肽链复合物的冷冻电镜结构第77-79页
        3.3.3 SecM-Stalled核糖体-肽链复合物中新生肽链原子模型第79-84页
        3.3.4 SecM-Gly-RNC与SecM-Pro-RNC复合物结构分析第84-85页
    3.4 分析讨论第85-86页
第4章 SecM暂停核糖体翻译的作用机制第86-102页
    4.1 实验方法第86-88页
    4.2 实验结果第88-101页
        4.2.1 SecM诱导核糖体构象变化第88-92页
        4.2.2 SecM-Gly-RNC中新生肽链与肽链输出通道相互作用第92-94页
        4.2.3 SecM-Gly-RNC中PTC中心失活第94-96页
        4.2.4 SecM-Pro-RNC中新生肽链与肽链输出通道相互作用第96-99页
        4.2.5 SecM-Pro-RNC中A/P*-tRNA与P-loop相互作用不稳定第99-101页
    4.3 分析讨论第101-102页
第5章 总结与展望第102-107页
    5.1 总结第102-105页
        5.1.1 SecM-Gly-RNC中SecM诱导翻译暂停的机制第102-104页
        5.1.2 SecM-Pro-RNC中SecM诱导翻译暂停的机制第104-105页
    5.2 展望第105-107页
参考文献第107-117页
致谢第117-119页
个人简历、在学期间发表的学术论文与研究成果第119页

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