| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-9页 |
| 缩略词表 | 第10-11页 |
| 引言 | 第11-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-28页 |
| 1 豆科植物研究进展 | 第12-13页 |
| 2 转座元件概述 | 第13-18页 |
| 2.1 转座元件的结构和分类 | 第13-15页 |
| 2.2 转座元件的鉴定 | 第15-17页 |
| 2.3 转座元件的分布 | 第17页 |
| 2.4 转座元件对基因和基因组的影响 | 第17-18页 |
| 3 高等植物Helitron转座元件概述 | 第18-28页 |
| 3.1 Helitron的结构特征 | 第19-20页 |
| 3.2 Helitron的鉴定和分类 | 第20-22页 |
| 3.2.1 Helitron的鉴定 | 第21页 |
| 3.2.2 Helitron的分类 | 第21-22页 |
| 3.3 Helitron的基因组含量和分布 | 第22页 |
| 3.4 Helitron的扩增与基因片段的捕获 | 第22-26页 |
| 3.4.1 转座扩增的机制 | 第22-23页 |
| 3.4.2 扩增过程中的插入 | 第23-24页 |
| 3.4.3 基因片段的捕获 | 第24-26页 |
| 3.5 Helitron的水平转移 | 第26-28页 |
| 第二章 Helitron转座元件的鉴定和注释 | 第28-36页 |
| 1 材料与方法 | 第28-29页 |
| 1.1 实验用的豆科植物及数据来源 | 第28页 |
| 1.2 生物信息学分析所用到的软件和程序 | 第28页 |
| 1.3 主要分析方法及流程 | 第28-29页 |
| 2 结果与分析 | 第29-34页 |
| 2.1 Helitron转座元件的数量和基因组含量 | 第29页 |
| 2.2 Helitron转座元件的结构特征 | 第29-31页 |
| 2.3 Helitron转座元件组分分析 | 第31-33页 |
| 2.4 Helitron转座元件在染色体上的分布 | 第33-34页 |
| 3 讨论 | 第34-36页 |
| 第三章 Helitron转座元件与功能基因的关系 | 第36-46页 |
| 1 材料与方法 | 第36-37页 |
| 1.1 数据来源 | 第36页 |
| 1.2 用到的软件和程序 | 第36页 |
| 1.3 主要分析方法及流程 | 第36-37页 |
| 2 结果与分析 | 第37-44页 |
| 2.1 Helitron插入到基因附近 | 第37-39页 |
| 2.2 Helitron的插入到基因内部 | 第39-40页 |
| 2.3 Helitron捕获基因或基因片段 | 第40-44页 |
| 3 讨论 | 第44-46页 |
| 第四章 Helitron转座元件的表达和系统进化树分析 | 第46-56页 |
| 1 材料与方法 | 第46-47页 |
| 1.1 数据来源 | 第46页 |
| 1.2 用到的软件和程序 | 第46页 |
| 1.3 主要分析方法及流程 | 第46-47页 |
| 2 结果与分析 | 第47-53页 |
| 2.1 Helitron转座元件的表达分析 | 第47-49页 |
| 2.2 Helitron转座元件与microRNA的关系 | 第49-52页 |
| 2.3 Helitron转座元件的系统进化树分析 | 第52-53页 |
| 3 讨论 | 第53-56页 |
| 全文结论 | 第56-58页 |
| 参考文献 | 第58-70页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第70-72页 |
| 附录 | 第72-94页 |
| 致谢 | 第94页 |
