致谢 | 第4-5页 |
摘要 | 第5-7页 |
ABSTRACT | 第7-8页 |
英文缩略词 | 第9-14页 |
第一部分 全外显子组测序技术鉴定1个Olmsted综合征家系的致病基因 | 第14-54页 |
1 引言 | 第14-20页 |
1.1 Olmsted综合征及其分子遗传学研究 | 第14-17页 |
1.1.1 Olmsted综合征的临床特征 | 第14-15页 |
1.1.2 Olmsted综合征的分子遗传学 | 第15-16页 |
1.1.3 Olmsted综合征与其他PPK的鉴别诊断 | 第16-17页 |
1.2 全外显子组测序技术 | 第17-20页 |
1.2.1 全外显子组测序技术简介 | 第17页 |
1.2.2 全外显子组测序技术的优势及挑战 | 第17-19页 |
1.2.3 全外显子组测序技术在孟德尔病中的应用 | 第19-20页 |
2 实验材料与方法 | 第20-31页 |
2.1 主要溶液和试剂 | 第20-22页 |
2.2 主要仪器 | 第22页 |
2.3 相关搜索网站及软件 | 第22-23页 |
2.4 实验方法 | 第23-31页 |
2.4.1 Olmsted综合征家系的收集 | 第23-24页 |
2.4.2 基因组DNA的提取和纯化 | 第24-26页 |
2.4.3 PCR扩增KRT9和KRT1基因的编码区 | 第26-28页 |
2.4.4 Sanger DNA测序 | 第28页 |
2.4.5 全外显子组测序 | 第28-29页 |
2.4.6 全外显子组测序数据的生物信息学分析 | 第29-30页 |
2.4.7 基因变异体的Sanger DNA测序验证 | 第30-31页 |
3 实验结果 | 第31-38页 |
3.1 EPPK相关致病基因突变的排除 | 第31页 |
3.2 全外显子组测序寻找致病基因的结果 | 第31-34页 |
3.2.1 WES的质量 | 第31-32页 |
3.2.2 WES所发现的突变 | 第32-34页 |
3.3 KRT10及TRPV3基因突变的验证 | 第34-38页 |
4 讨论 | 第38-47页 |
5 结论 | 第47-48页 |
参考文献 | 第48-54页 |
第二部分 4个EPPK家系的KRT9基因突变谱分析及产前DNA诊断 | 第54-79页 |
1 掌跖角化症概述 | 第54-61页 |
1.1 掌跖角化症和表皮松解性掌跖角化症(EPPK) | 第54-56页 |
1.2 角蛋白 | 第56-58页 |
1.3 EPPK的致病基因 | 第58-60页 |
1.4 产前DNA诊断在EPPK中的应用 | 第60-61页 |
2 实验材料与方法 | 第61-65页 |
2.1 EPPK家系的收集 | 第61-63页 |
2.2 基因组DNA的纯化及PCR扩增KRT9基因编码区 | 第63-64页 |
2.3 正、反向Sanger DNA测序 | 第64页 |
2.4 AS-PCR验证KRT9基因突变 | 第64页 |
2.5 基于已知DNA致病突变的EPPK高风险胎儿的产前DNA诊断 | 第64-65页 |
3 实验结果 | 第65-71页 |
3.1 正、反向Sanger测序的结果 | 第65-68页 |
3.2 AS-PCR验证KRT9基因突变的结果 | 第68-69页 |
3.3 胎儿产前DNA诊断正、反向Sanger测序的结果 | 第69-71页 |
4 讨论 | 第71-73页 |
5 结论 | 第73-74页 |
参考文献 | 第74-79页 |
综述 | 第79-89页 |
参考文献 | 第85-89页 |
个人简介及硕士学习期间发表的论文 | 第89页 |