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毛白杨纤维素合酶基因PtoCesA4的克隆、表达及SNPs分析

摘要第1-5页
ABSTRACT第5-7页
缩写词表第7-12页
引言第12-13页
技术路线第13-14页
1 文献综述第14-19页
   ·纤维素合酶第14-16页
     ·玫瑰花环复合体第14页
     ·纤维素在细胞中合成的位置第14-15页
     ·纤维素合酶在植物中的研究第15-16页
     ·研究细胞壁合成的网络资源第16页
   ·实时定量PCR第16-19页
     ·实时定量PCR原理及术语第16页
     ·荧光染料SYBR Green Ⅰ第16-17页
     ·实时定量PCR程序的优化第17页
     ·数据分析方法第17-19页
2 毛白杨CesA4基因cDNA克隆及编码蛋白分析第19-33页
   ·材料、试剂及主要仪器第19-20页
     ·植物材料第19页
     ·试剂第19页
     ·主要仪器第19页
     ·载体及感受态细胞第19-20页
   ·试验方法第20-24页
     ·毛白杨CesA4基因电子克隆及引物设计第20页
     ·毛白杨总RNA提取第20-21页
     ·毛白杨cDNA合成第21-22页
     ·PCR扩增产物回收及纯化第22-23页
     ·目的片段连接至pGEM-T Easy载体第23页
     ·转化大肠杆菌感受态第23-24页
     ·菌落PCR检测第24页
     ·毛白杨CesA4基因的生物信息学分析第24页
     ·毛白杨CesA4蛋白结构分析及基因家族树分析第24页
   ·结果与分析第24-30页
     ·毛白杨纤维素合酶cDNA克隆及分析第24-26页
     ·PtoCesA4蛋白生物信息学分析第26-28页
     ·杨属及拟南芥CesA蛋白酶系统进化分析第28-30页
   ·讨论第30-32页
     ·毛白杨纤维素合酶基因命名第30-31页
     ·毛白杨纤维素合酶三维结构分析第31-32页
   ·小结第32-33页
3 毛白杨PtoCesA4基因组DNA克隆及系统发育进化分析第33-44页
   ·材料、试剂及主要仪器第33页
     ·植物材料第33页
     ·试剂第33页
     ·主要仪器第33页
     ·载体及感受态细胞第33页
   ·试验方法第33-36页
     ·毛白杨总DNA提取第33-34页
     ·纯化回收PCR产物第34-35页
     ·载体pGEM-T Easy与目的片段相连第35页
     ·大肠杆菌感受态的转化第35页
     ·PCR检测单克隆菌落第35-36页
     ·PtoCesA4基因组DNA的结构及比较基因组学分析第36页
     ·植物纤维素合酶系统进化分析第36页
   ·结果与分析第36-41页
     ·PtoCesA4基因及拟南芥纤维素合酶基因的结构第36-37页
     ·PtoCesA4基因启动子分析第37-38页
     ·比较基因组学分析第38-39页
     ·植物纤维素合酶系统进化分析第39-41页
   ·讨论第41-43页
     ·纤维素合酶的比较基因组第41-42页
     ·CesA基因启动子第42页
     ·植物纤维素合酶系统发育进化第42-43页
   ·小结第43-44页
4 组织器官特异表达分析第44-50页
   ·材料、试剂及主要仪器第44页
     ·植物材料第44页
     ·主要试剂第44页
     ·主要仪器第44页
   ·试验方法第44-46页
     ·实时荧光定量PCR引物设计第44页
     ·各组织器官总RNA提取第44-45页
     ·各组织器官第一链cDNA合成第45页
     ·实时荧光定量PCR第45-46页
     ·各组织器官表达量分析第46页
   ·结果与分析第46-48页
     ·引物设计第46页
     ·RNA提取质量检查第46-47页
     ·各组织器官表达分析第47-48页
   ·讨论第48页
     ·内参选择第48页
     ·植物CesA4,7,8基因的表达模式及功能第48页
   ·小结第48-50页
5 PtoCesA4基因单核苷酸多态性分析第50-58页
   ·材料、试剂及主要仪器第51页
     ·植物材料第51页
     ·试剂及主要仪器第51页
     ·载体及感受态细胞第51页
   ·实验方法第51页
     ·样本总DNA提取第51页
     ·各样品PtoCesA4基因组DNA的克隆及测序第51页
     ·PtoCesA4基因的SNPs分析和LD检测第51页
   ·结果与分析第51-56页
     ·克隆基因的拼接及SNPs分析第51-53页
     ·SNPs变化引起的氨基酸变化第53-54页
     ·SNPs重组及连锁不平衡分析第54-56页
   ·讨论第56页
     ·基于候选基因中SNPs的LD作图第56页
     ·用于LD作图的群体选择第56页
   ·小结第56-58页
6 结论与展望第58-61页
   ·结论第58-59页
   ·展望第59-61页
参考文献第61-65页
个人简介第65-66页
导师简介1——张志毅教授第66-67页
导师简介2——张德强教授第67-68页
致谢第68页

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