| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第一章 绪论 | 第10-29页 |
| 1. 真菌线粒体基因组 | 第10-11页 |
| 1.1 线粒体简介 | 第10页 |
| 1.2 真菌线粒体的研究史 | 第10-11页 |
| 1.3 真菌线粒体基因组的组成 | 第11页 |
| 2. 真菌线粒体基因组的进化 | 第11-18页 |
| 2.1 线粒体基因组在真菌分类学及系统发育中的运用 | 第12-13页 |
| 2.2 真菌线粒体基因组的进化途径 | 第13-18页 |
| 2.2.1 进化过程之一：线粒体基因与细胞核基因共同进化 | 第14-15页 |
| 2.2.2 进化过程之二：真菌线粒体基因组向大基因组或小基因组方向进化 | 第15-18页 |
| 3. 真菌线粒体基因组的大小变化 | 第18-21页 |
| 3.1 内含子的理论研究 | 第18-20页 |
| 3.2 线粒体质粒的研究 | 第20-21页 |
| 4. 23个担子菌代表性物种线粒体基因组的研究 | 第21-22页 |
| 5. 暗褐网柄牛肝菌菌株PP33的线粒体基因组研究 | 第22-23页 |
| 6. 暗褐网柄牛肝菌群体多样性研究 | 第23-27页 |
| 7. 本研究拟解决的问题及意义 | 第27-29页 |
| 第二章 真菌线粒体基因组大小变化研究 | 第29-50页 |
| 1. 前言 | 第29页 |
| 2. 材料、仪器及方法 | 第29-30页 |
| 2.1. 材料 | 第29页 |
| 2.2. 仪器 | 第29页 |
| 2.3. 实验方法 | 第29-30页 |
| 3. 结果与分析 | 第30-48页 |
| 3.1. 物种内线粒体基因组大小变化 | 第30页 |
| 3.2. 物种间线粒体基因组大小变化 | 第30-38页 |
| 3.3. 23个担子菌物种线粒体基因组尺寸与内含子数量关系的研究 | 第38-43页 |
| 3.4. 23个担子菌物种多基因系统学研究 | 第43-48页 |
| 4. 本章讨论 | 第48-50页 |
| 第三章 暗褐网柄牛肝菌菌株PP33线粒体基因组研究 | 第50-68页 |
| 1. 前言 | 第50-51页 |
| 2. 材料、仪器及方法 | 第51-54页 |
| 2.1. 材料 | 第51页 |
| 2.2. 仪器 | 第51页 |
| 2.3. 实验方法 | 第51-54页 |
| 2.3.1 提取暗褐网柄牛肝菌菌株PP33的线粒体基因组序列 | 第51-52页 |
| 2.3.2 暗褐网柄牛肝菌菌株PP33线粒体基因组的可靠性验证 | 第52页 |
| 2.3.3 暗褐网柄牛肝菌菌株PP33线粒体基因组的注释 | 第52-54页 |
| 2.3.4 暗褐网柄牛肝菌菌株PP33线粒体基因组的绘图 | 第54页 |
| 3. 结果与分析 | 第54-67页 |
| 3.1. 暗褐网柄牛肝菌菌株PP33线粒体基因组的注释 | 第54-56页 |
| 3.2. 暗褐网柄牛肝菌菌株PP33线粒体基因组的绘图 | 第56-57页 |
| 3.3. 暗褐网柄牛肝菌菌株PP33线粒体cox1基因的研究 | 第57-67页 |
| 3.3.1 暗褐网柄牛肝菌菌株PP33线粒体cox1基因上4个内含子开放阅读框的研究 | 第57-59页 |
| 3.3.2 担子菌物种COX1基因与线粒体基因组关系的研究 | 第59-63页 |
| 3.3.3 暗褐网柄牛肝菌菌株PP33与23个担子菌的系统发育 | 第63-67页 |
| 4. 本章讨论 | 第67-68页 |
| 第四章 暗褐网柄牛肝菌的群体遗传多样性研究 | 第68-92页 |
| 1. 前言 | 第68页 |
| 2. 材料、仪器及方法 | 第68-77页 |
| 2.1. 材料 | 第68-69页 |
| 2.2. 试剂及仪器 | 第69页 |
| 2.3 实验方法 | 第69-77页 |
| 3 结果与分析 | 第77-89页 |
| 3.1. 序列分析 | 第77-80页 |
| 3.1.1. 序列正确性核对 | 第77-78页 |
| 3.1.2. 基于现有测序的4个内含子序列的联合建树及系统发育分析 | 第78-80页 |
| 3.2. 遗传多样性及群体结构分析 | 第80-89页 |
| 3.2.1 样品采样地位置信息 | 第81-84页 |
| 3.2.2 AMOVA分析 | 第84-85页 |
| 3.2.3 Mantel检测 | 第85-87页 |
| 3.2.4 重组分析 | 第87-89页 |
| 4. 本章讨论 | 第89-92页 |
| 4.1 暗褐网柄牛肝菌群体间的基因流 | 第89-90页 |
| 4.2 重组检测 | 第90-92页 |
| 第五章 全文总结与展望 | 第92-95页 |
| 参考文献 | 第95-102页 |
| 攻读硕士学位期间完成的科研成果 | 第102-103页 |
| 致谢 | 第103-104页 |
