| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第一章 绪论 | 第13-71页 |
| 1.1. Cdc25酶的结构及功能 | 第13-18页 |
| 1.2. Cdc25磷酸蛋白酶抑制剂的发现及进展 | 第18-31页 |
| 1.2.1 Cdc25磷酸蛋白酶抑制剂的研究进展 | 第18-26页 |
| 1.2.2 Cdc25磷酸蛋白酶抑制剂的抑制机理研究进展 | 第26-31页 |
| 1.3. 计算机辅助药物设计(CADD)—药效团模型及分子对接 | 第31-48页 |
| 1.3.1 CADD概况及3D药效团模型虚拟筛选方法 | 第31-35页 |
| 1.3.2 药效团模型构建的工具—GALAHAD~(TM)程序 | 第35-41页 |
| 1.3.3 分子对接方法简介 | 第41-48页 |
| 1.3.3.1 AutoDock软件 | 第41-45页 |
| 1.3.3.2 Surflex_Dock~(TM)程序 | 第45-48页 |
| 1.4. 分子动力学(MD)在蛋白酶体系中的应用—AMBER软件 | 第48-55页 |
| 1.4.1 分子动力学简介 | 第48-51页 |
| 1.4.2 分子动力学模拟及分析工具—AMBER软件 | 第51-55页 |
| 1.5. 本论文的选题思路、目的及主要创新点 | 第55-56页 |
| 1.5.1 本论文的选题思路及目的 | 第55-56页 |
| 1.5.2 本论文的创新点 | 第56页 |
| 参考文献 | 第56-71页 |
| 第二章 计算机辅助新型Cdc25A酶抑制剂的筛选及发现 | 第71-103页 |
| 2.1. 前言 | 第71-72页 |
| 2.2. Cdc25A催化结构域的模建 | 第72-77页 |
| 2.2.1 实验仪器及方法 | 第72页 |
| 2.2.2 实验结果及分析 | 第72-77页 |
| 2.3. 基于不同小分子骨架结构的药效团模型的构建 | 第77-84页 |
| 2.3.1 实验仪器及方法 | 第77-79页 |
| 2.3.2 实验结果及分析 | 第79-84页 |
| 2.4. 基于药效团模型的测试集检验及虚拟筛选 | 第84-89页 |
| 2.4.1 数据库准备及实验方法 | 第84页 |
| 2.4.2 实验结果及分析 | 第84-89页 |
| 2.5. 批量分子对接筛选潜在活性抑制剂 | 第89-100页 |
| 2.5.1 结构准备及实验方法 | 第89页 |
| 2.5.2 实验结果及分析 | 第89-100页 |
| 2.6. 本章小结 | 第100页 |
| 参考文献 | 第100-103页 |
| 第三章 潜在Cdc25A酶抑制剂的生物活性检测 | 第103-124页 |
| 3.1. 前言 | 第103-104页 |
| 3.2. 潜在Cdc25A酶活性抑制化合物对Hela及Hek293细胞生长毒性测试 | 第104-110页 |
| 3.2.1 试剂及仪器 | 第104-105页 |
| 3.2.2 实验方法 | 第105-106页 |
| 3.2.3 实验结果及分析 | 第106-110页 |
| 3.3. 潜在Cdc25A酶活性抑制化合物对Hela细胞生长周期影响 | 第110-118页 |
| 3.3.1 试剂及仪器 | 第110-111页 |
| 3.3.2 实验方法 | 第111-112页 |
| 3.3.3 实验结果及分析 | 第112-118页 |
| 3.4. 潜在活性抑制化合物对Cdc25A酶活性抑制检测 | 第118-121页 |
| 3.4.1 试剂及仪器 | 第118页 |
| 3.4.2 实验方法 | 第118-119页 |
| 3.4.3 实验结果及讨论 | 第119-121页 |
| 3.5. 本章小结 | 第121页 |
| 参考文献 | 第121-124页 |
| 第四章 抑制剂NSC663284与Cdc25B磷酸酶结合位点及模式的分子模拟鉴定及研究 | 第124-162页 |
| 4.1. 前言 | 第124-126页 |
| 4.2. Cdc25B磷酸酶蛋白晶体结构的稳定性研究 | 第126-132页 |
| 4.2.1 实验方法 | 第126-127页 |
| 4.2.2 实验结果及分析 | 第127-132页 |
| 4.3. 分子对接初步研究NSC663284在Cdc25B磷酸酶上的结合模式 | 第132-140页 |
| 4.3.1 实验方法 | 第132-134页 |
| 4.3.2 实验结果及分析 | 第134-140页 |
| 4.4. 分子动力学模拟鉴定小分子NSC663284在Cdc25B磷酸蛋白酶上的结合位点 | 第140-145页 |
| 4.4.1 实验方法与参数 | 第140页 |
| 4.4.2 实验结果及分析 | 第140-145页 |
| 4.5. NSC663284在Cdc25B磷酸酶位点Ⅰ区域的结合特征及稳定性 | 第145-154页 |
| 4.5.1 实验方法与参数 | 第145-146页 |
| 4.5.2 实验结果及分析 | 第146-154页 |
| 4.6. 聚类分析小分子NSC663284在位点Ⅰ区域的稳定结合模式 | 第154-158页 |
| 4.6.1 实验方法及参数 | 第154-155页 |
| 4.6.2 实验结果及分析 | 第155-158页 |
| 4.7. 本章小结 | 第158-159页 |
| 参考文献 | 第159-162页 |
| 第五章 三种生物大分子与小分子体系作用的分子对接 | 第162-192页 |
| 5.1. 前言 | 第162-163页 |
| 5.2. 姜黄素及其洐生物与人血清白蛋白相互作用的对比研究 | 第163-174页 |
| 5.2.1 实验方法及参数 | 第163-165页 |
| 5.2.1.1 稳态荧光实验 | 第163-164页 |
| 5.2.1.2 分子对接实验 | 第164-165页 |
| 5.2.2. 实验结果及分析 | 第165-174页 |
| 5.2.2.1 姜黄素及其衍生物与HSA相互作用的荧光猝灭常数及结合位点 | 第165-169页 |
| 5.2.2.2 分子对接实验结果及分析 | 第169-174页 |
| 5.3. 小分子探针在DNA双链松驰结构上的结合作用 | 第174-179页 |
| 5.3.1 实验方法及参数 | 第174-175页 |
| 5.3.2 实验结果及分析 | 第175-179页 |
| 5.4. 不同链长阴离子型双子表面活性剂与牛血清白蛋白的分子对接 | 第179-189页 |
| 5.4.1 实验参数及方法 | 第179-181页 |
| 5.4.1.1 表面活性剂及血清蛋白溶液体系中的荧光光谱及圆二色谱检测 | 第179-180页 |
| 5.4.1.2 分子对接实验结构准备及参数 | 第180-181页 |
| 5.4.2 实验结果及分析 | 第181-189页 |
| 5.4.2.1 三种表面活性剂在BSA溶液中的CAC测定 | 第181-183页 |
| 5.4.2.2 三种表面活性剂对BSA蛋白二级结构的影响 | 第183-184页 |
| 5.4.2.3 分子对接研究结果 | 第184-189页 |
| 5.5. 本章小结 | 第189-190页 |
| 参考文献 | 第190-192页 |
| 第六章 总结与展望 | 第192-195页 |
| 6.1 总结 | 第192-193页 |
| 6.2 展望 | 第193-195页 |
| 攻博期间参与发表的论文 | 第195-197页 |
| 致谢 | 第197-198页 |
