| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 缩略词表 | 第10-11页 |
| 第一章 前言 | 第11-21页 |
| 1.1 谷氨酸棒状杆菌概述 | 第11-12页 |
| 1.2 谷氨酸棒状杆菌表达系统研究进展 | 第12-16页 |
| 1.2.1 C. glutamicum表达系统面临的挑战 | 第12-13页 |
| 1.2.2 C. glutamicum表达系统的优化研究 | 第13-16页 |
| 1.3 C. glutamicum代谢研究进展 | 第16-18页 |
| 1.3.1 外源蛋白的表达与能量代谢的关系 | 第17页 |
| 1.3.2 DO对外源蛋白表达的影响 | 第17-18页 |
| 1.4 研究方法 | 第18-19页 |
| 1.4.1 转录组学的发展及应用 | 第18页 |
| 1.4.2 多变元分析的介绍及应用 | 第18-19页 |
| 1.5 本文的立题依据及主要研究内容 | 第19-21页 |
| 第二章 发酵罐水平不同DO对C. glutamicum BZH001转录组及代谢的影响 | 第21-56页 |
| 2.1 前言 | 第21页 |
| 2.2 材料与方法 | 第21-30页 |
| 2.2.1 材料 | 第21-22页 |
| 2.2.2 方法 | 第22-30页 |
| 2.3 结果与讨论 | 第30-53页 |
| 2.3.1 DO与能量代谢的关系以及OUR检测 | 第30-31页 |
| 2.3.2 平行发酵系统CUBER 4 的建立 | 第31-37页 |
| 2.3.3 RNA-seq概述 | 第37-42页 |
| 2.3.4 差异表达基因的GO功能和Pathway分析 | 第42-45页 |
| 2.3.5 不同溶解氧对生物量的影响 | 第45-46页 |
| 2.3.6 碳代谢 | 第46-48页 |
| 2.3.7 有机酸代谢 | 第48-49页 |
| 2.3.8 关键酶活分析 | 第49-50页 |
| 2.3.9 氨基酸代谢 | 第50-51页 |
| 2.3.10 能量代谢 | 第51-53页 |
| 2.4 本章小结 | 第53-56页 |
| 第三章 发酵罐水平不同DO对工程菌C. glutamicum eGFP转录组及代谢的影响 | 第56-71页 |
| 3.1 前言 | 第56页 |
| 3.2 材料与方法 | 第56-57页 |
| 3.2.1 材料 | 第56-57页 |
| 3.2.2 方法 | 第57页 |
| 3.3 结果和讨论 | 第57-69页 |
| 3.3.1 不同DO水平对C. glutamicum eGFP菌体生长及葡萄糖消耗的影响 | 第57-58页 |
| 3.3.2 转录组数据全局分析 | 第58-60页 |
| 3.3.3 不同DO条件下差异表达基因分析 | 第60页 |
| 3.3.4 差异表达基因聚类分析 | 第60-61页 |
| 3.3.5 差异表达基因pathway及GO功能分析 | 第61-65页 |
| 3.3.6 不同DO对C. glutamicum eGFP代谢产物的影响 | 第65-69页 |
| 3.4 本章小结 | 第69-71页 |
| 第四章 谷氨酸棒状杆菌表达系统能量利用相关基因的挖掘 | 第71-94页 |
| 4.1 前言 | 第71页 |
| 4.2 材料与方法 | 第71-72页 |
| 4.2.1 材料 | 第71-72页 |
| 4.2.2 软件 | 第72页 |
| 4.3 结果与讨论 | 第72-93页 |
| 4.3.1 eGFP表达对细胞代谢和转录的影响分析 | 第72-83页 |
| 4.3.2 RNA-seq及代谢数据的多变元分析 | 第83-93页 |
| 4.4 本章小结 | 第93-94页 |
| 第五章 能量利用关键基因的功能验证及应用 | 第94-123页 |
| 5.1 引言 | 第94页 |
| 5.2 材料与方法 | 第94-100页 |
| 5.2.1 菌株、质粒和引物 | 第94-96页 |
| 5.2.2 工具酶和试剂 | 第96页 |
| 5.2.3 培养基和培养条件 | 第96-97页 |
| 5.2.4 C. glutamicum感受态细胞的制备 | 第97页 |
| 5.2.5 E. coli感受态制备 | 第97-98页 |
| 5.2.6 C. glutamicum的电击转化法 | 第98页 |
| 5.2.7 基因敲除载体的构建 | 第98-99页 |
| 5.2.8 过表达载体的构建 | 第99-100页 |
| 5.2.9 SDS-PAGE实验方法 | 第100页 |
| 5.2.10 α-淀粉酶酶活检测 | 第100页 |
| 5.3 结果与讨论 | 第100-122页 |
| 5.3.1 NCgl1522基因功能研究 | 第100-108页 |
| 5.3.2 NCgl0909基因功能研究 | 第108-115页 |
| 5.3.3 NCgl2632基因功能研究 | 第115-120页 |
| 5.3.4 淀粉酶和ScFv表达验证试验 | 第120-122页 |
| 5.4 本章小结 | 第122-123页 |
| 主要结论与展望 | 第123-125页 |
| 主要结论 | 第123-124页 |
| 展望 | 第124-125页 |
| 论文创新点 | 第125-126页 |
| 致谢 | 第126-127页 |
| 参考文献 | 第127-134页 |
| 附录: 作者在攻读博士学位期间发表的论文 | 第134页 |
