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猪骨骼肌相关miRNA的鉴定及miR-378对肌肉发育调控的研究

摘要第6-9页
ABSTRACT第9-11页
第一部分 文献综述第12-46页
    第一章 肌肉生长发育的研究现状第12-24页
        1 肌肉发育概述第12-14页
            1.1 胚胎期肌肉的发育第13页
            1.2 成年期的肌肉再生第13-14页
        2 肌肉发育过程中的重要基因及调控第14-16页
            2.1 Pax基因在肌肉发育过程中的作用第14页
            2.2 MRFs基因在肌肉发育过程中的作用第14-15页
            2.3 肌肉发育的分子调控机制第15-16页
        3 影响肌肉发育的其它因素第16-18页
            3.1 Myostatin对肌肉发育的影响第16-17页
            3.2 激素水平对肌肉发育的影响第17页
            3.3 营养水平对肌肉发育的影响第17-18页
        参考文献第18-24页
    第二章 microRNA的研究进展第24-46页
        1 microRNA(miRNA)的发现第24页
        2 miRNA的产生机制第24-29页
            2.1 miRNA的转录第24-25页
            2.2 miRNA的成熟第25-27页
            2.3 RISC的组装第27-29页
        3 miRNA对靶基因的调控作用机制第29页
        4 miRNA的生物学功能第29-32页
            4.1 对分化及细胞周期的影响第29-30页
            4.2 与癌症的关系第30-31页
            4.3 对肌肉发育的影响第31-32页
        5 新一代测序技术在miRNA研究上的应用第32-33页
        6 miRNA靶标基因的筛选与鉴定第33-34页
            6.1 利用软件预测靶标基因第33页
            6.2 利用基因芯片筛选靶标基因第33-34页
            6.3 利用蛋白组学筛选靶标基因第34页
            6.4 利用免疫共沉淀钓取靶标基因第34页
        参考文献第34-46页
第二部分 实验部分第46-116页
    第一章 利用solexa测序技术鉴定猪骨骼肌相关miRNA第46-92页
        1 材料与方法第47-52页
            1.1 实验动物第47页
            1.2 试剂耗材与仪器第47页
            1.3 RNA的提取第47-48页
            1.4 测序流程简介第48页
            1.5 信息分析流程第48-51页
            1.6 miRNA的反转录第51页
            1.7 定量PCR第51-52页
        2 结果与分析第52-87页
            2.1 sRNA测序结果统计第52-53页
            2.2 sRNA的长度分布统计第53-54页
            2.3 sRNA在基因组中的定位第54页
            2.4 sRNA的分类注释第54-55页
            2.5 已知miRNA统计情况第55-56页
            2.6 novel miRNA预测第56-76页
            2.7 已知mLRNA种子区域碱基编辑统计第76-83页
            2.8 高丰度miRNA组织谱定量PCR检测第83-85页
            2.9 ssc-miR-378在肌肉不同发育阶段的定量PCR检测第85-87页
        3 讨论第87-89页
        参考文献第89-92页
    第二章 miR-378在肌肉发育过程中的生物学功能研究第92-116页
        1 材料与方法第92-99页
            1.1 实验动物第92页
            1.2 试剂耗材与仪器第92-93页
            1.3 C2C12小鼠肌肉卫星细胞的培养第93页
            1.4 PIEC猪血管内皮细胞的培养第93页
            1.5 细胞RNA的提取第93-94页
            1.6 反转录第94页
            1.7 定量PCR第94页
            1.8 细胞的转染第94-95页
            1.9 基因芯片的制备第95-97页
            1.10 GRB2 3’UTR荧光素酶靶标载体的构建第97-99页
            1.11 GRB2 3’UTR荧光素酶靶标载体的验证第99页
        2 结果与分析第99-109页
            2.1 mmu-miR-378在小鼠不同组织的表达情况第99-100页
            2.2 C2C12分化过程中,分化Marker基因及miR-378的表达情况第100-101页
            2.3 基因芯片检测C2C12中过表达miR-378引起的下游基因变化第101-104页
            2.4 miR-378靶标的预测第104-105页
            2.5 miR-378调控GRB2的3’UTR第105-109页
        3 讨论第109-112页
        参考文献第112-116页
全文结论第116-118页
创新第118-120页
致谢第120-122页
论文发表第122页

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