| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 1 绪论 | 第9-14页 |
| 1.1 研究背景 | 第9页 |
| 1.2 研究现状 | 第9-12页 |
| 1.3 存在问题及解决 | 第12-13页 |
| 1.4 本文工作 | 第13页 |
| 1.5 本文结构 | 第13-14页 |
| 2 相关知识及评价指标 | 第14-20页 |
| 2.1 蛋白质功能标注 | 第14-15页 |
| 2.2 蛋白质关系网络 | 第15-16页 |
| 2.3 蛋白质络合物 | 第16-17页 |
| 2.4 评价指标 | 第17-20页 |
| 3 集成生物文献中蛋白质关系提升络合物发现算法性能 | 第20-40页 |
| 3.1 数据集 | 第20-23页 |
| 3.2 算法 | 第23-28页 |
| 3.2.1 抽取生物文献中蛋白质关系 | 第23-25页 |
| 3.2.2 集成生物文献中蛋白质关系 | 第25-26页 |
| 3.2.3 蛋白质络合物发现算法参数设置 | 第26-28页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第28-38页 |
| 3.3.1 ClusterONE在PPI数据集上的实验结果 | 第28-32页 |
| 3.3.2 其他络合物发现算法在PPI数据集上的实验结果 | 第32-34页 |
| 3.3.3 实验结果分析 | 第34-38页 |
| 3.4 本章小结 | 第38-40页 |
| 4 基于监督学习和集成生物文献中蛋白质关系的络合物发现算法 | 第40-56页 |
| 4.1 数据集 | 第40-42页 |
| 4.2 算法 | 第42-47页 |
| 4.2.1 蛋白质关系可信度度量 | 第42-43页 |
| 4.2.2 集成生物文献中蛋白质关系 | 第43-44页 |
| 4.2.3 基于监督学习的蛋白质络合物发现算法 | 第44-47页 |
| 4.3 结果与分析 | 第47-54页 |
| 4.3.1 SLPC在原始PPI网络上的实验结果及分析 | 第47-50页 |
| 4.3.2 SLPC在去噪PPI网络上的实验结果及分析 | 第50-54页 |
| 4.4 本章总结 | 第54-56页 |
| 结论 | 第56-57页 |
| 参考文献 | 第57-60页 |
| 攻读硕士学位期间发表学术论文情况 | 第60-61页 |
| 致谢 | 第61-62页 |
