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基于SSSL的水稻耐冷QTL的定位和聚合效应

摘要第3-5页
Abstract第5-7页
第1章 文献综述第15-35页
    1.1 研究背景第15-33页
        1.1.1 水稻冷害的分类第16-18页
        1.1.2 水稻冷胁迫下的生理变化机理第18-19页
        1.1.3 水稻耐冷资源的评价和鉴定第19-20页
        1.1.4 水稻不同生长发育时期鉴定的耐冷QTL概况第20-21页
        1.1.5 耐冷QTL在染色体上的分布第21-24页
        1.1.6 两个以上不同研究中均检测到的耐冷QTL区间第24-26页
            1.1.6.1 同一发育时期多次检测到的耐冷QTL区间第24-25页
            1.1.6.2 不同发育时期检测到的相同耐冷QTL区间第25-26页
        1.1.7 相同群体不同低温条件和不同发育时期鉴定的耐冷QTL第26-27页
        1.1.8 精细定位和克隆的水稻耐冷QTL第27-29页
        1.1.9 水稻低温信号感知和响应途径第29-30页
        1.1.10 水稻耐冷育种的研究进展第30页
        1.1.11 单片段代换系在水稻QTL定位和分子育种上的应用第30-33页
            1.1.11.1 单片段代换系在水稻QTL定位上的应用第30-32页
            1.1.11.2 单片段代换系在水稻育种上的应用第32-33页
    1.2 研究的目的和意义第33-34页
    1.3 研究的技术路线第34-35页
第2章 水稻四个生长发育时期耐冷性的鉴定及其与籼粳亚种的关系第35-50页
    2.1 引言第35-36页
    2.2 材料与方法第36-40页
        2.2.1 供试材料第36页
        2.2.2 耐冷性的鉴定第36-39页
            2.2.2.1 发芽期耐冷性的鉴定第36页
            2.2.2.2 芽期耐冷性的鉴定第36-38页
            2.2.2.3 苗期耐冷性的鉴定第38页
            2.2.2.4 抽穗开花期耐冷性的鉴定第38-39页
        2.2.3 分子标记检测第39-40页
        2.2.4 数据分析第40页
    2.3 结果第40-49页
        2.3.1 参试水稻品系的遗传多样性第40-42页
        2.3.2 不同生长发育时期的耐冷性第42-45页
            2.3.2.1 发芽期的耐冷性第42页
            2.3.2.2 芽期的耐冷性第42-43页
            2.3.2.3 苗期的耐冷性第43-44页
            2.3.2.4 抽穗开花期的耐冷性第44-45页
            2.3.2.5 四个生长发育时期耐冷性的相关性第45页
        2.3.3 不同生长发育时期耐冷性与籼粳亚种的关系第45-49页
    2.4 小结第49-50页
第3章 水稻芽期耐冷QTL的定位第50-60页
    3.1 引言第50-51页
    3.2 材料与方法第51-53页
        3.2.1 供试材料第51页
            3.2.2.1 发芽期耐冷性的鉴定第51页
            3.2.2.2 芽期耐冷性鉴定第51页
        3.2.3 QTL的效应分析第51-53页
        3.2.4 分子标记验证第53页
        3.2.5 QTL的命名第53页
    3.3 结果第53-59页
        3.3.1 鉴定的发芽期耐冷QTL第53-55页
            3.3.1.1 SSSL群体发芽期的耐冷性第53页
            3.3.1.2 发芽期耐冷QTL的位置和效应第53-55页
        3.3.2 鉴定的芽期耐冷QTL第55-59页
            3.3.2.1 亲本芽期耐冷性差异第55页
            3.3.2.2 芽期耐冷QTL的位置和加性效应第55-59页
    3.4 小结第59-60页
第4章 水稻苗期耐冷QTL的定位第60-72页
    4.1 引言第60-62页
    4.2 材料与方法第62-65页
        4.2.1 供试材料第62-63页
        4.2.2 苗期耐冷性鉴定第63页
        4.2.3 QTL的效应分析第63页
        4.2.4 分子标记验证第63-64页
        4.2.5 QTL的命名第64-65页
    4.3 结果第65-71页
        4.3.1 2 个亲本苗期耐冷性差异显著第65-66页
        4.3.2 以冷害等级为指标鉴定出的耐冷QTL第66-67页
        4.3.3 以存活率为指标鉴定出的耐冷QTL第67-70页
        4.3.4 自然低温条件下鉴定出的耐冷QTL第70-71页
    4.4 小结第71-72页
第5章 水稻抽穗开花期耐冷QTL的定位第72-86页
    5.1 引言第72-74页
    5.2 材料与方法第74-77页
        5.2.1 供试材料第74-75页
            5.2.1.1 耐冷QTL鉴定的材料第74页
            5.2.1.2 耐冷QTL精细定位的材料第74-75页
        5.2.2 抽穗开花期耐冷性鉴定第75页
        5.2.3 耐冷QTL的鉴定第75-76页
        5.2.4 QTL的命名第76页
        5.2.5 QTL效应值的估算第76页
        5.2.6 RNA的抽提和反转录第76页
        5.2.7 基因表达芯片的操作程序及数据分析第76页
        5.2.8 引物设计第76页
        5.2.9 分子标记检测第76-77页
        5.2.10 候选基因的预测第77页
    5.3 结果第77-85页
        5.3.1 抽穗开花期耐冷QTL的位置和加性效应第77页
        5.3.2 抽穗开花期耐冷QTL的精细定位第77-85页
            5.3.2.1 抽穗开花期耐冷CSSL的重测序第77-80页
            5.3.2.2 在目标染色体区间差异表达和CDS区有差异的基因第80页
            5.3.2.3 耐冷QTL区间的验证第80-82页
            5.3.2.4 第6染色体上耐冷QTL的精细定位第82-85页
    5.4 小结第85-86页
第6章 水稻耐冷QTL的聚合育种第86-102页
    6.1 引言第86-88页
    6.2 材料与方法第88-92页
        6.2.1 试验材料第88页
        6.2.2 试验方法第88-90页
            6.2.2.1 DNA抽提及分子标记检测第88页
            6.2.2.2 试验材料的种植第88页
            6.2.2.3 纯合聚合系的筛选第88-89页
            6.2.2.4 耐冷表型的鉴定第89-90页
        6.2.3 统计与分析第90-92页
    6.3 结果第92-101页
        6.3.1 获得的耐冷QTL聚合系第92页
        6.3.2 1 份双片段聚合系的芽期耐冷性第92-96页
        6.3.3 3 份双片段聚合系的苗期耐冷性第96-97页
        6.3.4 多份聚合系的大田耐冷性鉴定第97-101页
            6.3.4.1 芽期耐冷性鉴定第97-100页
            6.3.4.2 苗期耐冷性鉴定第100-101页
    6.4 小结第101-102页
第7章 讨论和结论第102-111页
    7.1 讨论第102-108页
        7.1.1 耐冷效应稳定的QTL是提高水稻耐冷性的关键第102-103页
        7.1.2 水稻不同生长发育时期耐冷性的遗传基础大部分不同第103-104页
        7.1.3 与前人定位的耐冷QTL信息的比较第104-106页
        7.1.4 耐冷QTL的聚合能有效提高水稻耐冷性第106-107页
        7.1.5 单片段代换系是开展复杂性状QTL定位和聚合育种的高效工具第107-108页
    7.2 结论第108-111页
致谢第111-112页
参考文献第112-123页
附录第123-131页

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