| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-10页 |
| 第1章 文献综述 | 第11-21页 |
| 1.1 甘蓝型油菜的产量相关性状与收获指数 | 第11-14页 |
| 1.1.1 甘蓝型油菜产量的研究进展 | 第11-13页 |
| 1.1.2 甘蓝型油菜产量相关性状与收获指数的关系 | 第13-14页 |
| 1.2 环境对油菜产量和收获指数的影响 | 第14-15页 |
| 1.2.1 影响油菜产量和收获指数的环境因素 | 第14页 |
| 1.2.2 不同生境下农艺性状与收获指数关系的研究进展 | 第14-15页 |
| 1.3 甘蓝型油菜收获指数与产量性状的QTL定位研究现状 | 第15-17页 |
| 1.4 全基因组关联分析 | 第17-19页 |
| 1.4.1 关联分析的发展 | 第17-18页 |
| 1.4.2 关联分析的方法 | 第18页 |
| 1.4.3 全基因组关联分析在甘蓝型油菜上的应用 | 第18-19页 |
| 1.5 产量相关性状及收获指数相关基因研究现状 | 第19-21页 |
| 第2章 引言 | 第21-23页 |
| 2.1 研究目的与意义 | 第21页 |
| 2.2 研究内容与技术路线 | 第21-23页 |
| 2.2.1 研究内容 | 第21-22页 |
| 2.2.2 技术路线 | 第22-23页 |
| 第3章 材料与方法 | 第23-29页 |
| 3.1 试验材料 | 第23页 |
| 3.2 田间试验设计与性状考察 | 第23-24页 |
| 3.3 表型数据统计分析 | 第24页 |
| 3.4 基因型数据分析 | 第24页 |
| 3.5 主成分和群体结构分析 | 第24页 |
| 3.6 亲缘关系分析 | 第24-25页 |
| 3.7 连锁不平衡分析 | 第25页 |
| 3.8 全基因组关联分析 | 第25页 |
| 3.9 候选基因预测 | 第25-26页 |
| 3.9.1 油菜收获指数基本基因群的挖掘 | 第25页 |
| 3.9.2 油菜高收获指数特异基因群的挖掘 | 第25-26页 |
| 3.10 部分候选基因差异表达量分析 | 第26-29页 |
| 3.10.1 RNA提取 | 第26页 |
| 3.10.2 转录组测序 | 第26页 |
| 3.10.3 实时荧光定量PCR | 第26-29页 |
| 第4章 结果与分析 | 第29-63页 |
| 4.1 产量相关性状的方差分析及表型变异 | 第29-35页 |
| 4.2 收获指数与各农艺性状的相关及通径分析 | 第35-41页 |
| 4.2.1 单个环境相关分析 | 第35-37页 |
| 4.2.2 同年两地间、同地两年间各性状间差值相关分析 | 第37-38页 |
| 4.2.3 两年三试点油菜各农艺性状与收获指数的通径分析 | 第38-41页 |
| 4.3 全基因组关联分析 | 第41-51页 |
| 4.3.1 自然群体的群体结构 | 第41页 |
| 4.3.2 亲缘关系分析 | 第41-42页 |
| 4.3.3 连锁不平衡分析 | 第42页 |
| 4.3.4 六种模型比较 | 第42-43页 |
| 4.3.5 两年三试点单个环境下的全基因组关联分析 | 第43-47页 |
| 4.3.6 两地差值下各性状全基因组关联分析 | 第47-49页 |
| 4.3.7 各个环境下重复检测到的SNP位点分析 | 第49-51页 |
| 4.4 候选基因预测 | 第51-58页 |
| 4.4.1 油菜收获指数基本基因群发掘 | 第51-53页 |
| 4.4.2 油菜高产高收获指数潜能基因群发掘 | 第53-58页 |
| 4.5 候选基因表达量差异分析 | 第58-63页 |
| 4.5.1 转录组测序结果 | 第58-59页 |
| 4.5.2 实时荧光定量PCR | 第59-63页 |
| 第5章 讨论与结论 | 第63-69页 |
| 5.1 讨论 | 第63-67页 |
| 5.1.1 收获指数的表型变异 | 第63-64页 |
| 5.1.2 产量相关性状及收获指数全基因组关联分析 | 第64-66页 |
| 5.1.3 候选基因差异表达特征 | 第66-67页 |
| 5.2 结论 | 第67-69页 |
| 参考文献 | 第69-75页 |
| 致谢 | 第75-77页 |
| 硕士期间发表论文情况 | 第77-79页 |
| 附表1 本研究所用的520份油菜品系信息 | 第79-84页 |
| 附表2 两年三试点各性状全基因组关联分析检测到的SNP位点 | 第84-93页 |
| 附表3-1 22个候选基因在两地高低收获指数极端材料的转录组测序结果 | 第93-94页 |
| 附表3-2 22个候选基因在两地高低产量极端材料的转录组测序结果 | 第94-96页 |
| 附图1 两年三试点各性状的QQ图 | 第96-98页 |
| 附图2 两年三试点各性状的MANHATTAN图 | 第98页 |
