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布鲁氏菌sRNA AbcR1和靶基因的相互作用研究

摘要第6-8页
ABSTRACT第8-9页
缩略语表(Abbreviation)第10-11页
第1章 文献综述第11-18页
    1.1 布鲁氏菌的分类和分布第11-15页
    1.2 细菌的sRNA第15页
    1.3 细菌sRNA靶位点的生物信息学预测第15-16页
    1.4 研究目的和意义第16-18页
第2章 材料和方法第18-31页
    2.1 实验材料第18-21页
        2.1.1 实验菌株、质粒和培养基第18页
        2.1.2 实验仪器及耗材第18-19页
        2.1.3 引物列表第19-20页
        2.1.4 工具酶和试剂盒、抗体等第20页
        2.1.5 试剂、抗生素及培养基第20-21页
    2.2 实验方法第21-31页
        2.2.1 布鲁氏菌总RNA提取第21-22页
        2.2.2 5’RACE寻找TSS位点第22-24页
        2.2.3 PCR产物或者酶切产物的切胶回收第24页
        2.2.4 PCR产物或者酶切产物的无水乙醇法沉降回收第24-25页
        2.2.5 大肠杆菌TOP10 感受态细胞的制备第25页
        2.2.6 低拷贝载体质粒大量提取(invitrogen试剂盒)第25-26页
        2.2.7 Targets目的片段和pXG-10SF载体的连接第26页
        2.2.8 sRNA目的片段和载体一步定向无缝克隆(novoprotein试剂盒)第26-27页
        2.2.9 酶连产物或者一步定向重组产物的转化第27页
        2.2.10 质粒小量提取(OMEGA试剂盒)第27-28页
        2.2.11 超声波破碎大肠杆菌第28页
        2.2.12 Western blot检测GFP蛋白含量第28-29页
        2.2.13 qRT-PCR检测靶基因转录水平第29-31页
第3章 结果与分析第31-43页
    3.1 sRNA结构预测第31-32页
    3.2 sRNA的保守性分析第32页
    3.3 sRNA的靶位点预测第32-34页
    3.4 布鲁氏菌总RNA提取第34页
    3.5 5’RACE寻找靶基因的 5’转录起始位点第34-35页
    3.6 sRNA的3个targets的扩增第35-36页
    3.7 绿色荧光基因的targets载体pXG-10SF的酶切验证第36-37页
    3.8 Target::pXG-10SF融合后质粒的构建和荧光检测第37-38页
    3.9 布鲁氏菌sRNA AbcR1 和AbcR2 的无缝克隆第38-39页
    3.10 共转化Target::pXG-10SF和AbcR1::pZK001第39-40页
    3.11 Western blot检测共转化的GFP蛋白水平第40-41页
    3.12 qRT-PCR检测共转化质粒mRNA水平的变化量第41-43页
第4章 讨论第43-45页
第5章 结论第45-46页
参考文献第46-51页
附录第51-56页
致谢第56页

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