| 摘要 | 第8-9页 |
| Abstract | 第9-10页 |
| 缩略语表 | 第11-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-29页 |
| 1 湖泊中的有机质 | 第12-20页 |
| 1.1 湖泊中有机质的分类与来源 | 第12-13页 |
| 1.2 有机质的生物利用 | 第13-20页 |
| 1.2.1 藻源性有机质的利用 | 第13-17页 |
| 1.2.2 水生植物来源的有机质的利用 | 第17-20页 |
| 2. 底泥中的微生物 | 第20-26页 |
| 2.1 底泥中微生物数量 | 第20-21页 |
| 2.2 微生物对有机质的分解 | 第21页 |
| 2.3 底泥中微生物群落研究 | 第21-26页 |
| 2.3.1 沉积物中微生物研究方法 | 第23-24页 |
| 2.3.2 沉积物中微生物群落研究现状 | 第24-26页 |
| 3 有机质对底泥微生物群落的影响 | 第26-28页 |
| 4 本研究的目的与意义 | 第28-29页 |
| 第二章 DNA提取方法对底泥垂向微生物群落分析的影响 | 第29-53页 |
| 1 引言 | 第29-31页 |
| 2 材料与方法 | 第31-35页 |
| 2.1 采样 | 第31-32页 |
| 2.2 理化分析 | 第32页 |
| 2.3 DNA提取与纯化 | 第32页 |
| 2.3.1 经典法(M1) | 第32页 |
| 2.3.2 试剂盒法(M2) | 第32页 |
| 2.4 DNA检测 | 第32-33页 |
| 2.5 PCR扩增 | 第33-34页 |
| 2.5.1 引物选择 | 第33页 |
| 2.5.2 PCR体系 | 第33页 |
| 2.5.3 PCR扩增程序 | 第33-34页 |
| 2.6 DGGE变形梯度凝胶电泳 | 第34-35页 |
| 2.6.1 变性胶的制备 | 第34页 |
| 2.6.2 加样 | 第34页 |
| 2.6.3 电泳及染色 | 第34页 |
| 2.6.4 电泳结果检测 | 第34页 |
| 2.6.5 凝胶电泳图谱多样性分析 | 第34-35页 |
| 2.6.6 细菌群落组成聚类分析 | 第35页 |
| 2.7 CCA分析与数据分析 | 第35页 |
| 3 结果 | 第35-48页 |
| 3.1 样品理化特征 | 第35-36页 |
| 3.2 DNA提取效率 | 第36-39页 |
| 3.3 PCR结果检测 | 第39-41页 |
| 3.4 DGGE指纹图谱 | 第41-43页 |
| 3.5 细菌群落多样性分析 | 第43-44页 |
| 3.6 相关性分析 | 第44-45页 |
| 3.7 不同深度样品聚类分析 | 第45-46页 |
| 3.8 CCA分析结果 | 第46-48页 |
| 4 讨论 | 第48-51页 |
| 5 小结 | 第51-53页 |
| 第三章 有机质来源对沉积物中垂向微生物群落组成的影响 | 第53-85页 |
| 1 引言 | 第53-55页 |
| 2 材料与方法 | 第55-58页 |
| 2.1 采样点 | 第55-56页 |
| 2.2 理化分析 | 第56页 |
| 2.3 DNA提取与纯化 | 第56页 |
| 2.4 PCR扩增 | 第56-57页 |
| 2.4.1 引物选择 | 第56页 |
| 2.4.2 PCR体系 | 第56页 |
| 2.4.3 PCR扩增程序 | 第56-57页 |
| 2.5 DGGE变形梯度凝胶电泳 | 第57页 |
| 2.5.1 变性胶的制备 | 第57页 |
| 2.5.2 加样 | 第57页 |
| 2.5.3 电泳及染色 | 第57页 |
| 2.5.4 电泳结果检测 | 第57页 |
| 2.5.5 凝胶电泳图谱多样性分析 | 第57页 |
| 2.5.6 细菌群落组成聚类分析 | 第57页 |
| 2.6 CCA分析 | 第57页 |
| 2.7 DGGE条带测序 | 第57-58页 |
| 2.8 核酸序列登陆号 | 第58页 |
| 2.9 系统发育分析 | 第58页 |
| 3 结果 | 第58-77页 |
| 3.1 样品垂向理化特征 | 第58-61页 |
| 3.2 有机质来源的C/N和δ~(13)C鉴定 | 第61-64页 |
| 3.3 细菌多样性的垂向变化 | 第64-65页 |
| 3.4 DGGE指纹图谱 | 第65-66页 |
| 3.5 细菌群落组成聚类分析 | 第66-68页 |
| 3.6 CCA分析 | 第68-71页 |
| 3.7 序列系统发育分析 | 第71-77页 |
| 4 讨论 | 第77-83页 |
| 4.1 环境因素对细菌群落组成的影响 | 第78-80页 |
| 4.2 系统分类以及与有机质来源有关的分布 | 第80-83页 |
| 4.3 有机质来源与细菌群落多样性的关系 | 第83页 |
| 5 小结 | 第83-85页 |
| 第四章 研究总结与展望 | 第85-87页 |
| 1 总结 | 第85-86页 |
| 2 展望 | 第86-87页 |
| 参考文献 | 第87-106页 |
| 附录 发表论文 | 第106-107页 |
| 致谢 | 第107页 |