摘要 | 第5-7页 |
Abstract | 第7-9页 |
第一章 绪论 | 第16-33页 |
1.1 引言 | 第16-21页 |
1.1.1 研究背景 | 第16-20页 |
1.1.2 研究目的和意义 | 第20-21页 |
1.1.3 项目来源与经费支持 | 第21页 |
1.2 国内外研究现状 | 第21-30页 |
1.2.1 RFLP标记技术 | 第22-23页 |
1.2.2 RAPD标记技术 | 第23-24页 |
1.2.3 AFLP标记技术 | 第24-25页 |
1.2.4 SSR标记技术 | 第25-26页 |
1.2.5 ISSR标记技术 | 第26页 |
1.2.6 SNP标记技术 | 第26-27页 |
1.2.7 分子标记技术在桉树研究中的应用进展 | 第27-30页 |
1.3 研究目标和主要研究内容 | 第30-32页 |
1.3.1 研究目标 | 第30页 |
1.3.2 主要研究内容 | 第30-32页 |
1.4 研究技术路线 | 第32-33页 |
第二章 桉树SSR分子标记的开发 | 第33-48页 |
2.1 材料与方法 | 第34-38页 |
2.1.1 试验材料与叶片总DNA提取 | 第34-35页 |
2.1.2 序列检索及SSR位点的统计分析 | 第35页 |
2.1.3 SSR引物设计 | 第35-36页 |
2.1.4 SSR引物筛选 | 第36-37页 |
2.1.5 6 种桉树亲缘关系分析 | 第37-38页 |
2.2 结果与分析 | 第38-44页 |
2.2.1 桉树基因组序列和EST序列的SSR位点相关特征分析 | 第38-41页 |
2.2.2 SSR引物设计与评估 | 第41-42页 |
2.2.3 桉树SSR引物的有效性筛选 | 第42-43页 |
2.2.4 SSR-PCR扩增序列的亲缘关系分析 | 第43-44页 |
2.3 讨论 | 第44-47页 |
2.3.1 桉树SSR位点的特征分析 | 第44-46页 |
2.3.2 Genomic-SSR引物和EST-SSR引物的比较分析 | 第46页 |
2.3.3 6 种桉树遗传关系分析 | 第46-47页 |
2.4 小结 | 第47-48页 |
第三章 基因组DNA混合池技术在SSR引物筛选中的可靠性研究 | 第48-71页 |
3.1 材料与方法 | 第49-54页 |
3.1.1 试验材料 | 第49-51页 |
3.1.2 桉树叶片总DNA的提取及基因组DNA混合池的构建 | 第51-52页 |
3.1.3 桉树EST-SSR和Genomic-SSR标记的序列可靠性分析 | 第52-54页 |
3.1.4 基因组DNA混合池为模板在SSR标记中重测序分析 | 第54页 |
3.1.5 39 种桉树样品SSR-PCR扩增反应 | 第54页 |
3.1.6 数据统计与分析方法 | 第54页 |
3.2 结果与分析 | 第54-67页 |
3.2.1 基因组DNA混合池筛选SSR引物的序列可靠性分析 | 第54-60页 |
3.2.2 单一DNA样品与基因组DNA混合池为模板所得序列的多态性分析 | 第60-64页 |
3.2.3 桉树SSR引物在基因组DNA混合池中扩增序列的特征分析 | 第64-65页 |
3.2.4 39 种桉树SSR-PCR扩增结果 | 第65-67页 |
3.3 讨论 | 第67-70页 |
3.3.1 基因组DNA混合池在SSR引物筛选可靠性的确定 | 第67-68页 |
3.3.2 单一DNA样品与基因组DNA混合池在SSR标记中扩增序列的多态性分析 | 第68页 |
3.3.3 桉树Genomic-SSR和EST-SSR在基因组DNA混合池中扩增序列的特征分析 | 第68-69页 |
3.3.4 39 种桉树SSR-PCR扩增结果分析 | 第69-70页 |
3.4 小结 | 第70-71页 |
第四章 桉树种质资源的遗传多样性分析 | 第71-83页 |
4.1 材料和方法 | 第71-74页 |
4.1.1 试验材料 | 第71-72页 |
4.1.2 总DNA的提取 | 第72页 |
4.1.3 SSR-PCR扩增反应 | 第72-73页 |
4.1.4 数据统计与分析 | 第73-74页 |
4.2 结果与分析 | 第74-80页 |
4.2.1 SSR位点的多态性分析 | 第74-76页 |
4.2.2 主坐标分析 | 第76-77页 |
4.2.3 类平均法聚类分析 | 第77-80页 |
4.3 讨论 | 第80-82页 |
4.3.1 桉树种质资源的遗传多样性分析 | 第80-81页 |
4.3.2 聚类分析 | 第81-82页 |
4.4 小结 | 第82-83页 |
第五章 42种桉树种间亲缘关系的研究 | 第83-102页 |
5.1 材料和方法 | 第85-87页 |
5.1.1 试验材料 | 第85页 |
5.1.2 总DNA提取 | 第85页 |
5.1.3 SSR-PCR扩增反应 | 第85-87页 |
5.1.4 数据分析 | 第87页 |
5.2 结果与分析 | 第87-98页 |
5.2.1 SSR-PCR扩增结果 | 第87-91页 |
5.2.2 不同SSR位点的遗传多态性分析 | 第91-92页 |
5.2.3 桉树种内微卫星序列的多态性分析 | 第92-95页 |
5.2.4 桉树种间亲缘关系分析 | 第95-98页 |
5.3 讨论 | 第98-100页 |
5.3.1 Blast检索结果分析 | 第98页 |
5.3.2 不同SSR位点的遗传多样性分析 | 第98-99页 |
5.3.3 不同个体间微卫星序列的多态性分析 | 第99-100页 |
5.3.4 桉树种间亲缘关系分析 | 第100页 |
5.4 小结 | 第100-102页 |
第六章 桉树种质资源精准鉴定体系的初步研究 | 第102-116页 |
6.1 材料和方法 | 第103页 |
6.1.1 试验材料 | 第103页 |
6.1.2 数据统计和分析 | 第103页 |
6.2 结果与分析 | 第103-113页 |
6.2.1 SSR-PCR扩增结果 | 第103-104页 |
6.2.2 微卫星序列的特征分析 | 第104-107页 |
6.2.3 侧翼序列的特征分析 | 第107-109页 |
6.2.4 42种桉树种间种质资源鉴定分析 | 第109-110页 |
6.2.5 桉树种间系统发育关系分析 | 第110-113页 |
6.3 讨论 | 第113-114页 |
6.4 小结 | 第114-116页 |
第七章 结论与展望 | 第116-120页 |
7.1 主要结论 | 第116-118页 |
7.2 展望 | 第118-120页 |
参考文献 | 第120-133页 |
附录 | 第133-168页 |
在读期间的学术研究 | 第168-169页 |
致谢 | 第169-170页 |