摘要 | 第4-5页 |
Abstract | 第5页 |
1 前言 | 第9-21页 |
1.1 空肠弯曲杆菌简介 | 第9-10页 |
1.1.1 基本介绍 | 第9页 |
1.1.2 临床表现 | 第9-10页 |
1.1.3 空肠弯曲杆菌的鉴定 | 第10页 |
1.2 空肠弯曲杆菌的致病因子及致病机理 | 第10-12页 |
1.2.1 鞭毛蛋白 | 第11页 |
1.2.2 黏附蛋白 | 第11页 |
1.2.3 趋化蛋白 | 第11页 |
1.2.4 纤连结合蛋白 | 第11-12页 |
1.2.5 外膜蛋白和脂多糖 | 第12页 |
1.2.6 空肠弯曲菌毒素 | 第12页 |
1.3 病原菌与寄主相互作用过程中的毒力基因 | 第12-13页 |
1.4 不同环境条件对细菌黏附侵染的影响 | 第13-14页 |
1.5 DNA测序技术研究进展 | 第14-19页 |
1.5.1 DNA测序技术 | 第14-18页 |
1.5.2 细菌基因组学的研究 | 第18-19页 |
1.6 细菌转录组学的研究进展 | 第19-20页 |
1.6.1 转录组学研究策略 | 第19-20页 |
1.7 研究目的及意义 | 第20页 |
1.8 本论文的研究内容 | 第20-21页 |
2 材料与方法 | 第21-34页 |
2.1 实验材料与仪器 | 第21-24页 |
2.1.1 菌株和细胞株 | 第21页 |
2.1.2 实验试剂 | 第21-22页 |
2.1.3 实验仪器 | 第22-23页 |
2.1.4 相关溶液 | 第23页 |
2.1.5 主要培养基 | 第23-24页 |
2.2 实验方法 | 第24-34页 |
2.2.1 空肠弯曲杆菌单菌落的培养及菌株保藏 | 第24页 |
2.2.2 HCT-8细胞的培养 | 第24-25页 |
2.2.3 双重PCR鉴定空肠弯曲菌 | 第25页 |
2.2.4 空肠弯曲杆菌生长曲线的绘制 | 第25-26页 |
2.2.5 空肠弯曲杆菌不同条件下的生长情况 | 第26页 |
2.2.6 细胞粘附实验 | 第26-27页 |
2.2.7 转录组测序样品的制备 | 第27-28页 |
2.2.8 RNA的纯化 | 第28-29页 |
2.2.9 RNA文库构建和转录组测序 | 第29-30页 |
2.2.10 荧光实时定量RT-PCR (qRT-PCR) | 第30-34页 |
3 结果与分析 | 第34-50页 |
3.1 实验结果 | 第34-50页 |
3.1.1 空肠弯曲菌双重PCR鉴定 | 第34页 |
3.1.2 空肠弯曲菌不同条件下的生长情况 | 第34-38页 |
3.1.3 空肠弯曲菌不同条件下粘附侵染结肠癌上皮细胞情况 | 第38-42页 |
3.1.4 空肠弯曲菌ATCC33560差异基因分类 | 第42-43页 |
3.1.5 空肠弯曲菌ATCC33560差异基因代谢途径归类分析 | 第43-48页 |
3.1.6 实时定量PCR验证RNA-seq结果 | 第48-50页 |
4 结论 | 第50-51页 |
5 展望 | 第51-52页 |
6 参考文献 | 第52-58页 |
7 攻读硕士学位期间发表论文情况 | 第58-59页 |
8 致谢 | 第59-60页 |
附录 | 第60-78页 |