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基于基因组的金针菇遗传连锁图的构建与数量性状位点(QTL)分析

摘要第1-10页
Abstract第10-11页
引言第11-12页
第一章 文献综述第12-28页
 1 金针菇的生物学特性第12-14页
   ·金针菇的形态特征及习性第12页
   ·金针菇的交配型第12-13页
   ·金针菇的生活史第13页
   ·金针菇子实体的形态发生第13-14页
 2 金针菇的遗传育种第14页
   ·金针菇育种技术第14页
   ·中国栽培的金针菇优良菌种第14页
 3 数量性状的遗传第14-17页
   ·数量遗传的特点第14-15页
   ·食用菌的数量性状研究第15-16页
   ·数量遗传研究常用参数第16-17页
 4 数量性状基因(QTL)的定位第17-19页
   ·QTL 定位的必要条件第17页
   ·QTL 定位的一般步骤第17-18页
   ·QTL 定位的分析方法第18-19页
 5 遗传连锁图谱的构建第19-26页
   ·遗传连锁图谱第19页
   ·用于遗传图谱构建的群体第19-20页
   ·连锁分析和图谱构建第20-24页
   ·真菌遗传图谱的构建第24-25页
   ·大型真菌遗传连锁图谱的研究进展第25页
   ·大型真菌分子遗传图谱的应用第25-26页
 6 QTL 定位在食用菌中的应用第26-28页
   ·QTL 定位的目的第26页
   ·QTL 定位在食用菌中的研究进展第26-28页
第二章 测交分离群体构建第28-34页
 1. 材料与方法第28-29页
   ·供试菌株第28-29页
   ·培养基第29页
   ·棉兰乳酸酚染色液第29页
   ·显微镜第29页
 2 测交分离群体构建第29-33页
   ·作图群体极性的测定第29-30页
   ·测试菌株的来源第30-31页
   ·分离群体的建立第31-33页
 3 分析讨论第33-34页
第三章 金针菇RAPD 标记的筛选与SCAR 标记的建立第34-54页
 1 材料与方法第34-47页
   ·供试菌株第34页
   ·培养基第34页
   ·生化试剂第34-35页
   ·菌丝体培养第35页
   ·DNA 提取方法第35-36页
   ·基因组DNA 的检测第36-37页
   ·RAPD 引物筛选第37-38页
   ·特异性片段的回收纯化第38-43页
   ·目的片段的克隆第43-45页
   ·SCAR 引物的设计与合成第45-46页
   ·SCAR 引物的验证及退火温度优化第46-47页
 2 结果与分析第47-52页
   ·DNA 验证结果第47-49页
   ·RAPD 引物的筛选结果第49-50页
   ·目的片段的克隆与SCAR 引物的设计第50-51页
   ·SCAR 标记的验证及退火温度的优化第51-52页
 3 讨论第52-54页
第四章 金针菇全基因组序列的测定、拼接与SCAR 标记的建立第54-64页
 1 材料与方法第54-58页
   ·供试菌株第54页
   ·培养基第54页
   ·生化试剂第54页
   ·菌丝体培养第54页
   ·基因组DNA 的提取第54-55页
   ·基因组DNA 的检测第55页
   ·金针菇基因组序列的测定第55页
   ·金针菇基因组序列的拼接第55-56页
   ·金针菇序列的比对第56-58页
   ·SCAR 引物的设计第58页
 2 结果与分析第58-62页
   ·金针菇基因组DNA 的检测第58-59页
   ·金针菇全基因组序列的测定与拼接第59页
   ·SCAR 引物的设计第59-62页
   ·SCAR 标记的验证与退火温度优化第62页
 3 分析与讨论第62-64页
第五章 金针菇SCAR 标记的连锁分析及遗传连锁图的构建第64-75页
 1 SCAR 标记的统计分析第64-69页
   ·作图群体的SCAR 标记扩增第64-67页
   ·作图群体PCR 扩增结果的统计第67页
   ·SCAR 标记汇总第67-69页
 2 遗传连锁图的构建第69-72页
   ·构图方法第69页
   ·结果与分析第69-72页
 3 讨论第72-75页
   ·MAPMAKER/EXP 3.0 软件的主要参数设置第72-73页
   ·金针菇染色体数目的研究第73-74页
   ·本研究获得的结果讨论第74-75页
第六章 金针菇数量性状的QTL 定位第75-83页
 1 材料与方法第75-77页
   ·供试菌株第75页
   ·培养基第75页
   ·出菇实验第75-76页
   ·数据统计与分析第76-77页
 2 结果与分析第77-83页
参考文献第83-90页
附录一 RAPD 特异性片段来源的SCAR 标记序列第90-96页
附录二 基因组比对来源的SCAR 标记序列第96-136页
附录三 作图群体SCAR 标记扩增图谱第136-198页
附录四 数量性状数据汇总第198-201页
附录五 QTL Network 2.1 运算结果第201-207页
致谢第207页

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