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西藏藏猪耐低氧基因ECE1的分子克隆及其表达分析

英文缩略词表第4-7页
摘要第7-9页
Abstract第9-10页
1 引言第11-16页
    1.1 西藏藏猪与低氧适应第11-13页
        1.1.1 西藏藏猪第11-12页
        1.1.2 低氧适应第12-13页
    1.2 内皮素转化酶 1(ECE1)第13-14页
        1.2.1 内皮素第13-14页
        1.2.2 ECE1基因的研究进展第14页
    1.3 cDNA末端快速扩增技术第14-15页
    1.4 本研究的目的和意义第15-16页
2 材料与方法第16-38页
    2.1 试验材料第16-21页
        2.1.1 试验动物与样品采集第16页
        2.1.2 主要仪器设备第16-17页
        2.1.3 网络资源及软件第17-18页
        2.1.4 主要试剂及耗材第18-19页
        2.1.5 主要试剂的配制第19-21页
    2.2 试验方法第21-38页
        2.2.1 ECE1基因的cDNA全长扩增第21-25页
        2.2.2 cDNA全长的测序第25-28页
        2.2.3 生物信息学分析第28-30页
        2.2.4 三个猪种间的序列差异分析第30-31页
        2.2.5 荧光定量PCR的检测分析第31-33页
        2.2.6 Western Blot的检测分析第33-37页
        2.2.7 数据分析第37-38页
3 结果与分析第38-55页
    3.1 藏猪ECE1基因的cDNA全长的克隆第38-39页
        3.1.1 总RNA的提取与质量检测第38页
        3.1.2 5′RACE、3′RACE和中间片段的PCR扩增第38-39页
        3.1.3 菌液PCR阳性鉴定结果第39页
    3.2 测序结果分析第39-41页
    3.3 生物信息学分析第41-48页
        3.3.1 ORF区的预测第41-42页
        3.3.2 蛋白质氨基酸组成、分子量和等电点分析第42页
        3.3.3 蛋白质疏水性与二级结构第42-43页
        3.3.4 跨膜区和亚细胞定位的预测第43-44页
        3.3.5 信号肽和二硫键预测第44-45页
        3.3.6 糖基化和磷酸化位点预测第45页
        3.3.7 蛋白质三级结构预测第45-46页
        3.3.8 序列间的多重比对和蛋白质氨基酸分子进化树第46-48页
    3.4 三个猪种间的序列差异分析第48-50页
    3.5 藏猪ECE1基因的表达检测分析第50-55页
        3.5.1 内参基因的筛选第50-51页
        3.5.2 qPCR标准曲线和溶解曲线的制备第51页
        3.5.3 藏猪ECE1基因的组织表达谱分析第51-52页
        3.5.4 藏猪、莱芜猪和大白猪不同组织中ECE1基因的表达差异分析第52-55页
4 讨论第55-59页
    4.1 ECE1的生物信息学分析第55-56页
    4.2 三个猪种间的序列差异分析第56-57页
    4.3 ECE1基因mRNA与蛋白质的组织和品种差异表达第57-59页
5 结论第59-60页
参考文献第60-70页
致谢第70-71页
攻读学位期间发表论文情况第71页

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