| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 缩略语表 | 第13-14页 |
| 基因名称缩略表 | 第14-15页 |
| 第一章 使用简要统计学重现和深入评估全基因组关联分析和全基因组荟萃分析研究 | 第15-44页 |
| 1.1 引言 | 第15-16页 |
| 1.2 材料与方法 | 第16-27页 |
| 1.2.1 拟南芥GWAS数据 | 第16-22页 |
| 1.2.2 试验仪器和试剂 | 第22-23页 |
| 1.2.3 表型分析 | 第23-24页 |
| 1.2.4 元素含量分析 | 第24页 |
| 1.2.5 Meta验证数据 | 第24-25页 |
| 1.2.6 开放式全基因组关联算法(OATH) | 第25-27页 |
| 1.3 结果 | 第27-42页 |
| 1.3.1 OATH的模拟示例 | 第27-29页 |
| 1.3.2 拟南芥两种GWAS模型的争论 | 第29-34页 |
| 1.3.3 再现拟南芥sGWAS结果 | 第34-36页 |
| 1.3.4 重现未报到的结果 | 第36-38页 |
| 1.3.5 深度评估拟南芥GWAS显著位点 | 第38-40页 |
| 1.3.6 OATH在GWAMA中的应用 | 第40-42页 |
| 1.4 讨论 | 第42-43页 |
| 1.5 结论 | 第43-44页 |
| 第二章 拟南芥生长发育和养分代谢对高镁胁迫响应 | 第44-72页 |
| 2.1 引言 | 第44-45页 |
| 2.2 材料与方法 | 第45-51页 |
| 2.2.1 植物材料与生长条件 | 第45-46页 |
| 2.2.2 拟南芥培养 | 第46-47页 |
| 2.2.3 试验处理 | 第47页 |
| 2.2.4 试验仪器和试剂 | 第47-48页 |
| 2.2.5 表型分析 | 第48页 |
| 2.2.6 胞质Ca~(2+)观察 | 第48-49页 |
| 2.2.7 元素含量分析 | 第49页 |
| 2.2.8 GWAS定位,SNP选择以及统计方法 | 第49-50页 |
| 2.2.9 突变位点验证和实时定量PCR | 第50-51页 |
| 2.2.10 数据分析 | 第51页 |
| 2.3 结果与讨论 | 第51-67页 |
| 2.3.1 正常镁和高镁下21个不同表型的分布和相关性分析 | 第51-58页 |
| 2.3.2 高镁下营养代谢反应的GWAS分析 | 第58-64页 |
| 2.3.3 Atntrl突变体在高镁处理下的响应 | 第64-67页 |
| 2.4 讨论 | 第67-71页 |
| 2.4.1 过量供镁导致生态型生长的变化 | 第67-68页 |
| 2.4.2 养分浓度和吸收的变化及相关分子机制 | 第68-70页 |
| 2.4.3 高镁胁迫下基因AtNRX1负向调控Ca浓度和植物生长 | 第70-71页 |
| 2.5 结论 | 第71-72页 |
| 第三章 GWAS结果在水稻的同源基因和应用展望 | 第72-80页 |
| 一 水稻镁相关同源基因挖掘 | 第72-73页 |
| 二 根系相关基因的应用 | 第73-75页 |
| 三 营养相关基因的应用 | 第75-80页 |
| 致谢 | 第80-81页 |
| 参考文献 | 第81-93页 |
| 个人简历 | 第93-97页 |
