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不同毛色羊驼皮肤microRNAs的全基因组表达谱分析和功能研究

摘要第1-10页
第一部分 文献综述第10-39页
 第一章 哺乳动物毛色形成机制第10-20页
  1. 色素形成的化学和生物化学机制第10-12页
   ·真黑素和褐黑素的生物化学机制第10-11页
   ·混合型黑素原的形成机制第11-12页
  2. 色素形成的调节第12-14页
   ·信号分子及传导通路第12页
   ·酶与底物第12-13页
   ·激素与神经肽第13页
   ·黑色素细胞与邻近细胞的相互作用第13-14页
   ·其它因素第14页
  3. 影响色素形成的主效候选基因第14-20页
   ·TYR/TYR基因座第15-16页
   ·Dct/DCT和TYRP1/TYRP1基因座第16页
   ·Oca2(p)/OCA2(P),Slc45a2/SLC45A2(MATP),Si/SILV(PMEL17)基因座第16-18页
   ·A/ASIP,Mc1r/MC1R,Pomc/POMC和Slc7a11/SLC7A11基因座第18-20页
 第二章 MIRNAS的研究现状及其在毛色中的应用第20-25页
  1. RNA干扰作用和MIRNA的发现第20-21页
  2. MIRNA生物发生机制第21-22页
  3. MIRNA的功能第22-25页
   ·miRNA和皮肤形态发生第23页
   ·miRNA和皮肤癌第23页
   ·miRNA和伤口愈合第23-24页
   ·miRNA和色素形成第24-25页
 第三章 深度测序的研究现状及其在MIRNA上的应用第25-30页
  1. DNA测序技术的发展第25-27页
   ·Sanger测序法第25-26页
   ·454/Roche FLX测序技术第26页
   ·Illumina HiSeq2000测序技术第26-27页
   ·SOLiD测序技术第27页
   ·测序技术发展前景第27-28页
  2. 下一代测序技术在MIRNAs上的应用第28-30页
 第四章 研究目的、意义与内容第30-32页
 参考文献第32-39页
第二部分 实验第39-109页
 第一章 不同被毛颜色羊驼皮肤的MIRNAS表达谱测序第39-63页
  1 材料与方法第39-45页
   ·实验样本第39-40页
   ·实验试剂,耗材及仪器第40页
   ·溶液配制第40-41页
   ·实验方法第41-43页
   ·生物信息学分析第43-45页
  2 结果与分析第45-57页
   ·白色和棕色羊驼皮肤总RNA提取结果第45-47页
   ·白色和棕色羊驼皮肤小RNA测序结果第47-49页
   ·白色和棕色羊驼皮肤已知miRNA的鉴定和分析第49-51页
   ·不同被毛颜色羊驼皮肤已知miRNAs的表达差异第51-53页
   ·已知miRNAs的碱基编辑分析第53-55页
   ·羊驼皮肤中已知miRNAs靶基因的预测第55-56页
   ·羊驼皮肤中新miRNAs的识别鉴定第56-57页
  3 分析与讨论第57-61页
  参考文献第61-63页
 第二章 荧光定量检测MIRNAS在不同被毛颜色羊驼皮肤中的表达量第63-74页
  1 材料与方法第63-68页
   ·实验样本第63页
   ·实验试剂,耗材及仪器第63-64页
   ·实验方法第64-68页
   ·数据分析第68页
  2 结果与分析第68-71页
   ·miRNAs普通PCR扩增产物和序列分析第68-69页
   ·miRNAs和U6扩增动力学曲线第69-70页
   ·miRNAs和U6溶解曲线第70页
   ·miRNAs在不同毛色羊驼中的表达差异分析第70-71页
  3. 讨论第71-73页
  参考文献第73-74页
 第三章 生物信息学预测和筛选MIR-211靶基因及其真核表达载体的构建第74-90页
  1 材料与方法第75-81页
   ·实验样本第75页
   ·实验试剂,耗材及仪器第75-76页
   ·实验方法第76-81页
  2 结果与分析第81-87页
   ·生物信息学预测和筛选miR-211靶基因第81-82页
   ·候选靶基因KIT扩增、克隆和双酶切第82-83页
   ·RNAhybrid验证KIT 3’-UTR和miR-211的结合位点第83页
   ·靶基因KIT双荧光报告载体和miR-211过表达载体的构建第83-85页
   ·双荧光表达载体转染293T细胞验证候选靶基因第85-86页
   ·羊驼皮肤KIT,MITF,TYR,TYRP-1和TYRP-2基因的内源性检测第86-87页
  3. 讨论第87-89页
  参考文献第89-90页
 第四章 MIR-211转染黑色素细胞对色素形成的影响第90-109页
  1 材料与方法第91-99页
   ·实验材料第91页
   ·实验试剂、耗材和仪器第91-94页
   ·实验方法第94-99页
  2 结果与分析第99-106页
   ·miR-211转染羊驼黑色素细胞结果第99-101页
   ·miR-211转染羊驼黑色素细胞的表达量变化第101-102页
   ·miR-211转染羊驼黑色素细胞后色素含量的检测第102页
   ·miR-211转染羊驼黑色素细胞后KIT,MITF,TYR,TYRP-1和TYRP-2基因的荧光定量结果第102-104页
   ·miR-211转染羊驼黑色素细胞后KIT,MITF,TYR,TYRP-1和TYRP-2蛋白免疫印迹分析第104-106页
  3 分析与讨论第106-108页
  参考文献第108-109页
全文总结第109-110页
研究创新与展望第110-112页
ABSTRACT第112-114页
中英文对照及缩写表第114-115页
附录 在读期间发表的实验性论文的情况第115-116页
致谢第116页

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