| 中文摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 缩略词列表 | 第8-11页 |
| 第一章 背景介绍 | 第11-29页 |
| ·叶片衰老的研究进展 | 第11-17页 |
| ·叶片衰老的影响因素 | 第12-14页 |
| ·黑暗诱导的叶片衰老 | 第14页 |
| ·氧化胁迫与叶片衰老 | 第14-15页 |
| ·叶片衰老的系统生物学研究 | 第15-17页 |
| ·JAZ家族研究进展 | 第17-22页 |
| ·JAZ蛋白及其参与的信号通路 | 第17-18页 |
| ·JAZ蛋白的功能研究进展 | 第18-22页 |
| ·植物转求组学研究现状 | 第22-26页 |
| ·植物转录组学简介 | 第22-23页 |
| ·基因芯片 | 第23-24页 |
| ·RNA-seq技术 | 第24-26页 |
| ·玉米功能基因组学研究进展 | 第26-28页 |
| ·研究的目的和意义 | 第28-29页 |
| 第二章 拟南芥JAZ7基因调控黑暗诱导的叶片衰老的分子机制研究 | 第29-59页 |
| ·引言 | 第29-30页 |
| ·材料与方法 | 第30-38页 |
| ·实验材料 | 第30页 |
| ·实验方法 | 第30-37页 |
| ·基因芯片分析方法 | 第37-38页 |
| ·结果与分析 | 第38-57页 |
| ·叶片衰老相关表达谱数据挖掘结果 | 第38页 |
| ·JAZ家族基因在黑暗处理下的表型 | 第38-39页 |
| ·JAZ7基因参与黑暗诱导的叶片衰老的机制研究 | 第39-43页 |
| ·黑暗处理条件下jaz7与野生型的转录组学分析 | 第43-49页 |
| ·黑暗处理条件下jaz7与野生型的蛋白组学分析 | 第49-54页 |
| ·差异表达基因的荧光实时定量PCR验证 | 第54-55页 |
| ·MYCs转录因子下游靶基因鉴定 | 第55-57页 |
| ·小结与讨论 | 第57-59页 |
| ·JAZ7参与黑暗诱导的叶片衰老过程小结 | 第57页 |
| ·JAZ7影响叶片衰老的可能分子机制探究 | 第57-59页 |
| 第三章 玉米转录组学数据整合分析平台初步构建 | 第59-72页 |
| ·引言 | 第59页 |
| ·数据来源及预处理 | 第59-61页 |
| ·玉米转录组数据的获得 | 第59-60页 |
| ·其它数据的获得 | 第60页 |
| ·数据的预处理 | 第60-61页 |
| ·高通量测序数据的分析流程 | 第61-63页 |
| ·高通量测序数据分析的一般流程 | 第61-62页 |
| ·混合基因组测序数据分析的方法 | 第62-63页 |
| ·数据的可视化 | 第63-65页 |
| ·功能分析工具开发 | 第65-69页 |
| ·顺式作用元件扫描及显著性分析 | 第65-66页 |
| ·玉米蛋白质互作网络的构建 | 第66-68页 |
| ·玉米代谢通路展示 | 第68页 |
| ·其它工具开发 | 第68-69页 |
| ·数据库架构及数据存储 | 第69页 |
| ·分析和讨论 | 第69-72页 |
| 第四章 博士期间参与的其它工作：大豆酰脂代谢功能分析平台构建 | 第72-80页 |
| ·引言 | 第72页 |
| ·功能模板开发构建 | 第72-77页 |
| ·大豆酰脂代谢途径分析平台构建 | 第72-75页 |
| ·其它功能模块开发 | 第75-77页 |
| ·讨论 | 第77-80页 |
| 第五章 结论与展望 | 第80-81页 |
| 参考文献 | 第81-100页 |
| 附录 | 第100-109页 |
| 致谢 | 第109-110页 |
| 个人简历 | 第110页 |