| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-9页 |
| 第一章 绪论 | 第9-15页 |
| ·蛋白质相互作用网络 | 第9-11页 |
| ·课题研究的意义 | 第11-12页 |
| ·本文的主要研究内容 | 第12-13页 |
| ·论文的结构 | 第13-15页 |
| 第二章 蛋白质复合物挖掘相关研究 | 第15-26页 |
| ·传统的蛋白质复合物挖掘研究 | 第16-19页 |
| ·基于图划分的方法 | 第16页 |
| ·基于层次聚类的方法 | 第16-17页 |
| ·基于密度的局部搜索方法 | 第17-18页 |
| ·其他方法 | 第18-19页 |
| ·融合多元数据的蛋白质复合物挖掘研究 | 第19-21页 |
| ·融合基因表达数据的蛋白质复合物挖掘 | 第19-20页 |
| ·融合其他多元信息的蛋白质复合物挖掘 | 第20-21页 |
| ·基于蛋白质复合物挖掘的扩展研究 | 第21-23页 |
| ·蛋白质复合物挖掘研究的新技术 | 第23-24页 |
| ·本章小结 | 第24-26页 |
| 第三章 基于团渗透和距离限制的蛋白质复合物识别算法 | 第26-45页 |
| ·CPM算法分析 | 第26-28页 |
| ·基于团渗透和距离限制的蛋白质复合物识别参数算法CPM-DR | 第28-30页 |
| ·CPM-DR模型 | 第28-29页 |
| ·算法CPM-DR | 第29-30页 |
| ·基于团渗透和距离限制的蛋白质复合物识别非参数算法CP-DR | 第30-34页 |
| ·CP-DR模型 | 第30-32页 |
| ·算法CP-DR | 第32-34页 |
| ·实验结果与分析 | 第34-43页 |
| ·与MIPS数据库中的已知蛋白质复合物比较 | 第34-38页 |
| ·算法的特异性、敏感度和综合评价 | 第38-40页 |
| ·功能富集性分析 | 第40-41页 |
| ·重叠率分析 | 第41-43页 |
| ·本章小结 | 第43-45页 |
| 第四章 基于关键蛋白质和局部适应的蛋白质复合物识别算法 | 第45-65页 |
| ·基于关键蛋白质和局部适应的蛋白质复合物模型 | 第46-48页 |
| ·种子结点选择 | 第48页 |
| ·算法EPOF | 第48-50页 |
| ·实验结果与分析 | 第50-63页 |
| ·与已知蛋白质复合物比较 | 第51-52页 |
| ·算法敏感度和特异性 | 第52-53页 |
| ·功能富集性分析 | 第53-54页 |
| ·算法精度分析 | 第54-56页 |
| ·蛋白质复合物密度分析 | 第56-59页 |
| ·交叠率分析 | 第59-60页 |
| ·种子有效性验证 | 第60-62页 |
| ·加权蛋白质网络实验结果比较分析 | 第62-63页 |
| ·本章小结 | 第63-65页 |
| 第五章 基于组织特异性和局部适应的蛋白质复合物识别算法 | 第65-79页 |
| ·组织特异性子网构建 | 第66-67页 |
| ·基于组织特异性和局部适应的蛋白质复合物模型 | 第67-69页 |
| ·算法TSOF | 第69-71页 |
| ·实验结果与分析 | 第71-77页 |
| ·实验数据 | 第71-72页 |
| ·功能富集性分析 | 第72-75页 |
| ·算法精度分析 | 第75页 |
| ·种子有效性验证 | 第75-77页 |
| ·本章小结 | 第77-79页 |
| 第六章 总结 | 第79-84页 |
| ·研究贡献与创新点 | 第79-81页 |
| ·研究展望 | 第81-84页 |
| 参考文献 | 第84-96页 |
| 致谢 | 第96-98页 |
| 攻读硕士学位期间主要研究成果 | 第98-99页 |
