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红色亚栖热菌海藻糖合酶结构与功能的关系及定向进化的研究

中文摘要第1-7页
Abstract第7-15页
缩略词一览表第15-17页
第一章 绪论第17-47页
 第一节 海藻糖的特性、分布以及应用前景第17-24页
     ·海藻糖结构第17-18页
     ·海藻糖的生物学功能第18-21页
     ·海藻糖的应用第21-24页
 第二节 海藻糖的生产以及合成途径第24-30页
     ·海藻糖的生产方法第24页
     ·海藻糖合成途径第24-30页
 第三节 海藻糖合酶研究进展第30-35页
     ·海藻糖合酶的来源及酶学性质第30页
     ·海藻糖合酶的结构特性第30-33页
     ·海藻糖合酶催化机制的研究第33-35页
 第四节 蛋白的定向进化技术第35-43页
     ·理性蛋白设计第35-37页
     ·非理性蛋白设计第37-41页
     ·化学修饰第41页
     ·海藻糖合酶的改造进展第41-43页
 第五节 选题依据和技术路线第43-47页
     ·选题依据第43-44页
     ·实验背景第44-46页
     ·技术路线第46-47页
第二章 红色亚栖热菌海藻糖合酶不同片段功能的研究第47-99页
 第一节 实验材料第47-53页
     ·菌株第47页
     ·质粒第47-48页
     ·主要试剂第48-49页
     ·主要仪器第49页
     ·主要试剂以及培养基配制第49-52页
     ·引物第52-53页
 第二节 实验方法第53-66页
     ·TSMN 与 TSMC 截短蛋白的克隆,表达及性质测定第53-60页
     ·红色亚栖热菌海藻糖合酶 C 端截短蛋白的克隆、表达及酶学性质分析第60-62页
     ·嗜热栖热菌海藻糖合酶基因的克隆、表达与酶学性质分析第62-64页
     ·杂合蛋白 TSTtMr 与 TSMrTt 的克隆、表达与酶学性质分析第64-66页
 第三节 结果与分析第66-89页
     ·TSMN 与 TSMC 截短蛋白的克隆、表达与或性质分析第66-74页
     ·红色亚栖热菌海藻糖合酶 C 端截短蛋白ΔC104、ΔC68 以及ΔC44 的克隆、表达与活性测定第74-79页
     ·嗜热栖热菌海藻糖合酶(TST)的克隆与活性测定第79-84页
     ·杂合蛋白 TSTtMr 与 TSMrTt 的表达、纯化与酶学性质分析第84-89页
 第四节 讨论第89-97页
     ·嗜热菌海藻糖合酶的分子特征第89-90页
     ·截短蛋白二级结构分析第90-94页
     ·截短蛋白及杂合蛋白的功能分析第94-97页
 第五节 小结第97-99页
第三章 红色亚栖热菌海藻糖合酶三维结构模拟及关键氨基酸位点的初步预测第99-124页
 第一节 实验材料第99-104页
     ·菌株第99页
     ·质粒第99-100页
     ·主要试剂第100页
     ·主要仪器第100-101页
     ·培养基以及配制试剂第101-103页
     ·引物第103-104页
 第二节 实验方法第104-107页
     ·红色亚栖热菌海藻糖合酶蛋白三维结构模拟第104页
     ·红色亚栖热菌海藻糖合酶蛋白关键氨基酸位点预测第104页
     ·定点突变第104-105页
     ·突变蛋白的表达与纯化第105-106页
     ·突变蛋白功能测定第106-107页
     ·突变蛋白温度耐受检测第107页
     ·圆二色光谱法测定蛋白的二级结构第107页
 第三节 结果与讨论第107-118页
     ·红色亚栖热菌海藻糖合酶同源建模及模型评价第107-110页
     ·突变位点的预测第110-112页
     ·定点突变的构建、表达与活性分析第112-115页
     ·R392A、R392F 的纯化、活性以及二级结构的研究第115-118页
 第四节 讨论第118-123页
     ·红色亚栖热菌海藻糖合酶三维模型的构建第118-120页
     ·关键氨基酸位点的初步预测第120-121页
     ·保守区的定点突变第121-122页
     ·Y135、R388、R392 定点突变第122-123页
 第五节 小结第123-124页
第四章 红色亚栖热菌海藻糖合酶定向进化条件的建立第124-162页
 第一节 实验材料第124-128页
     ·实验所用菌株第124-125页
     ·质粒第125页
     ·主要试剂第125-126页
     ·主要仪器第126页
     ·培养基与配制试剂第126-127页
     ·引物第127-128页
 第二节 实验方法第128-132页
     ·高通量初筛方法的建立第128-129页
     ·复筛方法第129页
     ·易错 PCR(error-prone PCR,ep PCR)扩增红色亚栖热菌海藻糖合酶基因第129页
     ·DNA 改组(DNA shuffling)第129-131页
     ·DNA 小片段回收第131页
     ·突变体文库的构建第131-132页
     ·突变体文库的筛选第132页
     ·蛋白表达与纯化第132页
     ·蛋白性质第132页
     ·蛋白与 DNA 序列比对第132页
 第三节 结果与讨论第132-155页
     ·高通量初筛方法的建立第132-136页
     ·易错 PCR 条件的建立第136-139页
     ·易错 PCR 突变子库的构建和筛选第139-141页
     ·全长基因 DNA shuffling 方法的建立第141-147页
     ·分段 DNA shuffling第147-153页
     ·突变子 shm9 的活性分析第153-155页
 第四节 讨论第155-160页
     ·影响易错 PCR 的因素第155-159页
     ·影响 DNA shuffling 的因素第159-160页
 第五节 小结第160-162页
第五章 结论与展望第162-166页
   ·结论第162-164页
   ·主要创新点第164-165页
   ·相关工作的前景展望第165-166页
参考文献第166-177页
致谢第177-178页
个人简历 在学期间发表的学术论文与研究成果第178-180页

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