| 中文摘要 | 第1-12页 |
| Abstract | 第12-14页 |
| 1 前言 | 第14-31页 |
| ·连作障碍的研究现状 | 第15-16页 |
| ·连作生物障碍理论 | 第15-16页 |
| ·连作土壤理化性质 | 第16页 |
| ·生姜连作障碍研究现状 | 第16页 |
| ·生姜主要土传病害 | 第16-17页 |
| ·生姜茎腐病 | 第16-17页 |
| ·生姜斑点病 | 第17页 |
| ·生姜姜瘟病 | 第17页 |
| ·植物根际促生细菌（PGPR） | 第17-18页 |
| ·生物防治 | 第18-20页 |
| ·拮抗菌生防机理 | 第18页 |
| ·拮抗细菌在植物病害防治中的优势 | 第18-19页 |
| ·生防细菌主要种类 | 第19-20页 |
| ·芽孢杆菌 | 第19页 |
| ·假单胞菌 | 第19页 |
| ·类芽孢杆菌 | 第19-20页 |
| ·生防拮抗菌的研究现状 | 第20页 |
| ·微生物多样性 | 第20-21页 |
| ·微生物表型多样性研究 | 第21页 |
| ·微生物遗传多样性研究 | 第21页 |
| ·微生物群落多样性分析方法 | 第21-27页 |
| ·环境基因组 16S rDNA 的 PCR 扩增 | 第22页 |
| ·ARDRA | 第22-23页 |
| ·T-RFLP（Terminal restriction fragment length polymorphism） | 第23-24页 |
| ·变性梯度凝胶电泳技术（DGGE） | 第24-25页 |
| ·16S rDNA 文库 | 第25-27页 |
| ·生物群落多样性的测度 | 第27-28页 |
| ·物种多样性指数测度 | 第27页 |
| ·物种丰富度指数测度 | 第27-28页 |
| ·物种均匀度指数测度 | 第28页 |
| ·生物群落梯度分析 | 第28-29页 |
| ·直接梯度分析（Direct gradient analysis） | 第28页 |
| ·间接梯度分析（Indirect gradient analysis） | 第28-29页 |
| ·典型对应分析 | 第29页 |
| ·冗余分析 | 第29页 |
| ·约束直接梯度分析（Constrained direct gradient analysis） | 第29页 |
| ·本研究的立项依据、研究内容及技术路线 | 第29-31页 |
| ·立项依据 | 第29-30页 |
| ·研究内容 | 第30-31页 |
| ·技术路线 | 第31页 |
| 2 材料与方法 | 第31-44页 |
| ·样品的采集 | 第31-32页 |
| ·病原菌 | 第32页 |
| ·培养基 | 第32页 |
| ·生化试剂及主要溶液配制 | 第32-34页 |
| ·仪器设备 | 第34页 |
| ·PCR 引物 | 第34页 |
| ·根际土壤样品总 DNA 的提取及 16S rDNA 的 PCR 扩增 | 第34-35页 |
| ·样品总 DNA 的提取 | 第34页 |
| ·16S rDNA 的 PCR 扩增 | 第34-35页 |
| ·真菌 18S 序列 PCR 扩增 | 第35页 |
| ·PCR 扩增产物的纯化 | 第35页 |
| ·T-RFLP 分析 | 第35-36页 |
| ·荧光 PCR 产物的限制性酶切 | 第35-36页 |
| ·酶切产物的基因扫描 | 第36页 |
| ·生姜根际土壤微生物 DGGE 分析 | 第36页 |
| ·16S rDNA 文库 | 第36-38页 |
| ·PCR 产物的连接 | 第36页 |
| ·转化 | 第36-37页 |
| ·阳性克隆的筛选 | 第37页 |
| ·ARDRA 分型 | 第37-38页 |
| ·土壤理化指标的测定 | 第38页 |
| ·数据分析 | 第38-41页 |
| ·T-RFLP 分析 | 第38-39页 |
| ·细菌群落多样性分析 | 第38页 |
| ·去趋势对应分析（DCA） | 第38-39页 |
| ·典型对应分析（CCA） | 第39页 |
| ·16S rDNA 克隆文库分析 | 第39-40页 |
| ·序列分析 | 第39-40页 |
| ·文库统计数据分析 | 第40页 |
| ·生姜根际微生物 DGGE 分析 | 第40-41页 |
| ·生姜根际拮抗菌的 ARDRA 分析 | 第41页 |
| ·生姜根际茎腐病和斑点病拮抗菌的筛选 | 第41页 |
| ·生姜根际姜瘟病拮抗菌的筛选 | 第41-42页 |
| ·DNA 的提取 | 第42页 |
| ·生姜根际拮抗菌 ARDRA 分析 | 第42-43页 |
| ·核苷酸序列登录号 | 第43-44页 |
| 3 结果与分析 | 第44-74页 |
| ·生姜根际土壤微生物群落结构分析 | 第44-56页 |
| ·T-RFLP 分析 | 第44-47页 |
| ·样品的 T-RFLP 图谱分析 | 第44-45页 |
| ·多样性指数分析 | 第45-46页 |
| ·特殊 T-RFLP 与环境因子之间关系 | 第46页 |
| ·基于 T-RFLP 的主成分分析 | 第46-47页 |
| ·DGGE 分析 | 第47-50页 |
| ·不同种植年限生姜根际微生物 DGGE 图谱分析 | 第47-48页 |
| ·多样性指数分析 | 第48-49页 |
| ·基于 DGGE 微生物种群聚类图 | 第49-50页 |
| ·16S rDNA 克隆文库分析 | 第50-56页 |
| ·文库的构建 | 第50-51页 |
| ·阳性克隆子的验证 | 第50页 |
| ·16S rDNA 扩增片段的 ARDRA 分型 | 第50-51页 |
| ·嵌合体检测及库容的估算 | 第51页 |
| ·基于 16S rDNA 克隆文库的细菌多样性分析 | 第51-56页 |
| ·生姜根际细菌系统发育分析 | 第51-55页 |
| ·基于 16S rDNA 文库的细菌多样性指数分析 | 第55-56页 |
| ·土壤理化性质分析 | 第56-60页 |
| ·土壤理化性质测定 | 第56-57页 |
| ·特征 T-RFs 与环境因子之间的关系（CCA 分析） | 第57页 |
| ·土壤细菌群落与环境因子之间的关系（RDA 分析） | 第57-60页 |
| ·大田生姜连作对土壤中可培养微生物数量的影响 | 第60-61页 |
| ·生姜根际拮抗菌筛选及拮抗能力测定结果 | 第61-64页 |
| ·生姜根际拮抗菌的筛选结果 | 第61-62页 |
| ·根际拮抗菌拮抗能力测定结果 | 第62-64页 |
| ·生姜拮抗菌 ARDRA 及 16S rDNA 序列分析 | 第64-72页 |
| ·拮抗菌 DNA 提取 | 第64页 |
| ·生姜根际拮抗菌的 16S rDNA 的 PCR 扩增 | 第64-65页 |
| ·PCR 扩增产物限制性内切酶酶切图谱 | 第65-66页 |
| ·PCR 扩增产物限制性酶切图谱分析及 16S rDNA 序列分析 | 第66-72页 |
| ·生姜茎腐病根际拮抗菌 ARDRA 及 16S rDNA 序列分析 | 第67-69页 |
| ·生姜斑点病根际拮抗菌 ARDRA 及 16S rDNA 序列分析 | 第69-70页 |
| ·生姜根际姜瘟病拮抗菌 ARDRA 及 16S rDNA 序列分析 | 第70-72页 |
| ·形态特征观察结果 | 第72-74页 |
| 4 讨论 | 第74-80页 |
| 5 结论 | 第80-81页 |
| 参考文献 | 第81-93页 |
| 附表 | 第93-99页 |
| 致谢 | 第99页 |
