| 中文摘要 | 第1-12页 |
| Abstract | 第12-14页 |
| 1 前言 | 第14-37页 |
| ·生姜概述 | 第14页 |
| ·生姜的常见病害及防治方法 | 第14-18页 |
| ·生姜的常见病害 | 第14-15页 |
| ·姜瘟病介绍 | 第14-15页 |
| ·斑点病介绍 | 第15页 |
| ·茎腐病介绍 | 第15页 |
| ·防治方法 | 第15-18页 |
| ·田间农作防治 | 第15-16页 |
| ·发病后的药剂防治 | 第16页 |
| ·化学防治 | 第16-17页 |
| ·生物防治 | 第17-18页 |
| ·综合防治 | 第18页 |
| ·根际土壤微生物的研究概述 | 第18-19页 |
| ·关于生姜微生物群落研究的展望 | 第19页 |
| ·植物内生细菌 | 第19-25页 |
| ·植物内生细菌的概念 | 第19-20页 |
| ·内生细菌的分布特点 | 第20-21页 |
| ·内生细菌的多样性以及分类 | 第21-22页 |
| ·植物内生细菌的多样性 | 第21页 |
| ·植物内生细菌的分类 | 第21-22页 |
| ·植物内生细菌的生物学作用以及机制 | 第22-25页 |
| ·内生细菌的生物学作用 | 第22-23页 |
| ·内生细菌防止病害的机制 | 第23页 |
| ·植物内生细菌的侵染和定殖 | 第23-25页 |
| ·植物内生细菌的研究前景以及存在问题 | 第25页 |
| ·生姜生长过程中的分泌物 | 第25-26页 |
| ·细菌群落多样性分析的研究方法 | 第26-30页 |
| ·PCR-DGGE | 第26-28页 |
| ·聚合酶链式反应(PCR) | 第26-27页 |
| ·变性梯度凝胶电泳(DGGE) | 第27-28页 |
| ·DGGE 的优越性与局限性 | 第28-29页 |
| ·PCR-DGGE 技术在微生态研究中的应用 | 第29-30页 |
| ·T-RFLP（Terminal restriction fragment length polymorphism） | 第30-31页 |
| ·16S rDNA 文库 | 第31-34页 |
| ·内生细菌多样性的研究方法 | 第34页 |
| ·ARDRA 分析方法 | 第34-35页 |
| ·本实验的研究目的的意义 | 第35-36页 |
| ·研究内容和技术路线 | 第36-37页 |
| ·实验研究内容 | 第36页 |
| ·技术路线 | 第36-37页 |
| 2 材料和方法 | 第37-50页 |
| ·生化试剂 | 第37页 |
| ·主要仪器设备 | 第37页 |
| ·样品的采集 | 第37-38页 |
| ·土壤样品 | 第37页 |
| ·植物组织样品 | 第37-38页 |
| ·病原菌 | 第38页 |
| ·主要溶液以及培养基的制备 | 第38-41页 |
| ·培养基的配制 | 第38-40页 |
| ·牛肉膏蛋白胨培养基 | 第38页 |
| ·高氏培养基 | 第38页 |
| ·马丁培养基 | 第38-39页 |
| ·R2A 培养基 | 第39页 |
| ·PDA 培养基 | 第39-40页 |
| ·LB 培养基 | 第40页 |
| ·主要溶液的配制 | 第40-41页 |
| ·氨苄青霉素（Amp）溶液 | 第40页 |
| ·X-Gal 贮液 | 第40页 |
| ·IAA 鉴定和定量试剂 | 第40页 |
| ·DNA 提取试剂 | 第40-41页 |
| ·琼脂糖凝胶电泳试剂: | 第41页 |
| ·鲜姜汁的制备 | 第41页 |
| ·PCR 引物 | 第41页 |
| ·样品理化指标的测定 | 第41-42页 |
| ·土壤样品总 DNA 提取以及 16S rDNA 的扩增 | 第42页 |
| ·样品总 DNA 的提取 | 第42页 |
| ·16S rDNA 的 PCR 扩增体系以及条件 | 第42页 |
| ·PCR 产物的纯化 | 第42页 |
| ·T-RFLP 分析 | 第42-43页 |
| ·荧光 PCR 产物的限制性酶切 | 第42-43页 |
| ·酶切产物的基因扫描 | 第43页 |
| ·构建 16S rDNA 文库 | 第43-45页 |
| ·PCR 产物的连接 | 第43页 |
| ·E. coli DH5α感受态细胞的制备（CaCl2法） | 第43-44页 |
| ·转化 | 第44页 |
| ·阳性克隆的筛选 | 第44页 |
| ·ARDRA 分型 | 第44-45页 |
| ·内生细菌多样性分析 | 第45-46页 |
| ·植株的表面消毒 | 第45页 |
| ·内生细菌的分离和纯化 | 第45页 |
| ·内生细菌 DNA 基因组的提取 | 第45-46页 |
| ·IAA 产生菌的筛选和定量分析 | 第46页 |
| ·ARDRA 分型 | 第46页 |
| ·拮抗菌的筛选 | 第46-47页 |
| ·鲜姜汁的抑菌试验 | 第47页 |
| ·数据分析 | 第47-49页 |
| ·细菌群落多样性分析 | 第47页 |
| ·去趋势对应分析（DCA） | 第47-48页 |
| ·16S rDNA 文库分析 | 第48-49页 |
| ·序列分析 | 第48页 |
| ·文库统计数据分析 | 第48-49页 |
| ·核苷酸序列登录号 | 第49-50页 |
| 3 结果与分析 | 第50-79页 |
| ·熏蒸剂对根际土壤样品中可培养微生物的影响 | 第50-51页 |
| ·熏蒸剂对根际土壤细菌的影响 | 第50页 |
| ·熏蒸剂对根际土壤放线菌的影响 | 第50页 |
| ·熏蒸剂对根际土壤真菌的影响 | 第50-51页 |
| ·T-RFLP 分析 | 第51-55页 |
| ·样品的 T-RFLP 图谱分析 | 第51-52页 |
| ·多样性指数分析 | 第52-53页 |
| ·T-RFLP 图谱中主要片段的定性分析 | 第53-55页 |
| ·16S rDNA 克隆文库分析 | 第55-59页 |
| ·文库的构建 | 第55-56页 |
| ·阳性克隆子的验证 | 第55页 |
| ·16S rDNA 扩增片段的 ARDRA 分型 | 第55-56页 |
| ·嵌合体检测以及库容的估算 | 第56页 |
| ·基于 16S rDNA 克隆文库的细菌多样性分析 | 第56-59页 |
| ·生姜根际细菌群落结构分析 | 第56-58页 |
| ·细菌多样性指数分析 | 第58-59页 |
| ·生姜根际土壤环境特征 | 第59-66页 |
| ·有机质含量变化趋势 | 第59-60页 |
| ·腐殖质含量变化趋势 | 第60-61页 |
| ·铵态氮的含量变化趋势 | 第61页 |
| ·硝态氮的含量变化趋势 | 第61-62页 |
| ·速效磷的含量变化趋势 | 第62页 |
| ·速效钾的含量变化趋势 | 第62-63页 |
| ·微量元素铁的变化趋势 | 第63-64页 |
| ·微量元素锰的含量变化趋势 | 第64-65页 |
| ·微量元素锌的含量变化趋势 | 第65页 |
| ·微量元素铜的含量变化趋势 | 第65-66页 |
| ·细菌群落与环境因子之间的关系（RDA 分析） | 第66-67页 |
| ·内生细菌多样性分析 | 第67-76页 |
| ·内生细菌的数量 | 第67-68页 |
| ·内生拮抗细菌的筛选 | 第68-69页 |
| ·产吲哚乙酸（IAA）内生细菌的筛选 | 第69-71页 |
| ·内生细菌 IAA 产生能力检测 | 第69页 |
| ·吲哚乙酸定量分析 | 第69-71页 |
| ·生姜有益内生细菌的多样性分析 | 第71-75页 |
| ·16S rDNA 的 PCR 扩增 | 第71页 |
| ·PCR 扩增产物限制性内切酶酶切图谱 | 第71页 |
| ·生姜有益内生细菌的聚类分析 | 第71-75页 |
| ·鲜姜汁抑菌效果的检测 | 第75-76页 |
| ·生姜根际拮抗菌的筛选以及鉴定 | 第76-79页 |
| ·生姜根际拮抗菌的筛选 | 第76-77页 |
| ·拮抗菌的 ARDRA 分析 | 第77-79页 |
| ·PCR 扩增产物限制性内切酶酶切图谱 | 第77页 |
| ·PCR 扩增产物限制性酶切图谱软件分析 | 第77-78页 |
| ·拮抗菌的 16S rDNA 序列及系统发育分析 | 第78-79页 |
| 4 讨论 | 第79-84页 |
| 5 结论 | 第84-86页 |
| 参考文献 | 第86-93页 |
| 附录 | 第93-105页 |
| 致谢 | 第105页 |
