| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 目录 | 第7-9页 |
| 第1章 绪论 | 第9-15页 |
| ·蛋白质及蛋白质结构 | 第9-11页 |
| ·蛋白质 | 第9-10页 |
| ·蛋白质结构 | 第10-11页 |
| ·课题研究背景和意义 | 第11-13页 |
| ·蛋白质结构比对存在的问题 | 第13-14页 |
| ·本文主要工作及组织结构 | 第14-15页 |
| ·本文主要工作内容 | 第14页 |
| ·本文的组织结构 | 第14-15页 |
| 第2章 蛋白质结构比对概述 | 第15-24页 |
| ·常用数据库 | 第15-16页 |
| ·PDB 数据库 | 第15页 |
| ·SCOP 数据库 | 第15-16页 |
| ·DSSP 数据库 | 第16页 |
| ·HOMSTRAD 数据库 | 第16页 |
| ·蛋白质结构比对原理 | 第16-17页 |
| ·蛋白质结构比对方法 | 第17-23页 |
| ·基于几何的比对 | 第17-19页 |
| ·基于拓扑的比对 | 第19-20页 |
| ·基于空间特征分布的比对 | 第20-23页 |
| ·本章小节 | 第23-24页 |
| 第3章 蛋白质结构比对结果的评价参数 | 第24-33页 |
| ·评价参数 | 第24-26页 |
| ·PSA‐score | 第26-29页 |
| ·PSA‐score 有效性 | 第29-32页 |
| ·本章小结 | 第32-33页 |
| 第4章 基于曲线匹配的蛋白质结构比对方法 | 第33-49页 |
| ·形状匹配概述 | 第33-35页 |
| ·形状描述子 | 第33页 |
| ·形状匹配的分类 | 第33-34页 |
| ·形状匹配的方法概述 | 第34-35页 |
| ·序列比对的动态规划算法 | 第35-38页 |
| ·序列全局比对的动态规划算法 | 第35-37页 |
| ·序列局部比对的动态规划算法 | 第37-38页 |
| ·基于曲线匹配和 PSA-score 的蛋白质结构比对方法 | 第38-48页 |
| ·蛋白质结构的曲线表示 | 第39-41页 |
| ·相似特征的选取 | 第41-42页 |
| ·最小连续匹配片段对的选取 | 第42-44页 |
| ·蛋白质结构的叠合 | 第44-46页 |
| ·对应残基的提取 | 第46-48页 |
| ·比对结果的优化 | 第48页 |
| ·本章小结 | 第48-49页 |
| 第5章 基于曲线匹配的蛋白质结构比对实现 | 第49-58页 |
| ·基于曲线匹配的蛋白质结构比对系统设计 | 第49-52页 |
| ·系统流程图 | 第49-50页 |
| ·软件界面设计 | 第50-52页 |
| ·蛋白质结构比对实验 | 第52-57页 |
| ·不同相似度的比对 | 第52-53页 |
| ·较难识别结构对的比对 | 第53-55页 |
| ·同源结构辨别能力比较 | 第55-56页 |
| ·结构比对参考库 | 第56-57页 |
| ·本章小结 | 第57-58页 |
| 第6章 总结与展望 | 第58-60页 |
| ·总结 | 第58页 |
| ·展望 | 第58-60页 |
| 参考文献 | 第60-65页 |
| 发表论文和参加科研情况说明 | 第65-66页 |
| 致谢 | 第66-67页 |