花生根结线虫病抗性相关基因的数字化表达谱分析
| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-10页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-22页 |
| ·花生概况 | 第10-12页 |
| ·植物抗病基因研究进展 | 第12-14页 |
| ·植物抗病基因克隆及分类 | 第13-14页 |
| ·植物抗病基因作用机制 | 第14页 |
| ·花生根结线虫病 | 第14-18页 |
| ·危害与分布 | 第14页 |
| ·症状 | 第14-15页 |
| ·病原 | 第15-16页 |
| ·发病因素 | 第16-17页 |
| ·抗性鉴定方法 | 第17页 |
| ·花生抗根结线虫病的分子机制 | 第17页 |
| ·抗根结线虫病材料鉴定和筛选 | 第17-18页 |
| ·数字基因表达谱 | 第18-21页 |
| ·产生背景 | 第18-19页 |
| ·主要研究方向 | 第19页 |
| ·技术路线及原理 | 第19页 |
| ·数字基因表达谱特点 | 第19-20页 |
| ·数字基因表达谱应用研究进展 | 第20-21页 |
| ·本研究目的和意义 | 第21-22页 |
| 第二章 材料与方法 | 第22-28页 |
| ·实验材料及取样方法 | 第22页 |
| ·总RNA提取 | 第22-24页 |
| ·RNA提取实验前准备 | 第22页 |
| ·使用器具 | 第22页 |
| ·试剂配制 | 第22页 |
| ·实验操作 | 第22-24页 |
| ·Tag制备 | 第24页 |
| ·测序数据分析方法 | 第24-28页 |
| ·Clean tag数据制备 | 第24页 |
| ·差异表达基因的筛选 | 第24-25页 |
| ·Gene Ontology功能显著性富集分析 | 第25-26页 |
| ·Pathway显著性富集分析 | 第26-28页 |
| 第三章 结果与分析 | 第28-50页 |
| ·接种后虫瘿数调查结果 | 第28页 |
| ·RNA质量检测 | 第28-29页 |
| ·测序质量评估 | 第29-33页 |
| ·花生cDNA文库数字基因表达谱 | 第29-31页 |
| ·测序质量评估分析 | 第31-33页 |
| ·测序饱和度分析 | 第33-34页 |
| ·Clean Tag分析 | 第34-42页 |
| ·Clean Tag拷贝数分布统计 | 第34-36页 |
| ·Clean Tag与参考基因组比对分析 | 第36-42页 |
| ·差异表达基因筛选及分析 | 第42-44页 |
| ·两个文库间两两差异表达基因的比较分析 | 第42-43页 |
| ·四个文库差异表达基因比较分析 | 第43-44页 |
| ·差异基因功能分析 | 第44-50页 |
| ·D55C和D9910I表达谱差异基因分析 | 第44-45页 |
| ·H225C和H2210I表达谱差异基因分析 | 第45-46页 |
| ·H2210I和D9910I表达谱差异基因分析 | 第46-50页 |
| 第四章 讨论与结论 | 第50-56页 |
| ·花生抗根结线虫相关基因分析 | 第50-54页 |
| ·D99和H22接种后胁迫反应 | 第50-51页 |
| ·D99和H22相关抗根结线虫蛋白表达 | 第51-52页 |
| ·根结线虫接种后代谢调节 | 第52-53页 |
| ·根结线虫接种后转运载体功能变化 | 第53-54页 |
| ·花生抗、感根结线虫数字基因表达谱分析存在的问题 | 第54-56页 |
| 参考文献 | 第56-62页 |
| 致谢 | 第62页 |
