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HMGB3和HMGB1基因与奶牛乳腺炎抗性相关功能性分子标记的研究

目录第1-7页
英文縮写第7-8页
摘要第8-10页
ABSTRACT第10-13页
文献综述第13-27页
 1 奶牛乳腺炎概况第13-15页
   ·乳腺炎的发生及危害第13页
   ·乳腺炎的治疗第13页
   ·体细胞评分在乳腺炎抗性育种中的应用第13-14页
   ·乳腺炎抗性候选基因分子标记辅助选择技术研究现状第14-15页
 2 miRNA与免疫反应第15-17页
   ·miRNA-16对炎症反应的调控第16页
   ·miRNA-181a对CD4+T细胞激活和B细胞分化的调控第16-17页
   ·miRNA-146a对先天性免疫反应的负调控第17页
   ·miRNA-223参与调控中性粒细胞的增殖与激活第17页
 3 本研究中生物信息学的应用概述第17-20页
   ·启动子序列的预测第17-18页
   ·转录因子的预测第18页
   ·CpG岛的预测第18页
   ·miRNA靶基因预测第18-20页
 4 HMGB3和HMGB1基因研究进展第20-22页
   ·HMGB蛋白家族简介第20-21页
   ·HMGB1基因的位置和功能第21-22页
   ·HMGB3基因的位置和功能第22页
 5 研究目的和意义第22页
 参考文献第22-27页
试验研究第27-77页
 实验1 HMGB3基因及其剪接体在奶牛体组织中的表达分析第27-39页
  摘要第27-28页
  1 材料与方法第28-31页
   ·试验材料第28页
   ·仪器设备第28页
   ·奶牛组织样品总RNA提取和cDNA合成第28页
   ·用于RT-PCR和Q-PCR反应的引物设计第28-29页
   ·RT-PCR第29页
   ·Q-PCR第29-31页
   ·数据统计第31页
  2 试验结果第31-34页
   ·奶牛各组织中RNA的提取第31-32页
   ·标准曲线的生成第32页
   ·组织样品中HMGB3基因的扩增第32-33页
   ·基因的熔解曲线第33页
   ·基因表达结果分析第33-34页
  3 讨论第34-35页
  4 本章小结第35页
  参考文献第35-37页
  ABSTRACT第37-39页
 实验2 奶牛HMGB3基因启动子活性分析与功能性SNP鉴定第39-55页
  摘要第39-40页
  1 材料与方法第40-45页
   ·试验动物第40页
   ·血液DNA的提取第40页
   ·HMGB3基因生物信息学分析第40-41页
   ·HMGB3基因启动子区序列真核表达载体的构建及SNPs的筛选第41-42页
   ·瞬时转染及荧光分析第42-44页
   ·启动子核心序列的定位第44页
   ·对牛的SNP(g.+2690 C>T)位点进行基因分型第44-45页
   ·数据处理及分析第45页
  2 试验结果第45-51页
   ·启动子的生物信息学分析及SNP的鉴定第45-48页
   ·重组质粒鉴定结果第48页
   ·239T细胞转染前后的变化第48页
   ·HMGB3基因启动子活性分析第48-49页
   ·SNP(g.+2690 C>T)对启动子活性的影响第49-50页
   ·基因分型及数据统计分析第50-51页
  3 讨论第51-52页
  4 本章小结第52-53页
  参考文献第53-54页
  ABSTRACT第54-55页
 实验3 奶牛HMGB3基因靶标miRNAs的表达分析第55-63页
  摘要第55-56页
  1 材料与方法第56-57页
   ·试验材料及仪器设备第56页
   ·乳腺组织样品总RNA的提取及cDNA的合成第56页
   ·生物信息学分析HMGB3基因3’UTR靶标miRNAs第56页
   ·Q-PCR方法进行miRNAs定量第56-57页
   ·数据处理及分析第57页
  2 试验结果第57-58页
   ·生物信息学预测结果第57-58页
   ·乳腺组织靶标miRNAs表达量分析第58页
  3 讨论第58页
  4 本章小结第58-59页
  参考文献第59-61页
  ABSTRACT第61-63页
 实验4 奶牛HMGB1基因靶标miRNA表达分析及SNP功能研究第63-77页
  摘要第63-64页
  1 材料与方法第64-67页
   ·乳腺组织样品总RNA的提取及cDNA的合成第64页
   ·试验动物第64页
   ·试验方法第64-67页
   ·数据处理及分析第67页
  2 试验结果第67-72页
   ·SNP的发现及生物信息学分析第67-68页
   ·HMGB1基因mRNA和bta-miR-223在乳腺组织中的表达第68页
   ·重组质粒鉴定结果第68-69页
   ·荧光分析第69-70页
   ·HMGB1基因多态性分析结果第70-72页
  3 讨论第72页
  4 本章小结第72-73页
  参考文献第73-75页
  ABSTRACT第75-77页
全文结论第77-79页
附录第79-83页
致谢第83-85页
作者简介第85-87页
攻读硕士期间发表的论文第87页

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