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牛Angptl3基因组织表达、多态性及其与生长性状关联分析

致谢第1-9页
中文摘要第9-10页
1 文献综述第10-21页
   ·主要黄牛品种介绍第10-12页
     ·南阳牛第10-11页
     ·郏县红牛第11页
     ·鲁西牛第11页
     ·秦川牛第11-12页
   ·分子遗传标记及其在肉牛育种中的应用第12-15页
     ·单核苷酸多态性标记——SNP第12-13页
     ·随机引物扩增多态性标记——RAPD第13页
     ·限制性片段长度多态性标记 ——RFLP第13页
     ·扩增片段长度多态性——AFLP第13-14页
     ·微卫星 DNA 标记——SSR第14页
     ·分子标记在肉牛育种中的应用第14-15页
   ·荧光定量 PCR 技术研究进展及应用第15-17页
     ·荧光定量 PCR 技术的原理第15页
     ·荧光定量 PCR 主要检测方法及其特点第15-17页
     ·荧光定量 PCR 的定量方法第17页
     ·实时荧光定量 PCR 的应用第17页
   ·Angptl3 基因研究进展第17-21页
     ·Angptl3 基因的发现和定位第17-18页
     ·Angptl3 蛋白的结构域特点第18页
     ·Angptl3 主要生物学功能第18-20页
     ·Angptl3 基因多态性与表达研究概况第20-21页
2 引言第21-22页
3 材料与方法第22-28页
   ·试验材料第22页
     ·试验动物第22页
     ·生产数据第22页
   ·主要仪器设备与试剂第22页
   ·试验方法第22-27页
     ·总 RNA 提取第22页
     ·牛血样全基因组 DNA 提取第22-23页
     ·RNA 浓度和质量测定第23页
     ·提取的 DNA 质量检测第23页
     ·cDNA 合成第23-24页
     ·构建 DNA 池第24页
     ·引物设计与合成第24-25页
     ·引物的稀释第25页
     ·PCR 反应条件优化及扩增第25-26页
     ·DNA 池测序‐多态位点检测第26-27页
     ·多态位点的 PCR‐RFLP 及 PCR‐SSCP 分析第27页
     ·测序第27页
   ·试验结果的统计分析第27-28页
   ·生物信息学分析第28页
4 结果与分析第28-47页
   ·郏县红牛 Angptl3 基因组织表达谱分析第28-29页
   ·牛血样基因组 DNA 样品的检测第29页
   ·Angptl3 基因多态性检测第29-35页
     ·Angptl3 基因各基因座 PCR 产物琼脂糖凝胶电泳检测第29-30页
     ·Angptl3 基因各基因座 DNA 池扩增后的测序结果第30-31页
     ·Angptl3 基因 g.104 A>T 位点的 PCR‐SSCP 分析第31-32页
     ·Angptl3 基因 g.509 A > G 位点 Hinf I 酶切分析第32-34页
     ·Angptl3 基因 g.8661 T > C 位点的 PCR‐SSCP 分析第34-35页
   ·牛 Angptl3 基因遗传结构分析及其多态性与生长性状的关联分析第35-43页
     ·Angptl3 基因 g.104 A > T 位点的遗传分析第35-36页
     ·Angptl3 基因 g.104 A > T 位点多态性与牛体尺性状的相关性分析第36-38页
     ·Angptl3 基因 g.509 A > G 位点的遗传分析第38页
     ·Angptl3 基因 g.509 A > G 位点多态性与牛体尺性状的相关性分析第38-39页
     ·Angptl3 基因 g.8661 T > C 位点的遗传分析第39-40页
     ·Angptl3 基因 g.8661 T > C 位点多态性与牛体尺性状的相关性分析第40-41页
     ·黄牛 Angptl3 基因 g.104 A > T、 g.509 A > G 和 g.8661 T > C 多态位点的连锁分析第41页
     ·黄牛 Angptl3 基因多态位点的单倍型分析第41-42页
     ·黄牛 Angptl3 基因多态位点的组合效应分析第42-43页
   ·牛 Angptl3 基因的生物信息学分析第43-47页
     ·牛 Angptl3 基因序列特征分析第43页
     ·牛 Angptl3 蛋白的氨基酸基本分析及理化性质第43页
     ·牛 Angptl3 蛋白的疏水区第43-44页
     ·牛 Angptl3 蛋白的二级和三级结构预测第44-45页
     ·牛 Angptl3 蛋白的跨膜区和信号肽分析第45-46页
     ·牛 Angptl3 蛋白的亚细胞定位预测第46页
     ·同源性分析第46-47页
5 讨论与结论第47-50页
   ·讨论第47-49页
     ·组织表达谱的分析第47页
     ·牛 Angptl3 基因遗传变异位点的分析第47页
     ·牛 Angptl3 基因多态位点的群体遗传学分析第47-48页
     ·牛 Angptl3 基因多态位点间的连锁不平衡分析第48页
     ·牛 Angptl3 基因单倍型在不同品种间的分布差异第48页
     ·牛 Angptl3 基因的遗传效应分析第48-49页
   ·结论第49-50页
参考文献第50-54页
英文摘要第54-56页
附录第56-63页
作者简介第63页

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