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大豆逆境胁迫相关microRNA的发掘与验证

摘要第1-7页
Abstract第7-12页
第一章 绪论第12-30页
   ·miRNA的发现、合成与作用方式第12-20页
     ·miRNA的发现第12-14页
     ·miRNA的生物合成第14-17页
     ·miRNA的作用机制第17-20页
   ·植物miRNA的功能第20-26页
     ·调控植物生长发育第21-24页
     ·调控植物逆境胁迫第24-25页
     ·调控植物miRNA自身代谢第25页
     ·对动物生理功能的影响第25页
     ·miRNA~*的功能第25-26页
   ·miRNA的研究方法第26-29页
     ·植物miRNA的获得第26页
     ·miRNA生物信息学分析第26-27页
     ·miRNA的实验验证第27页
     ·miRNA靶基因的获得第27-28页
     ·miRNA靶基因的验证第28-29页
   ·本研究的意义和目的第29-30页
第二章 大豆逆境胁迫下小分子RNA的高通量测序分析第30-42页
 摘要第30页
   ·前言第30-31页
   ·材料与方法第31-32页
     ·实验材料与处理方法第31页
     ·实验方法第31-32页
   ·结果与分析第32-41页
     ·小分子RNA文库Solexa测序数据分析第32-33页
     ·已知miRNA第33-34页
     ·新miRNA第34页
     ·小分子RNA在pre-miRNA上的分布第34-39页
     ·新miRNA靶基因预测第39页
     ·逆境胁迫应答miRNA的芯片筛选第39-41页
   ·讨论第41-42页
     ·大豆miRNA的数量第41页
     ·文库中获得已知miRNA家族较少的原因第41-42页
第三章 受干旱诱导的大豆miR2118及其靶基因验证第42-51页
 摘要第42页
   ·前言第42-43页
   ·材料与方法第43-45页
     ·实验材料与处理方法第43页
     ·实验方法第43-45页
   ·结果与分析第45-48页
     ·miR2118前体结构及位置第45-46页
     ·miR2118受干旱胁迫诱导表达第46-47页
     ·miR2118靶基因5'RACE验证及预测第47-48页
   ·讨论第48-51页
     ·miR2118可能是外显子miRNA第48页
     ·miR2118靶基因的多样性第48-49页
     ·miR2118的功能第49-51页
第四章 大豆miR1511/1511~*共同调控Gmrpl4a基因第51-62页
 摘要第51页
   ·前言第51-52页
   ·材料与方法第52-54页
     ·实验材料与处理方法第52页
     ·实验方法第52-54页
   ·结果第54-60页
     ·pre-miR1511结构及其在大豆基因组中的定位第54-55页
     ·miR1511与miR1511~*的靶基因切割位点分析第55-56页
     ·miR1511/miR1511~*及其靶基因在不同组织中的协同表达分析第56-57页
     ·miR1511的等位变异分布特点分析第57-60页
   ·讨论第60-62页
     ·miR1511~*的发现证明了miR1511确为miRNA第60页
     ·miR1511的功能第60-61页
     ·miRNA~*与miRNA共同切割Gmrpl4a第61-62页
第五章 结论第62-64页
   ·大豆小分子RNA混合文库的高通量测序及分析第62页
   ·miRNA芯片筛选逆境胁迫应答miRNA第62页
   ·miR2118受干旱诱导上调表达且至少调控4类靶基因第62页
   ·miR1511/1511~*共同切割Gmrpl4a基因第62-63页
   ·miR1511的等位变异的分布具有规律性第63-64页
参考文献第64-81页
附录第81-108页
致谢第108-109页
作者简历第109页

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