| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-12页 |
| 引言 | 第12-18页 |
| 一、生物絮团技术的应用 | 第12-13页 |
| 二、鱼类肠道菌群的研究概况 | 第13-14页 |
| 三、PCR-DGGE技术的应用 | 第14-15页 |
| 四、问题及展望 | 第15-16页 |
| 五、本文研究的目的意义和主要内容 | 第16-18页 |
| 1、研究目的和意义 | 第16-17页 |
| 2、研究的主要内容 | 第17-18页 |
| 第一章 生物絮团不同形成阶段的微生物群落结构分析 | 第18-31页 |
| ·材料和方法 | 第18-22页 |
| ·生物絮团培养及收集 | 第18页 |
| ·菌种和质粒 | 第18页 |
| ·仪器和试剂 | 第18-19页 |
| ·溶液 | 第19-20页 |
| ·样品基因组总DNA的提取和测定 | 第20页 |
| ·16S-rRNA基因PCR扩增 | 第20页 |
| ·变性梯度凝胶电泳DGGE | 第20-22页 |
| ·目的条带切胶回收与克隆测序及种系发生树构建 | 第22页 |
| ·结果与分析 | 第22-28页 |
| ·基因组DNA的提取和PCR扩增 | 第22-23页 |
| ·DGGE指纹图谱及分析结果 | 第23-25页 |
| ·DGGE目的条带基因片段的切割克隆、测序及序列比对结果分析 | 第25-28页 |
| ·讨论 | 第28-31页 |
| ·生物絮团中细菌种类丰富度特征 | 第28页 |
| ·生物絮团共生菌种属鉴定 | 第28-29页 |
| ·生物絮团的不同阶段特异菌分析鉴定 | 第29-30页 |
| ·生物絮团功能微生物的群感效应（QuorumSensing） | 第30-31页 |
| 第二章 基于PCR-DGGE技术研究生物絮团对草鱼肠道菌群影响 | 第31-40页 |
| ·材料和方法 | 第31-32页 |
| ·样品准备 | 第31页 |
| ·菌种和质粒 | 第31页 |
| ·仪器和试剂 | 第31-32页 |
| ·溶液 | 第32页 |
| ·样品基因组总DNA的提取和测定 | 第32页 |
| ·16SrRNA基因PCR扩增 | 第32页 |
| ·变性梯度凝胶电泳DGGE | 第32页 |
| ·目的条带切胶回收与克隆测序及种系发生树构建 | 第32页 |
| ·结果与分析 | 第32-37页 |
| ·基因组DNA的提取和PCR扩增 | 第32-33页 |
| ·DGGE指纹图谱及分析结果 | 第33-35页 |
| ·DGGE目的条带基因片段的切割克隆、测序及序列比对结果分析 | 第35-37页 |
| ·讨论 | 第37-40页 |
| 第三章 基于PCR-DGGE技术研究生物絮团对鳙肠道菌群影响 | 第40-50页 |
| ·材料和方法 | 第40-41页 |
| ·样品准备 | 第40-41页 |
| ·菌种和质粒 | 第41页 |
| ·仪器和试剂 | 第41页 |
| ·溶液 | 第41页 |
| ·样品基因组总DNA的提取和测定 | 第41页 |
| ·16S-rRNA基因PCR扩增 | 第41页 |
| ·变性梯度凝胶电泳DGGE | 第41页 |
| ·目的条带切胶回收与克隆测序及种系发生树构建 | 第41页 |
| ·结果与分析 | 第41-47页 |
| ·基因组DNA的提取和PCR扩增 | 第41-42页 |
| ·DGGE指纹图谱及分析结果 | 第42-44页 |
| ·DGGE目的条带基因片段的切割克隆、测序及序列比对结果分析 | 第44-47页 |
| ·讨论 | 第47-50页 |
| 全文总结 | 第50-51页 |
| 参考文献 | 第51-61页 |
| 附录1 缩略词表 | 第61-62页 |
| 附录2 论文发表情况 | 第62-63页 |
| 致谢 | 第63页 |
