| 摘要 | 第1-13页 |
| ABSTRACT | 第13-16页 |
| 引言 | 第16-32页 |
| 一 论文选题的初衷：以生物学哲学发展的历史为参照 | 第17-21页 |
| 二 论文选题的意义：以生物学哲学的学科性质为背景 | 第21-25页 |
| 三 论文研究的路线图 | 第25-29页 |
| 四 论文的研究创新以及不足之处 | 第29-32页 |
| 第一章 适应——生物学理论语境依赖性的根源 | 第32-74页 |
| ·适应的概念分析 | 第32-39页 |
| ·作为形而上学纲领的适应 | 第32-33页 |
| ·新拉马克主义的适应论 | 第33-35页 |
| ·自然选择中的适应 | 第35-39页 |
| ·适应背后的“目标指向性系统” | 第39-51页 |
| ·目标指向性 | 第40-43页 |
| ·作为适应概念语境化产物的功能 | 第43-47页 |
| ·作为事实的适应与目标指向性系统中的“设计” | 第47-51页 |
| ·作为适应归因方法的功能理论 | 第51-72页 |
| ·功能的定义与功能理论 | 第52-56页 |
| ·特征类型的特化形式 | 第56-59页 |
| ·模态的功能理论 | 第59-65页 |
| ·功能理论的出路,自然主义或投射主义? | 第65-72页 |
| 本章小结 | 第72-74页 |
| 第二章 适应的语境化——从群体到行为再到微观机制的说明模型 | 第74-132页 |
| ·群体遗传学的数学模型及其理论的多元性 | 第74-96页 |
| ·遗传学的数学化与生物学统计学派 | 第76-78页 |
| ·自然选择的遗传理论及其数学模型 | 第78-82页 |
| ·动态平衡理论 | 第82-86页 |
| ·理论的多元性 | 第86-96页 |
| ·生物学中的博弈理论 | 第96-117页 |
| ·进化博弈论的起源及其分析特征 | 第97-102页 |
| ·进化博弈理论的两种途径 | 第102-108页 |
| ·引入合作模型证明利他性的产生 | 第108-113页 |
| ·博弈理论语境化过程中的挑战 | 第113-117页 |
| ·作为生物学理论合理性基础的机制说明 | 第117-131页 |
| ·生物学机制解释的历史背景 | 第118-119页 |
| ·机制说明中的实体论与存在论 | 第119-123页 |
| ·作为原因的生物学机制说明及其本体论性 | 第123-131页 |
| 本章小结 | 第131-132页 |
| 第三章 多重语境中的自然选择 | 第132-170页 |
| ·自然选择的概念溯源及其动力学特征 | 第132-138页 |
| ·达尔文表述的“选择” | 第132-134页 |
| ·自然选择选择的是什么? | 第134-135页 |
| ·自然选择是一种力吗? | 第135-137页 |
| ·作为原因的自然选择 | 第137-138页 |
| ·自然选择的本质 | 第138-158页 |
| ·自然选择最初的经验主义与理性主义论证 | 第138-139页 |
| ·自然选择解释了什么 | 第139-143页 |
| ·进化理论的决定论与非决定论之争 | 第143-152页 |
| ·量子扰动与突变本质 | 第152-158页 |
| ·围绕进化理论的工具主义与实在论 | 第158-168页 |
| ·工具主义的立场与缺陷 | 第159-162页 |
| ·实在论的立场与缺陷 | 第162-164页 |
| ·一种中间道路 | 第164-168页 |
| 本章小结 | 第168-170页 |
| 第四章 生物学理论的语境困境 | 第170-216页 |
| ·生物学理论基础的语义分析 | 第170-188页 |
| ·围绕生物学理论表征基础的讨论 | 第170-173页 |
| ·生物学理论形式化特征的语义分析 | 第173-180页 |
| ·围绕基因中心论的生物学理论化困境 | 第180-186页 |
| ·生物学理论的语义结构特征 | 第186-188页 |
| ·遗传与还原难题的语境解读 | 第188-201页 |
| ·遗传问题的概念还原困境 | 第188-193页 |
| ·遗传还原问题的语境重建 | 第193-196页 |
| ·启发性的语境关联 | 第196-199页 |
| ·面向后实证主义的遗传还原问题 | 第199-201页 |
| ·生物学理论语境化的两种新路径 | 第201-214页 |
| ·现代综合进化理论之后的概念重构 | 第202-206页 |
| ·新的语境化基础：信息与发育系统 | 第206-209页 |
| ·两种语境化途径的分析 | 第209-214页 |
| 本章小结 | 第214-216页 |
| 第五章 生物学理论的语境性及其结构 | 第216-240页 |
| ·生物学理论的语境性 | 第216-225页 |
| ·从“同源”概念看进化解释的语境依赖 | 第217-221页 |
| ·语境综合的进化解释 | 第221-225页 |
| ·生物学理论的不完备性及其结构的相似性 | 第225-238页 |
| ·理论的不完备性 | 第226-228页 |
| ·生物学理论中的泛原因机制——达尔文主义范式 | 第228-231页 |
| ·生物学理论的结构 | 第231-238页 |
| 本章小结 | 第238-240页 |
| 结束语：语境论的生物学理论结构观 | 第240-246页 |
| 参考文献 | 第246-257页 |
| 攻读学位期间取得的成果 | 第257-258页 |
| 致谢 | 第258-259页 |
| 个人简况及联系方式 | 第259-261页 |