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水稻白叶枯病菌Tdrxoo/GacAxoo调控系统的鉴定及其对运动性和毒性调控功能的分析

摘要第1-6页
Abstract第6-15页
第一章 绪论第15-42页
   ·植物—病原细菌的相互作用第15-22页
     ·致病因子第15-19页
     ·植物病原细菌的早期侵染事件第19-20页
     ·植物病原细菌致病因子的调控机制第20-22页
   ·致病相关基因的突变方法第22-24页
     ·诱变第22-23页
     ·标记置换(Marker Exchange)第23-24页
     ·基因的转移第24页
   ·酵母双杂交系统的发展及应用第24-26页
   ·水稻白叶枯病菌致病性的分子机理第26-36页
     ·Xoo基因组的总体特征第27-28页
     ·Xoo与Xac和Xcc的全基因组序列比较第28页
     ·活动组分第28-29页
     ·代谢特征和RM系统第29页
     ·致病相关基因第29-36页
   ·GacS/GacA双组分调控系统及其调控机理第36-41页
     ·GacS/GacA双组分调控系统的定义第37页
     ·GacS/GacA双组分调控系统的结构特征第37-38页
     ·GacS/GacA同源物中的保守结构域第38-39页
     ·GacS/GacA双组分调控系统模型及其相关联因子的研究第39页
     ·GacS/GacA双组分调控系统在植物—病原物互作中的调控研究第39-41页
   ·本研究的目的意义和技术路线第41-42页
     ·研究目的和意义第41页
     ·技术路线第41-42页
第二章 水稻白叶枯病菌gacAxoo基因的功能分析第42-62页
   ·实验材料第43-44页
     ·菌株和质粒第43页
     ·生化试剂第43页
     ·培养基和菌株培养条件第43-44页
   ·实验方法第44-51页
     ·Xoo基因组DNA的制备第44-45页
     ·gacAxoo基因的扩增第45-46页
     ·gacAxoo基因纯化第46页
     ·gacAxoo基因的连接与转化第46-48页
     ·质粒DNA的提取第48页
     ·标记置换法构建△gacAxoo突变体第48-49页
     ·构建gacAxoo突变体的互补菌株第49-50页
     ·△gacAxoo突变体致病性测试和过敏性反应(HR)分析第50页
     ·△gacAxoo突变体运动性(motility)检测第50页
     ·△gacAxoo突变体胞外酶活性的检测第50页
     ·gacAxoo序列的生物信息学分析第50-51页
   ·结果与分析第51-59页
     ·gacAxoo基因克隆第51页
     ·gacAxoo生物信息学分析第51-55页
     ·构建△gacAxoo突变体菌株第55-56页
     ·△gacAxoo基因突变体的互补分析第56-57页
     ·△gacAxoo突变体HR诱导能力和致病性测试第57-58页
     ·△gacAxoo突变体运动性分析第58-59页
     ·△gacAxoo突变体胞外酶活性分析第59页
   ·讨论第59-62页
第三章 酵母双杂交系统分析与GacAXoo互作的相关蛋白第62-77页
   ·实验材料第63-65页
     ·菌株和质粒第63-64页
     ·生化试剂第64页
     ·培养基和培养条件第64页
     ·酵母菌株的活化第64-65页
   ·实验方法第65-71页
     ·制备双酶切诱饵载体pGBKT7第65页
     ·制备gacAxoo诱饵质粒第65-66页
     ·Xoo总RNA提取第66页
     ·RNA样品中残余DNA去除第66-67页
     ·cDNA文库的构建第67-68页
     ·酵母菌株感受态细胞的制备第68-69页
     ·诱饵载体和捕获文库共转化酵母第69页
     ·超声波法提取质粒DNA第69-70页
     ·质粒DNA的扩增第70页
     ·互作蛋白的再次验证第70-71页
     ·阳性克隆质粒DNA序列分析第71页
   ·结果与分析第71-74页
     ·gacAxoo诱饵载体的制备第71-72页
     ·提取和纯化Xoo总RNA第72页
     ·合成和纯化双链cDNA第72页
     ·诱饵载体pGBKT7-gacAxoo和Xoo捕获文库的互作分析第72-74页
     ·GacAxoo与Tdrxoo互作的再验证第74页
   ·讨论第74-77页
第四章 水稻白叶枯病菌tdrxoo基因的功能分析第77-95页
   ·实验材料第77-78页
     ·菌株和质粒第77-78页
     ·生化试剂第78页
     ·培养基和菌株培养条件第78页
   ·实验方法第78-81页
     ·△tdrxoo突变体质粒制备第78页
     ·△tdrxoo基因突变体构建第78-79页
     ·△tdrxoo突变体的互补菌株构建第79页
     ·△gacAxoo/△tdrxoo双基因突变菌株构建第79页
     ·致病性和HR反应测定第79页
     ·运动性测定第79页
     ·胞外多糖分泌检测第79页
     ·胞外酶类活性测定第79-80页
     ·生长曲线测定第80页
     ·嗜铁素(siderophore)产生的检测第80页
     ·△tdrxoo和△gacAxoo/△tdrxoo鞭毛电镜观察第80页
     ·生物被膜(Biofilm)的定性检测第80页
     ·tdrxoo基因的生物信息学分析第80页
     ·革兰氏阴性细菌中TDR类基因分析第80-81页
   ·结果与分析第81-91页
     ·△tdrxoo的制备第81-82页
     ·△tdrxoo互补菌株的制备第82页
     ·△gacAxoo/△tdrxoo双基因突变菌株的构建第82-83页
     ·突变体致病性和HR反应分析第83-84页
     ·胞外多糖分泌检测第84页
     ·突变体菌株运动性分析和鞭毛的电镜观察第84-85页
     ·突变体菌株胞外酶分析第85页
     ·嗜铁素产生的检测第85页
     ·生长曲线的测定第85-86页
     ·Biofilm形成分析第86页
     ·tdrxoo基因的生物信息学分析第86-90页
     ·tdr基因分析第90-91页
   ·讨论第91-95页
第五章 全文结论第95-97页
参考文献第97-116页
附录第116-117页
致谢第117-118页
作者简历第118页

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