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动物粪便放线菌多样性及生物活性研究

摘要第1-8页
ABSTRACT第8-14页
第一章 文献综述及选题依据第14-28页
   ·动物肠道微生物概述第14-16页
   ·动物肠道微生物的研究现状第16-20页
     ·纯培养研究第16-18页
     ·免培养研究第18-20页
   ·动物肠道放线菌的研究现状第20-23页
   ·肠道放线菌与宿主动物的关系第23-24页
   ·肠道放线菌的应用价值第24-25页
   ·动物肠道放线菌研究存在的问题与展望第25-26页
   ·本研究的目的意义及思路第26-28页
第二章 基于 454 焦磷酸测序技术研究 7 种动物粪便细菌多样性第28-41页
   ·材料与方法第28-34页
     ·实验样品信息第28页
     ·实验样品采集第28页
     ·粪便样品 DNA 的提取第28-29页
     ·16S rRNA 基因的 PCR 扩增第29-30页
     ·454 测序原理第30-31页
     ·16S rRNA 基因的 454 测序第31页
     ·各样点序列的分离及低质序列去除第31-32页
     ·RDP-Classifer 分析第32页
     ·序列的系统发育分析第32-33页
     ·454 序列的多样性评价第33页
     ·Fast UniFrac 分析第33-34页
     ·各动物粪便放线菌群落结构的比较分析第34页
   ·结果与讨论第34-39页
     ·粪便 DNA 的提取第34页
     ·454 序列信息的预处理第34-35页
     ·454 测序方法的可靠性及重复性检验第35-36页
     ·454 序列的多样性评价第36-37页
     ·动物粪便菌群多样性组成第37-39页
   ·总结第39-41页
第三章 动物粪便放线菌的分离及多样性分析第41-61页
   ·动物粪便放线菌分离方法的探索第41-51页
     ·材料与方法第41-44页
     ·结果和分析第44-50页
     ·总结第50-51页
   ·28 种动物纯培养粪便放线菌的多样性分析第51-61页
     ·材料与方法第51-53页
     ·结果和分析第53-60页
     ·本章小结第60-61页
第四章 潜在新分类单元的多相分类第61-79页
   ·材料与方法第61-71页
     ·实验菌株第61页
     ·形态和培养特征第61-62页
     ·生理生化特征第62-63页
     ·化学分类特征第63-71页
     ·分子分类第71页
   ·结果分析第71-78页
     ·菌株 YIM 100590 的形态和培养特征第72页
     ·菌株 YIM 100590 的生理生化实验结果第72-73页
     ·菌株 YIM 100590 的化学分类特征第73-75页
     ·菌株 YIM 100590 的分子分析结果第75-78页
   ·本章小结第78-79页
第五章 粪便放线菌的生物活性第79-91页
   ·材料与方法第80-82页
     ·实验菌株第80页
     ·肿瘤细胞和指示菌第80页
     ·菌株培养及发酵第80页
     ·抗肿瘤活性检测第80-81页
     ·抑菌实验第81页
     ·酶活检测第81-82页
   ·结果与讨论第82-89页
     ·粪便放线菌的抗肿瘤细胞活性第82-83页
     ·粪便放线菌的抗菌活性第83-85页
     ·粪便放线菌的酶活测定第85-88页
     ·化合物基因筛选结果第88-89页
   ·本章小结第89-91页
第六章 Streptomyces violaceoruber YIM 100525 次生代谢产物化学成分研究第91-103页
   ·YIM 100525 菌株发酵及发酵液的预处理第91-94页
     ·材料与方法第91-93页
     ·结果与讨论第93-94页
   ·Streptomyces violaceoruber YIM 100525 菌株次生代谢产物的分离第94-96页
     ·材料与方法第94-95页
     ·结果第95-96页
   ·化合物的化学结构解析第96-103页
     ·材料与方法第96页
     ·化合物的结构鉴定第96-100页
     ·本章小结第100-103页
第七章 总结与展望第103-105页
参考文献第105-116页
附录第116-131页
致谢第131-132页
作者简介第132页

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